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DNA四重鎖構造を利用した分子認識システムに関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 12780438
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 生物有機科学
研究機関京都大学

研究代表者

岡本 晃充  京都大学, 工学研究科, 助手 (60314233)

研究期間 (年度) 2000 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2001年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2000年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードDNA四重鎖 / デアザプリン / 修飾核酸塩基 / オリゴヌクレチド / 遠隔ホール移動 / オリゴヌクレオチド
研究概要

本研究の目的は、DM四本鎖構造(G-カルテット構造)を利用した新しい配列認識手段を開発することにある。平成13年度では、この目的に従って、DNA四本鎖を容易かつ安定に構造を制御することができる分子系を設計、合成し、アッセイを目指した。種々の実験を行った結果、以下に示す知見が得られた。
1)高いスタッキング能を有する新規人エプリン塩基の開発
DNA四本鎖構造を捕捉するための分子の合成過程において、新規修飾核酸塩基ペンゾデアザグアニンが得られた。私は、この塩基がその高いスタッキング能によってB型DNA二本鎖を安定化することを見いだした。同時に、DNA内ホール移動における効果的なホール輸送媒体として利用できる可能性があることがわかった。
2)新規縮重塩基の開発
1)と同様に、DNA四本鎖構造捕捉分子の合成過程において、新規修飾核酸塩基2-アミノ-7-デアザアデニンが得られた。私は、この塩基がチミンだけでなくシトシンとも安定な塩基対形成可能な縮重塩基であることを見いだした。この分子で観察されたような強い結合力を有する縮重塩基の例はこれまで知られていない。また、この塩基に対して、核酸合成酵素を用いることによりチミンを選択的かつ効率的に導入することができた。本塩基は、分子生物学の分野において極めて実用性が高い核酸塩基であると思われる。
私は、以上のように、DNA四本鎖の構造制御の研究において、種々の高機能性核酸塩基を見いだすことができた。いずれの成果も高い実用性が期待され、本科学研究費は、大変有効に役立てることができたと考えている。

報告書

(2件)
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (7件)

  • [文献書誌] A.Okamoto, K.Tanabe, I.Saito: "Synthesis and Properties of Peptide Nucleic Acids Containing Psoralen Units"Oranic Letters. 3. 925-927 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] A.Okamoto, K.Tanaka, I.Saito: "2-Amino-7-deazaadenine forms stable base pairs with cytosine and thymine"Bioorganic Medicinal Chemistry Letters. 12. 97-99 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] A.Okamoto, K.Tanabe, C.Dohno, I.Saito: "Modulation of remote DNA oxidation by hybridization with peptide nucleic acids (PNA)"Bioorganic Medicinal Chemistry. 10. 713-718 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] A.Okamoto,T.Nakamura,K.Yoshida,K.Nakatani and I.Saito: "Site-Selective DNA Alkylation of GG Steps by Naphthaldiimide Derivatives Possessing Enantiomeric Epoxide"Organic Letters. 2. 3249-3251 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] K.Tanabe,K.Yoshida,C.Dohno,A.Okamoto and I.Saito: "Control of Electron Transfer in DNA by Peptide Nucleic Acids (PNA)"Nucleic Acids Symposium Series. 44. 35-36 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] A.Okamoto,T.Toshiji,K.Tanaka and I.Saito: "Synthesis and Duplex Stability of Oligonucleotides Containing 7-Vinyl-7-Deazaguanine as a Strong Electron-Donating Nucleobase"Tetrahedron Letters. 41. 10035-10039 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] A.Okamoto,K.Tanabe and I.Saito: "Synthesis and Properties of Peptide Nucleic Acids Containing Psoralen Units"Organic Letters. 3. ASAP (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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