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一次性・二次性多形膠芽腫における遺伝子発現プロフィールのマイクロアレイ解析

研究課題

研究課題/領域番号 12557114
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 脳神経外科学
研究機関北海道大学

研究代表者

守内 哲也 (2002)  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (20174394)

細川 眞澄男 (2000-2001)  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (20001901)

研究分担者 細川 真澄男  北海道医療大学, 看護福祉学部, 教授 (20001901)
多田 光宏  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 助教授 (10241316)
守内 哲也  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (20174394)
研究期間 (年度) 2000 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
12,600千円 (直接経費: 12,600千円)
2002年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2001年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2000年度: 6,900千円 (直接経費: 6,900千円)
キーワードglioblastoma / de novo glioblastoma / secondary glioblastoma / P13K-Akt pathway / p53 functional loss / cDNA array / transcriptome / pattern classification / P13K-Aki pathway / p53 fumcional loss / cDNA aray / Pl3K-Ak1 pathway / PI3K-Akt pathway
研究概要

多形膠芽腫(glioblastoma multiforme)は比較的高齢者に,前駆病変なしにde novoに発生する"primary (de novo) glioblastoma"と比較的若年者により良性の星細胞腫からの悪性転化の過程を経て発生する"secondary glioblastoma"の2つのサブセットに分類される.膠芽腫の両サブセットにおいて,DNAマイクロアレイによるmRNA発現情報を解析し,両サブセットの分子遺伝学的本態を明らかにし,生物学的,臨床的な差異を生じる機序を解明することを目的とする.
この研究により以下の研究成果を得た.
1)両サブセットの分類のため、p53変異と逆相関を両サブセットで示すPTEN遺伝子の変異を同定するストップコドンアッセイを開発,膠芽腫に適用した(Oncogene)
2)両サブセットの分類のため、任意の遺伝子のストップコドン型変異の有無について迅速な遺伝子診断が可能な酵母Universal Stop Codon Assayを開発(Am J Pathol).
3)1300遺伝子を厳選し、スポットした、独自のアレイを開発、119種の癌細胞株のRNAサンプルにてそのアレイによる遺伝子発現プロフィールを検討し、良好な成績を得た。
4)U251MG,SF268,SF295,SF539,SNB-75,SNB-78の6種の神経膠腫細胞株において、p53,APC,PTEN遺伝子変異の有無を検討するとともに、上記DNAアレイにて遺伝子発現プロフィールを解析し、p53の有無によるサブセット分類と関係のある遺伝子85種を抽出した。
5)これらの解析には特徴選択アルゴリズムとニューラルネットワークの併用が極めて有用であった.現在,これら遺伝子を含む専用アレイにて、より多くの症例で解析を実行し,mRNA発現情報の差を検討中である.

報告書

(4件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (32件)

  • [文献書誌] Ikeda, J.: "Restoration of endogenous wild-type p53 activity in a glioblastoma cell line with intrinsic temperature-sensitive p53 induces growth arrest but not apoptosis"Int J Cancer. 94. 35-43 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tsuiki, H.: "Mechanism of hyperploid cell formation induced by microtubule inhibiting drug in glioma cell lines"Oncogene. 20. 420-429 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tada, M.: "Inactivate the remaining p53 allele or the alternate p73?-Preferential selection of the Arg72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants"Carcinogenesis. 22. 515-517 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kataoka, A.: "Development of a yeast stop codon assay readily and generally applicable to human genes"Am J Pathol. 159. 1239-1245 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsumoto, J.: "Differential mechanisms of constitutive Akt/PKB activation and its influence on gene expression in pancreatic cancer cells"Jpn J Cancer Res. 93. 1317-1326 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Zhang, C.-L.: "Detection of PTEN nonsense mutation and psiPTEN expression in central nervous system high-grade astrocytic tumors by a yeast-based stop codon assay"Oncogene. 19. 4346-4353 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 多田光宏: "脳神経外科医に必要な分子生物学"三輪書店,東京(分担). 86-99 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ikeda J.: "Restoration of endogenous wild type p53 activity in a glioblastoma cell line with intrinsic temperature-sensitive p53 induces growth arrest but not apoptosis"Int J Cancer. 94. 35-43 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tsuiki H.: "Mechanism of hyperploid cell formation induced by microtubule inhibiting drug in glioma cell lines"Oncogene. 20. 420-429 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tada M.: "Inactivate the remaining p53 allele or the alternate p73? -- Preferential selection of the Arg72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants"Carcinogenesis. 22. 515-517 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kataoka A.: "Development of a yeast stop codon assay readily and generally applicable to human genes"Am J Pathol. 159. 1239-1245 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsumoto J.: "Differential Mechanisms of Constitutive Akt/PKB Activation and Its Influence on Gene Expression in Pancreatic Cancer Cells"Jpn J Cancer Res. 93. 1317-1326 (2002)

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    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Zhang C. -L.: "Detection of PTEN nonsense mutation and psiPTEN expression in central nervous system high-grade astrocytic tumors by a yeast-based stop codon assay"Oncogene. 19. 4346-4353 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tada M.: "Mitsuwa-Shoten, Tokyo"Molecular Biology for Neurosurgeons. 96-99 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ikeda J: "Restoration of endogenous wild type p53 activily in a glioblastoma cell line with intrinsic temperature-sensitive p53 induces growth arrest but not apoptosis"Int J Cancer. 94. 35-43 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuiki H: "Mechanism of hyperploid cell formation induced by microtubule inhibiting drug in glioma cell lines"Oncogene. 20. 420-429 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Tada M: "Inactivate the remaining p53 allele or the alternate p73? -Preferential selection of the Arg72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants"Carcinogenesis. 22. 515-517 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kataoka: "Development of a yeast stop codon assay readily and generally applicable to human genes"Am J Pathol. 159. 1239-1245 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Matsumoto: "Differential Mechanisms of Constitutive Akt/PKB Activation and Its Influence on Gene Expression in Pancreatic Cancer Cells"Jpn J Cancer Res. 93. 1317-1326 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Zihang C-L: "Detection of PTEN nonsense mutation and psiPTEN expression in central nervous system high-grade astrocytic tumors by a yeast-based stop codon assay"Oncogene. 19. 4346-4353 (2000)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 多田光宏: "脳神経外科医に必要な分子生物学"三輪書店, 東京. 86-99 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ikeda J.: "Restoration of endogenous wild type p53 activity in a glioblastoma cell line with intrinsic temperature-sensitive p53 induces growth arrest but not apoptosis"Int J Cancer. 94. 35-43 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuiki H.: "Mechanism of hyperploid cell formation induced by microtubule inhibiting drug in glioma cell lines"Oncogene. 20. 420-429 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tada M.: "Inactivate the remaining p53 allele or the alternate p73? -- Preferential selection of the Arg72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants"Carcinogenesis. 22. 515-517 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kataoka A.: "Development of a yeast stop codon assay readily and generally applicable to human genes"Am J Pathol. 159. 1239-1245 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Hosokawa M.: "Constitutive expression of hypoxia-inducible factor-1alpha renders pancreatic cancer cells resistant to apoptosis induced by hypoxia and nutrient deprivation"Cancer Res. 61. 6548-6554 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Hamada J.: "Increased oxidative DNA damage in mammary tumor cells by continuous epidermal growth factor stimulation"J Natl Cancer Inst. 93. 214-219 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 多田光宏: "脳神経外科医に必要な分子生物学"三輪書店,東京(分担). 86-99 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nozaki M, Tada M et al.: "No p73 mutations in meningiomas as determined with a simple functional yeast assay, instead, increased p73 expression characterizes malignant meningiomas."Brain Pathology. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Tada M, Furuuchi K, et al.: "Inactivate the Remaining p53 Allele or the Alternate p73? -Preferential selection of the Arg 72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants."Carcinogenesis. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Asaoka K, Tada M et al.: "Efficient adenoviral gene delivery in malignant glioma cells depends on the expression levels of coxsackievirus and adenovirus receptor."Journal of Neurosurgery. 92. 1002-1008 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Zhang C-L, Tada M, et al.: "Detection of PTEN nonsense mutation and psiPTEN expression in central nervous system high-grade astrocytic tumors by a yeast-based stop codon assay."Oncogene. 19. 4346-4353 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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