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分子マーカーを利用したコムギ近縁種の遺伝資源としての変異の解明

研究課題

研究課題/領域番号 12460143
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物資源科学
研究機関京都大学

研究代表者

河原 太八  京都大学, 農学研究科, 助教授 (20115827)

研究分担者 森 直樹  神戸大学, 農学部, 助教授 (60230075)
安井 康夫  京都大学, 農学研究科, 助手 (70293917)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
6,800千円 (直接経費: 6,800千円)
2002年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2001年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2000年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワード遺伝資源 / コムギ / コムギ近縁野生種 / 分子マーカー / アイソザイム / AFLP / マイクロサテライト / SINE配列
研究概要

1.分析手法の確立:分子マーカとして,酵素を利用するアイソザイム,DNA断片の多型を利用するAFLP,葉緑体DNAのフィンガープリンティングについて,それぞれ分析条件の絞り込みを行なった。これをもとにそれぞれ複数の種を対象として,変異の解析を行なった。アイソザイムはコムギ近縁野生種であるAegilops属の3種で,AFLPは普通系コムギとその祖先種の二粒系コムギとタルホコムギ,葉緑体DNAでは普通系コムギと二粒系コムギに加え,二粒系コムギの母系の祖先とされるAe.speltoidesを対象とした。とくに葉緑体DNAのフィンガープリンティングでは,二粒系コムギから普通系コムギに至る母系が2つ存在することを明らかにしたほか,これまで不明であったそれらの起原地を解明するなど,多数の新知見を得た。
2.新規手法の開発:コムギ近縁種全体で利用できる新しい分子マーカーを開発するため,我々がAe.umbellulataで発見したSINE配列の解析を行なった。その結果,この配列がコムギ・エギロプス属全体のほか,それらに近縁ないくつかの属にも存在し,また普通系コムギゲノム中に約10^4コピーと多量にしかも染色体全体にわたって散在していることを明らかにした。SINE配列をマーカーとして利用する可能性が確認できたため,エギロプス属の数種およびパンコムギを材料として,クローニングとDNA配列の読み取りを行なった。その結果,SINE配列には種特異的なもの,種を超えて存在し進化の初期に増幅したと考えられるものなど様々なものがあり,分子マーカーとして有用であることを確認した。
3.野生集団の予備調査:平成13年度河原・森・安井の3名で約1ヶ月,シリア・トルコ・ギリシャで予備的調査を行なった。シリア・トルコでは各研究機関と将来の研究協力について協議し,あわせて自生地の観察を行なった。ギリシャでは,エーゲ海東部の島嶼で自生地を調査し種子の収集を行なった。平成14年度には,森がトルコでコムギの祖先野生種の分布を調査した。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (17件)

  • [文献書誌] KAWAHARA Taihachi: "Isozyme variation in species of the section Comopyrum of Aegilops"Genetic Resources and Crop Evolution. 47. 641-645 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] ISHII Takasige et al.: "Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species"Theoretical and Applied Genetics. 103. 896-904 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] YASUI Yasuo et al.: "The Au family, a novel short interspersed element (SINE) from Aegilops umbellulata"Theoretical and Applied Genetics. 102. 463-470 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] MORI Naoki et al.: "Variation in chloroplast microsatellite loci among wild and cultivated species of Emmer wheat"Proceedings of the 4th.International Triticeae Symposium. 73-76 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] KAWAHARA Taihachi: "Morphological and isozyme variation in genebank accessions of Aegilops umbellulata Zhuk., a wild relative of wheat"Genetic Resources and Crop Evolution. 49・1. 89-94 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] N-A.B.Jelodar et al.: "Transferability of hexaploid wheat (Triticum aestivum) microsatellite markers to tetraploid species (T.turgidum) carrying A and B genomes"Cereal Research Communication. (in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] KAWAHARA T.: "Isozyme variation in species of the section Comopyrym of Aegilops"Genetic Resources and Crop Evolution. 47. 641-645 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] ISHII T., MORI N. and OGIHARA Y.: "Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species"Theoretical and Applied Genetics. 103. 896-904 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] MORI N., ISHII, T., ISHIDO T., BELAY G., TAKUMI S., KAWAHARA T., OGIHARA Y. and NAKAMURA C.: "Variation in chloroplast microsatellite loci among wild and cultivated species of Emmer wheat"Prbceedings of the 4th. International Triticeae Symposium. 73-76 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] YASUI Y., NASUDA S., MATSUOKA Y and KAWAHARA T.: "The Au family, a novel short interspersed element (SINE) from Aegilops umbellulata"Theoredcal and Applied Genetics. 102. 463-470 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] KAWAHARA T.: "Morphological and isozyme variation in genebank accessions of Aegilops umbellulata Zhuk., a wild relative of wheat"Genetic Resources and Crop Evolution. 49. 89-94 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] JEORDAR, N-A B., MORI N. and NAKAMURA C.: "Transferability of hexaploid wheat (Triticum aestivum) microsatellite markers to tetraploid species (T. turgidum) carrying A and B genomes"Cereal Research Communicahon. in press.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] OGIHARA Yasunari et al.: "Structural features of a wheat plastome as revealed by complete sequence of chloroplast DNA"Molecular Genetics and Genomics. 266. 740 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] MORI Naoki et al.: "Evaluation of allelic diversity at chloroplast microsatellite loci among common wheat and its ancestral species"Theoretical and Applied Genetics. 103. 896-904 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] KAWAHARA Taihachi: "Morphological and isozyme variation in genebank accessions of Aegilops umbellulate Zhuk.,a wild relative of wheat"Genetic Resources and Crop Evolution. 49・1. 89-94 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kawahara, Taihachi: "Isozyme variation in species of the section Comopyrum of Aegilops."Genetic Resources and Crop Evolution. 47・6. 641-645 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasui,Yasuo: "The Au family, a novel short interspersed element (SINE) from Aegilops umbellulata."Theoretical and Applied Genetics. 102・4. 463-470 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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