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転写制御のアーキテクチャー:マルチ亜鉛フィンガーの構築と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 12470505
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 医薬分子機能学
研究機関京都大学

研究代表者

杉浦 幸雄  京都大学, 化学研究所, 教授 (40025698)

研究分担者 永岡 真  京都大学, 化学研究所, 助手 (60314275)
二木 史朗  京都大学, 化学研究所, 助教授 (50199402)
研究期間 (年度) 2000 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
16,400千円 (直接経費: 16,400千円)
2001年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2000年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
キーワード転写因子 / 亜鉛フィンガー / アーキテクチャー / DNA結合 / DNA湾曲 / マルチフィンガー / 遺伝子制御 / 動力学
研究概要

天然制限酵素の認識よりも広い20〜30塩基対程度の非対称配列の認識を達成するため、1つの亜鉛フィンガーモチーフ当り3塩基を認識するSp1由来のCys_2His_2型亜鉛フィンガーモチーフを6つおよび9つ導入すると共に、N末端側にDNA切断部位としてトリペプチドGGHをも導入した新規2Sp1GGHを設計・創製した。一般に大腸菌中で発現させた蛋白質のN末端はメチオニンになることが知られているので、トリペプチドGGHをN末端側に制限プロテアーゼ因子Xaの切断部位を含む形で、6つあるいは9つの亜鉛フィンガー部分のN末端に導入した。その結果、予想通り制限酵素類似の機能を示した。ショウジョウバエから単離された亜鉛フィンガー蛋白質GF2のフィンガー5は天然には珍しくAT塩基を認識している。そこで、Sp1のフィンガー2における位置にCF2のフィンガー5で見られるアミノ酸V、Y、Kをそれぞれ導入したSp1-亜鉛フィンガー変異体(Sp1VYK2)やSp1とCF2のキメラ亜鉛フィンガー蛋白質など、新しいAT認識型の亜鉛フィンガー蛋白質の分子設計を行った。得られた蛋白質を用いて、5'-GGG-TAT-GGG-3'のようなDNA配列への高選択的結合能などを評価した結果、予想通り標的DNAへの高い結合性が認められた。転写因子Sp1の3つの亜鉛フィンガードメインを基にポリグリシンで連結した新規6-亜鉛フィンガー型蛋白質を設計・創製した。その結果、4個のグリシンをリンカーとして連結させた6-亜鉛フィンガー蛋白質はDNAを湾曲化させることは出来なかったが、7個あるいは10個のグリシンをリンカーとして連結させた6-フィンガー蛋白質はDNAを大きく湾曲化させた。これらの新しい人工分子は、遺伝子機能の制御に新しい概念と手段を与えるものであり、近い将来、人工遺伝子制御分子としての開発が期待される。

報告書

(3件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (18件)

  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Multiconnection of identical zinc finger : Implication for DNA binding affinity and unit modulation of the three zinc finger domain"Biochemistry. 40・9. 2932-2941 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Significant effect of linker sequence on DNA recognition by multi-zinc finger protein"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 282・4. 1001-1007 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Matsushita: "Effect of arginine mutation of alanine-556 on DNA recognition of zinc finger protein Sp1"Bioorg. Med. Chem.. 9・9. 2259-2267 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Selected base sequence outside the target binding site of zinc finger protein Sp1"Nucleic Acids Res.. 29・24. 4920-4929 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Hori: "Artificial zinc finger peptide containing a novel His_4 domain"J. Am. Chem. Soc.. 122・32. 7648-7653 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Naoaoka: "Artificial zinc finger peptides : Creation, DNA recognition, and gene regulation"J. Inorg. Biochem.. 82・1-4. 57-63 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagaoka, M. et al.: "Multiconnetion of identical zinc finger : Implication for DNA binding affinity and unit modulation"Biochemistry. 40(9). 2932-2941 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagaoka, M. et al: "Significant effect of linker sequence on DNA recognition by multi-zine finger protein"Biochern. Biophys. Res. Commun.. 282. 1001-1007 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsushita, K. et al: "Effect of arginine mutation of alanine-556 on DNA recognition of zinc finger : protein Sp1"Biooorg. Med. chem.. 9(9). 2259-2267 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagaoka, M. et al.: "Selected base sequence outside the target binding site of zinc finger protein Sp1"Nucleic Acids Res.. 29(24). 4920-4929 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Multiconnection of identical zinc finger : Implication for DNA binding affinity and unit modulation of the three zinc finger domain"Biochemistry. 40・9. 2932-2941 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Significant effect of linker sequence on DNA recognition by multi-zinc finger protein"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 282・4. 1001-1007 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] K.Matsushita: "Effect of arginine mutation of alanine-556 on DNA recognition of zinc finger protein Spl"Bioorg.Med.Chem.. 9・9. 2259-2267 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Selected base sequence outside the target binding site of zinc finger protein Sp1"Nucleic Acids Res.. 29・24. 4920-4929 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M.Imanishi: "DNA bending finger. Artificial design of 6-zinc finger peptides with polyglycine linkerand induction of DNA bending"Biochemistry. 39・15. 4383-4390 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Hori: "Artificial zinc finger peptide containing a novel His_4 domain"J.Am.Chem.Soc.. 122・32. 7648-7653 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Artificial zinc finger peptides : Creation, DNA recognition and gene regulation"J.Inorg.Biochem.. 82・1-4. 57-63 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Uno: "Finger Positional change in three zinc finger protein Sp1"Biochemistry. 40・6. 1787-1795 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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