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化学的手法による標的分子の迅速同定とリガンド結合部位の高精度解析一般法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 12470483
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 化学系薬学
研究機関熊本大学

研究代表者

中山 仁  熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 教授 (70088863)

研究分担者 川合 述史  自治医科大学, 名誉教授 (00073065)
國安 明彦  熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 助教授 (90241348)
益田 勝吉  サントリー生物有機科学研究所, 研究員 (30190359)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
13,500千円 (直接経費: 13,500千円)
2002年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2001年度: 3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2000年度: 6,300千円 (直接経費: 6,300千円)
キーワード光アフィニティラベル / 抗リガンド抗体 / TOF-MS / ESI-MS / MS / ラベル化ペプチド断片 / 結合部位の同定 / TDF-MS / ラベル化ペプチド解析 / 神経特異的ハチ青
研究概要

光アフィニティラベル(PAL)法は薬物や生理活性物質の標的となる高分子の同定と結合構造の詳細を明らかにできる優れた方法であるにもかかわらず、従来、それほど広範には利用されていない最大の理由は、ラベルペプチドの特異的回収とこれを高感度・高精度に検出する分析手法が確立していなかったためである。本研究では、この手法を普遍化する必要条件を確立することを目的とし、3年間で取り組んだ。得られた成果は以下の通りである。
(1)光アフィニティラベル用試薬(TOY-SG)と類似構造をもつグルタチオン誘導体をハプテンとした抗体を調製した。サブピコモルのハプテンを認識できる抗体力価を有していた。
(2)光ラベルしたcMOAT(胆管側膜の薬剤排出ポンプ)を調製、精製した。基質特異性の高いプロテアーゼLys-Cでの消化で、3-4kDaの光ラベルされたペブチド断片が得られる条件を設定した後、抗ハプテン抗体を用いた免疫沈降法による精製を試みたが、沈降率が〜5%と低く、実用的精製には十分ではないことがわかった。
(3)別法として、Lys-C消化フラグメントを逆相系HPLCを用いて分画し、光ラベルフラグメントを含むそれぞれの画分をMALDI-TOF MS分析した結果、これまで我々、および他のグループが点変異法で明らかにした2ヶ所の膜貫通部以外に、新たに2ヶ所のヌクレオチド結合ドメイン近傍がラベルされたフラグメントに合致する分析値が得られた。これは新知見である。
(4)本法を一般化するには、高力価のハプテン抗体を得る方法が課題として残った。

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (30件)

  • [文献書誌] A.Kuniyasu, et al.: "CD36-mediated endocytic uptake of AGE in mouse 3T3-L1 and human subcutaneous adipocytes"FEBS Lett.. 537. 85-90 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Yoshikawa, et al.: "Photochemical identification of the binding region for (S) semotiadil on sodium channels"Heterocycles. 59(2). 613-622 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Miyazaki, et al.: "Scavenger receptor that recognize advanced glycation end products"Trends Cardiovasc.Med.. 12(6). 258-262 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Efficient identification of photolabelled amino acid by immuno-purification and mass spectrometry"Biochem.J.. 363(2). 223-232 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Kuniyasu, et al.: "Adipocytes recogrize and degrade oxidized LDL through CD36"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 295(2). 319-323 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Induction of CHOP and apoptosis by nitric oxide in p53-deficient microglial cells"FEBS Lett.. 506(2). 135-139 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Kuniyasu, et al.: "CD36-mediated endocytic uptake of AGE in mouse 3T3-L1 and human subcutaneous adipocytes."FEBS Lett.. 537. 85-90 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Yoshikawa, et al.: "Photochemical identification of the binding region for (s)-semotiadil on sodium channels."Heterocycles. 59(2). 613-622 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Miyazaki, et al.: "Scavenger receptors mat recognize advanced glycation end products."Trends Cardiovasc. Med.. 12(6). 258-262 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Kawahara, et al.: "Efficient identification of photolabeled amino acids by Immuno-purification and mass spectrometry"Biochem. J.. 363(39). 223-232 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Kuniyasu, et al.: "Adipocytes recognize and degrade oxidized LDL through CD36."Biochem. Biophys. Res. Commun.. 205(2). 319-323 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Kawahara, et al.: "Induction of CHOP and apoptosis by nitric oxide in P53-deficient microglial cells"FEBS Lett.. 506(2). 135-139 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Kuniyasu, et al.: "CD36-mediated endocytic uptake of (AGE) in mouse 3T3-L1 and human subcutaneous adipocytes"FEBS Lett.. 537. 85-90 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] H.Yoshikawa, et al.: "Photochemical identification of the binding region for (S)-semotiadil on sodium channels"Heterocycles. 59(2). 613-622 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A, Miyazaki, et al.: "Scavenger receptors that recognize advanced glycation end products"Trends Cardiovasc. Med.. 12(6). 258-262 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Efficient identification of photolabeled amino acids by mmuno-purification and mass spectrometry"Biochem. J.. 363(2). 223-232 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.Kuniyasu, et al.: "Adipocytes recognize and degrade oxidized LDL through CD36"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 295(2). 319-323 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Induction of CHOP and apoptosis by nitric oxide in p53-deficient microglial cells"FEBS Lett.. 506(2). 135-139 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Efficient identification of photolabeled amino acids by immuno-purification and mass spectrometry"Biochem. J.. (in press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] E.Kinoshita, et al.: "Novel wasp foxin diseriminates between neuronal and cardiac sodium channels"Mol. Pharmacol.. 59. 1457-1463 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K.Murata, et al.: "Asymmetric arrangement of auxiliary subunit of skeletal muscle L-tape Ca^<2+> channel"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 282. 284-291 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] N.Ohgami, et al.: "CD36 functions as a receptor for advanced glycation end products"Ann. N. Y. Acad. Sci.. 947. 350-355 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Induction of CHOP and apoptosis by nitric oxide in p53-defecient microgrial cells"FEBS Lett.. 506. 135-139 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawahara, et al.: "Co-induction of argininosuccinate-synthase, CAT-2, and NOS in activated micrglial cells"Mol. Brain Res.. 90. 165-173 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] H,K,Motoike et al.: "A region in IVS5 of the human cardiac L-type calcium channel is required for the use-dependent block"J.Biol.Chem.. 274(14). 9409-9420 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] A.Kuniyasu et al.: "A new scorpion toxin (Bmk-PL) stimulate Ca^<2+>-release channel activity of the skeletal-muscle ryanodine receptor"Biochem.J.. 339. 343-350 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] K.Furuta et al.: "[^<35>S]S-[5(4-benzoylphenyl)pentyl] glutathione : A versatile radioligand targeting GS-X pump"Bioorg.Med.Chem.Lett.. 9. 2661-2666 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] V.T.G.Chuang et al.: "Helix 6 of subdomain IIIA of HSA is the region primarily photolabeled by ketoprofen"Biochim.Biophys.Acta. 1434. 18-30 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] N.Ohgami et al.: "Glibenclamide acts as an inhibitor of acyl-CoA : cholesterol acyltransferase enzyme"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 277. 417-422 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] N.Ohgami et al.: "CD36, a member of the class B scavenger receptor family, as a receptor for advanced glycation end products"J.Biol.Chem.. 276(5). 3195-3202 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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