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酵素分子の揺らぎを考慮した新しい酵素反応機構の構築

研究課題

研究課題/領域番号 12680634
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 機能生物化学
研究機関京都大学

研究代表者

河合 靖  京都大学, 化学研究所, 助手 (20240830)

研究期間 (年度) 2000 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2001年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2000年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワード加水分解酵素 / 反応機構 / 粘度効果 / α-キモトリプシン / 揺らぎ / 還元酵素
研究概要

本研究は酵素が実際に反応している状況で酵素分子の揺らぎ働きを詳細に検討するというもので,反応媒体の粘度を変えることで酵素分子の動きを抑制して反応速度を測定し,詳細な反応機構を検討する.これまでにα-chymotrypsinに関して数々の知見を得ているので,その他の酵素に関して研究を行った.
まずβ-trypsinおよびsubtilisin carlsbergに関して詳細な検討を行った.β-trypsinの場合は,α-chymotrypsinと同様に,さまざまな基質において速度定数κ2は,アニリド基質では反応系の粘度に依存せず一定で,エステル基質では粘度の増大にともなって単調に減少した.一方,subtilisin carlsbergの場合はこれら二つの酵素の挙動とは対照的に,アンリド基質においてもエステル基質においても,速度定数κ2は粘度の増大にともなって単調に減少した.また,その変化量は上記二つの酵素でのエステル基質における変化量より小さいものであった.これらの結果から,α-chymotrypsinとβ-trypsinの場合はκ2段階において四面体中間体が生成する段階で酵素分子の動きがより重要な役割を果たしており,subtilisin carlsbergの場合は四面体中間体が生成する段階と四面体中間体から生成物が脱離してアシル酵素(Acyl-E')が生成する両方の段階において酵素分子の動きが重要な役割を果たしていることが明らかになった.
同じ触媒機構を有する三種のセリンプロテアーゼにおいて,それらの反応機構を考えたときに,酵素分子全体の揺らぎを加味することで異なる傾向が観測されたことは,酵素分子進化を考える上で非常に興味深い知見である.
また,加水分解酵素以外の酵素反応に適用するために,酸化還元酵素について検討することにした.その第一段階として,酸化還元酵素の探索を行った.反応としては今までにあまり研究例のない炭素-炭素二重結合の還元を選び,ニトロアルゲンおよびα,β-不飽和ケトンを反応のプローブとして用いた還元酵素の探索を行い,新規酵素5種を単離精製することに成功した.

報告書

(3件)
  • 2001 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (12件)

  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric reduction of nitroalkenes with baker's yeast"Tetrahedron : Asymmetry. 12. 309-318 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric synthesis of a nitroalkane by the use of novel nitroalkane reductase from baker's yeast"Tetrahedron Letters. 42. 3367-3368 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric synthesis of α-chiral ketones by the reduction of enones with baker's yeast"Tetrahedron : Asymmetry. 12. 3007-3013 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "6-Chloro-2,4-dinitrophenylhydrazine as a useful crystalline agent for the determination of absolute configuration"Tetrahedron Letters. 43. 465-467 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric reduction of nitroalkenes with baker's yeast"Tetrahedron : Asymmetry. 12. 309-318 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric synthesis of a nitroalkane by the use of novel nitroalkane reductase from baker's yeast"Tetrahedron Letters. 42. 3367-3368 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric synthesis of α-chiral ketones by the reduction of enones with baker's yeast"Tetrahedron : Asymmetry. 12. 3007-3013 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "6-Chloro-2,4-dinitrophenylhydrazine as a useful crystalline agent for the determination of absolute configuration"Tetrahedron Letters. 43. 465-467 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2001 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric synthesis of α-chiral ketones by the reduction of enones with baker's yeast"Tetrahedron : Asymmetry. 12・21. 3007-3013 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "6-Chloro-2, 4-dinitrophenylhdrazine as a useful crystalline agent for the determination of absolute configuration"Tetrahedron Letters. 43・3. 465-467 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric reduction of nitroalkenes with baker's yeast"Tetrahedron: Asymmetry. 12・2. 309-318 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yasushi Kawai: "Asymmetric Synthesis of a nitroalkane by the use of novel nitroalkane reductase from baker's yeast"Tetrahedron Letters. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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