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分枝オリゴ糖生成酵素のX線結晶構造解析とタンパク質工学

研究課題

研究課題/領域番号 12460147
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関東京農工大学

研究代表者

坂野 好幸  東京農工大学, 農学部, 教授 (70014959)

研究分担者 酒井 坦  静岡県立大学, 大学院・生活健康科学研究科, 教授 (10092214)
神鳥 成弘  東京農工大学, 工学部, 助教授 (00262246)
西河 淳  東京農工大学, 農学部, 助教授 (30218127)
殿塚 隆史  東京農工大学, 農学部, 助手 (50285194)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
14,400千円 (直接経費: 14,400千円)
2002年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2001年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2000年度: 8,000千円 (直接経費: 8,000千円)
キーワードプルラン / サイクロデキストリン / α-アミラーゼ / TVA / イソプルラナーゼ / 結晶構造解析 / パノシルパノース / 結構構造解析
研究概要

本研究では、Thermoactinomyces vulgarisの生産するTVA IおよびTVA II、およびAspergillus nigerの生産するイソプルラナーゼという特徴的な分枝オリゴ糖生成酵素を材料に、以下のような成果を得た。
1.TVA IおよびTVA IIの結晶構造解析
TVA IおよびTVA IIは、ともに多糖プルランを分解する酵素であるが、TVA Iはデンプンやプルランなどの多糖を効率的に分解するのに対し、TVA IIはオリゴ糖の分解に高い活性を示す。本研究ではTVA Iの立体構造およびTVA IIの酵素-基質複合体の構造の解析に成功した。その結果、(1)ドメインNの位置が両酵素で全く異なる、(2)TVA Iはモノマーで機能するがTVA IIは、α-アミラーゼファミリーの中で初めてのダイマーを形成する酵素である、ということを明らかにし、これらが両酵素の基質特異性の違いの主な理由であると考えられた。
2.新規グルコアミラーゼおよびサイクロデキストリン結合タンパク質の取得
T. vulgarisのオリゴ糖代謝に関与する一連のタンパク質を取得する目的で、TVA II遺伝子周辺の解析を行い、グルコアミラーゼおよびサイクロデキストリン結合タンパク質遺伝子を取得した。この結果、特にグルコアミラーゼは従来知られている酵素と異なり、デンプンのみならずオリゴ糖に対し強力な活性を示すことを明らかにした。
3.イソプルラナーゼの発現系の構築と性質の解析
酵母Pichia pastorisを宿主とした発現ベクターを構築し、本発現系で得られる酵素の精製法を確立した。さらに性質を解析することにより、酵素に付加している糖鎖がイソプルラナーゼ活性に重要な役割を担っていることを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (43件)

  • [文献書誌] K.Ichikawa, T.Tonozuka, T.Yokota, Y.Shimura, Y.Sakano: "Analysis of Catalytic Residues of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II(TVA II) by site-directed mutagenesis"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 2692-2695 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 殿塚隆史, 坂野好幸, 神鳥成弘: "プルランとサイクロデキストリンを分解するα-アミラーゼの機能と立体構造"バイオサイエンスとインダストリー. 58. 560-563 (2000)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Padmajanti, T.Tonozuka, Y.Sakano: "Deglycosyl Isopullulanase Retains Enzymatic Activity"J.Appl.Glycosci.. 47. 287-292 (2000)

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    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Ohtaki, S.Kondo, Y.Shimura, T.Tonozuka, Y.Sakano, S.Kamitori: "Role of Phe286 in the recognition mechanism of cyclomaltooligosaccharides (cyclodextrins) by Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase II (TVA II). X-ray structures of the mutant TVA IIs, F286A and F286Y, and kinetic analyses of the Phe286-replaced mutant TVA IIs"Carbohydr.Res.. 334. 309-313 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Uotsu-Tomita, T.Tonozuka, H.Sakai, Y.Sakano: "Novel glucoamylase-type enzymes from Thermoactinomyces vulgaris and Methanococcus jannaschii whose genes are found in the flanking region of the α-amylase genes"Appl.Microbiol.Biotechnol.. 56. 465-473 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 殿塚隆史, 神鳥成弘, 坂野好幸: "好熱性放線菌Thermoactinomyces vulgarisの2種類のプルラン分解α-アミラーゼの立体構造と機能"応用糖質科学. 48. 163-169 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yokota, T.Tonozuka, Y.Shimura, K.Ichikawa, S.Kamitori, Y.Sakano: "Structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II complexed with substrate analogues"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 65. 619-626 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Kondo, A.Ohtaki, T.Tonozuka, Y.Sakano, S.Kamitori: "Studies on the hydrolyzing mechanism for cyclodextrins of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II (TVA II)"J.Biochem.. 129. 423-428 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yokota, T.Tonozuka, S.Kamitori, Y.Sakano: "The Deletion of Amino-Terminal Domain in Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylases"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 65. 401-408 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yopi, T.Tonozuka, H.Sakai, Y.Sakano: "Cloning of a gene cluster for dextrin utilization from Thermoactinomyces vulgaris R-47 and characterizarion of the cyclodextrin-inding protein"J.Appl.Glycosci.. 49. 107-114 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Kamitori, A.Abe, A.Ohtaki, A.Kaji, T.Tonozuka, Y.Sakano: "Crystal Structures and Structural Comparison of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase I(TVAI) at 1.6Å Resolution and α-Amylase II (TVAII) at 2.3Å Resolution"J.Mol.Biol.. 318. 443-453 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 殿塚隆史, 坂野好幸: "多糖プルランを分解するα-アミラーゼの立体構造とダイマー形成"生化学. 74. 1162-1166 (2002)

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  • [文献書誌] T.Tonozuka, T.Yokota, K.Ichikawa, M.Mizuno, S.Kondo, A.Nishikawa, S.Kamitori, Y.Sakano: "Crystal structures and substrate specificities of two α-amylase hydrolyzing cyclodextrins and pullulan from Thermoactinomyces vulgaris R-47"Biologia, Bratislava. 57,Suppl.11. 71-76 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Akeboshi, Y.Kashiwagi, H.Aoki, T.Tonozuka, A.Nishikawa, Y.Sakano: "Construction of an Efficient Expression System for Aspergillus Isopullulanase in Pichia pastoris and a Simple Purification Method"Biosci.Biotechnol.Biochem.. (in press). (2003)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. ichikawa, T. Tonozuka, T. Yokota, Y. Shimura and Y. Sakano: "Analysis of Catalytic Residues of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α -Amylase II (TVA II) by site-directed mutagenesis"Biosci. Biotechnol. Biochem.. 64. 2692-2695 (2000)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Tonozuka, Y. Sakano and S. Kamitori: "The function and three dimensional structure of α-amylase hydrolyzing pullulan and cyclodextrins"Bioscience and Industry.. 58. 560-563 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Padmajanti, T. Tonozuka and Y. Sakano: "Deglycosyl Isopullulanase Retains Enzymatic Activity"J. Appl. Glycosci.. 47. 287-292 (2000)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Ohtaki, S. Kondo, Y. Shimura, T. Tonozuka, Y. Sakano and S. Kamitori: "Role of Phe286 in the recognition mechanism of cyclomaltooligosaccharides (cyclodextrins) by Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase II (TVA II). X-ray structures of the mutant TVA IIs, F286A and F286Y, and kinetic analyzes of the Phe286-replaced mutant TVA IIs"Carbohydr. Res.. 334. 309-313 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Uotsu-Tomita, T. Tonozuka, H. Sakai and Y. Sakano: "Novel glucoamylase-type enzymes from Thermoactinomyces vulgaris and Methanococcus jannaschii whose genes are found in the flanking region of the α -amylase genes"Appl. Microbiol. Biotechnol. 56. 465-473 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Tonozuka, S. Kamitori and Y. Sakano: "Crystal structures and functions of two pullulan-hydrolyzing α-amylases from thermophilic actinomycete, Thermoactinomyces vulgaris"J. Appl. Glycosci.. 48. 163-169 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Yokota, T. Tonozuka, Y. Shimura, K. Ichikawa, S. Kamitori and Y. Sakano: "Structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II complexed with substrate analogues"Biosci. Biotechnol. Biochem.. 65. 619-626 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Kondo, A. Ohtaki, T. Tonozuka, Y. Sakano and S. Kamitori: "Studies on the hydrolyzing mechanism for cyclodextrins of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II (TVA II)"J. Biochem.. 129. 423-428 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Yokota, T. Tonozuka, S. Kamitori and Y. Sakano: "The Deletion of Amino-Terminal Domain in Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylases"Biosci. Biotechnol. Biochem.. 65. 401-408 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yopi, T. Tonozuka, H. Sakai and Y. Sakano: "Cloning of a gene cluster for dextrin utilization from Thermoactinomyces vulgaris R-47 and characterizarion of the cyclodextrin-binding protein"J. Appl. Glycosci.. 49. 107-114 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Kamitori, A. Abe, A. Ohtaki, A. Kaji, T. Tonozuka and Y. Sakano: "Crystal Structures and Structural Comparison of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase I (TVA II) at 1.6 Å Resolution and α-Amylase II (TVA II) at 2.3 ÅResolution"J. Mol. Biol.. 318. 443-453 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Tonozuka and Y. Sakano: "Three-dimensional structures and dimerization of α-amylases hydrolyzing a polysaccharide, pullulan"Seikagaku. 74. 1162-1166 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Tonozuka, T. Yokota, K. Ichikawa, M. Mizuno, S. Kondo, A. Nishikawa, S. Kamitori and Y. Sakano: "Crystal structures and substrate specificities of two α-amylase hydrolyzing cyclodextrins and pullulan from Thermoactinomyces vulgaris R-47"Biologia. Bratislava.. 57-suppl II. 71-76 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Akeboshi, Y. Kashiwagi, H. Aoki, T. Tonozuka, A. Nishikawa and Y. Sakano: "Construction of an Efficient Expression System for Aspergillus Isopullulanase in Pichia pastoris and a Simple Purification Method"Biosci. Biotechnol. Biochem.. in press. (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yopi, T.Tonozuka, H.Sakai, Y.Sakano: "Cloning of a gene cluster for dextrin utilization from Thermoactinomyces vulgaris R-47 and characterizarion of the cyclodextrin-binding protein"J Appl.Glycosci.. 49. 107-114 (2002)

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      2002 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kamitori, A.Abe, A.Ohtaki, A.Kaji, T.Tonozuka, Y.Sakano: "Crystal Structures and Structural Comparison of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase I (TVAI) at 1.6Å Resolution and α -Amylase II (TVAII) at 2.3Å Resolution"J.Mol.Biol.. 318. 443-453 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 殿塚隆史, 坂野好幸: "多糖プルランを分解するα-アミラーゼの立体構造とダイマー形成"生化学. 74. 1162-1166 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Tonozuka, T.Yokota, K.Ichikawa, M.Mizuno, S.Kondo, A.Nishikawa, S.Kamitori, Y.Sakano: "Crystal structures and substrate specificities of two α-amylase hydrolyzing cyclodextrins and pullulan from Thermoactinomyces vulgaris R-47"Biologia, Bratislava. 57,Suppl.11. 71-76 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] H.Akeboshi, Y.Kashiwagi, H.Aoki, T.Tonozuka, A.Nishikawa, Y.Sakano: "Construction of an Efficient Expression System for Aspergillus Isopullulanase in Pichia pastoris and a Simple Purification Method"Biosci.Biotechnol.Biochem.. (in press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Rie Uotsu-Tomita, Takashi Tonozuka, Yoshiyuki Sakano: "Novel glucoamylase-type enzymes from Thermoactinomyces vulgaris and Methanococcus annaschii whose genes are found in the flaking region of α-amylase genes"Applied Microbiology Biotechnology. 56. 465-473 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] A.Ohtaki, S.Kondo, Y.Shimura, T.Tonozuka, Y.Sakano, S.Kamitori: "Role of Phe286 in the recognition mechanism of cylomaltcoligosaccharides (cylodexiring) by Themoactinomycesvtdgaris R-47 a-amylase2 (TVAII). X-raystructures of the mutant TVAIIsF286A and F286Y, and kinetic analyscs of Phe286-replacedmutant TVAIIs"Carbohydrate Research. 334. 309-313 (2001)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Takashi Tonozuka, Shigehiro Kamitori, Yoshiyuki Sakano: "Crystal Structure and Functions of Two Pullulan-hydrolyzing α-Amylases from a Thermophilic Actinomycete, Thermoactiomyces vulgaris"Journal Applied Glycoscience. 48(2). 163-169 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yokota,T.Tonozuka,Y.Shimura,K.Ichikawa,S.Kamitori and Y.Sakano: "Structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II complexed with substrate analogues"Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry. 65(3). 619-626 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kondo,A.Ohtaki,T.Tonozuka,Y.Sakano and S.Kamitori: "Studies on the hydrolyzing mechanism for cyclodextrins of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II (TVA II)."Journal of Biochemistry. 129(3). 423-428 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yokota,T.Tonozuka,S.Kamitori and Y.Sakano: "The Deletion of Amino-Terminal Domain in Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylases"Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry. 65(2). 401-408 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ichikawa,T.Tonozuka,T.Yokota,Y.Shimura and Y.Sakano: "Analysis of Catalytic Residues of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II (TVA II) by site-directed mutagenesis "Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry. 64(12). 2692-2695 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] A.Padmajanti,T.Tonozuka and Y.Sakano: "Deglycosyl Isopullulanase Retains Enzymatic Activity"Journal of Applied Glycoscience. 47(3&4). 287-292 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 殿塚隆史,坂野好幸,神鳥成弘: "プルランとサイクロデキストリンを分解するα-アミラーゼの機能と立体構造"バイオサイエンスとインダストリー. 58(8). 560-563 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] R.Uotsu-Tomita,T.Tonozuka,H.Sakai and Y.Sakano: "Novel glucoamylase-type enzymes from Thermoactinomyces vulgaris and Methanococcus jannaschii whose genes are found in the flanking region of α-amylase genes"Applied Microbiology and Biotechnology. (in press). (2001)

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      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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