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野生イネに潜む有用形質を支配する遺伝子の検出―野生種を利用した稲育種に向けて―

研究課題

研究課題/領域番号 12760007
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 育種学
研究機関神戸大学

研究代表者

石井 尊生  神戸大学, 農学部, 助手 (20260648)

研究期間 (年度) 2000 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2001年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2000年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードQTL / O. sativa / rice / wild species / microsatellite / yield / O. rufipogon / backcross population / O.sativa / O.rufipogon
研究概要

イネ野生種が持つ栽培種に存在しない有用遺伝子を検出するため、以下の実験を行った。まず、野生イネの材料としてミヤンマー由来のOryza rufipogon W630を用い、2種類の典型的な栽培品種(O. sativa Japonica cv. NipponbareおよびO. sativa Indica cv. IR36)で交雑し、それぞれ約200個体からなるBC_2戻し交雑集団を作成した。次に、これらを圃場に展開し、出穂期、最大光合成能、桿長、穂長、有効分げつ数、、種子100粒重、籾長、籾幅、玄米長、玄米幅、収量の11形質について調査した。BC_2集団は様々な形質を調査し終わる登熟期まで、葉を大量にサンプリングできなかったので、各BC_2自植後代約15系統の幼葉をまとめて回収しDNAを抽出した。これらのDNAは鋳型として調整し、マイクロサテライトマーカー座についての遺伝子型を調べるためにPCRを行った。なお、使用したマイクロサテライトマーカーは交配親間で多型がみられ、ほぼゲノムをカバーしている約75マーカーであった。11形質についてのデータならびに分子マーカー座の遺伝子型のデータをもとに、量的形質遺伝子座(QTL)解析を行ったところ、有意となった領域はNipponbare戻し交雑集団では55ヶ所、IR36戻し交雑集団では51ヶ所見出された。これらのうち、それぞれ半数強の領域において、野生種の対立遺伝子が各形質の計測値を増加させる効果を持っていた。2つの異なった栽培品種の遺伝的背景においては、野生種由来のQTLは6領域で共通していた。収量に関しては、第1染色体上の1領域で検出された野生種のQTLが両集団において収量を向上させる効果を持っていた。従って、この野生種由来のQTLは栽培イネのJaponicaおよびlndica双方において収量を向上させる効果を持つ可能性が示唆された。

報告書

(2件)
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (5件)

  • [文献書誌] Nobuyuki Ikeda: "Ultra-simple DNA extraction method for marker-assisted selection using microsatellite markers in rice"Plant Molecular Biology Reporter. 19. 27-32 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nonnatus S.Bautista: "RAPD, RFLP and SSLP analyses of phylogenetic relationships between cultivated and wild species of rice"Genes and Genetic Systems. 76. 71-79 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Takashige Ishii: "Wild-QTL-allele effect in the background of two typical rice cultivars, Oryza sativa Japonica Nipponbare and O. Sativa Indica IR36"Rice Genetics IV. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nonnatus S.Bautista: "Trait improving wild-QTL alleles identified from an advanced backcross QTL analysis using a cross between cultivated rice, Oryza sativa and wild rice, O. rufipogon"Rice Genetics IV. (in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nobuyuki Ikeda: "Ultra-simple DNA extraction method for marker-assisted selection using microsatellite markers in rice."Plant Molecular Biology Reporter. 19(in press). (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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