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膜蛋白質複合体チトクロム酸化酵素分子内のリン脂質の構造と機能研究

研究課題

研究課題/領域番号 12780495
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関大阪大学

研究代表者

山下 栄樹  大阪大学, 蛋白質研究所, 助手 (00294132)

研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2001年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2000年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードリン脂質 / チトクロム酸化酵素 / X線結晶構造解析 / 放射光
研究概要

膜蛋白質複合体であるウシ心筋チトクロム酸化酵素の結晶構造から、分子内に取り込まれたリン脂質が発見できた。これら分子内に取り込まれたリン脂質の構造とリン脂質と蛋白質内のアミノ酸残基との詳細な結合様式を決定することは、膜蛋白質の構造形成を理解する上で極めて重要なことである。本研究では、チトクロム酸化酵素の高分解能での精密な結晶構造解析を行い、リン脂質とアミノ酸残基との相互佐用を詳細に調べ、膜蛋白質複合体の分子構築におけるリン脂質の役割を解明する。
チトクロム酸化酸素及び結合しているリン脂質の立体構造は、X線結晶構造解析法を用いて、1.8Å分解能で決定した。リン脂質は、チトクロム酸化酸素1分子あたり14分子結合しており、カルジオリピン5分子、フォスファチジルコリン1分子、フォスファチジルエタノールアミン3分子、フォスファチジルグリセロール5分子であった。全てのリン脂質は、膜貫通領域にあり、酵素の膜貫通αヘリックスと相互作用を持っていた。リン脂質は酵素表面にあるくぼみやサブユニット間の隙間に多く結合しており、蛋白質との結合は脂肪酸と疎水性アミノ酸による疎水性相互作用が中心であった。蛋白質内部にある空洞に結合していたリン脂質は、水素結合も多く見られた。また、脂肪酸の一部はCHπ結合により相互作用していた。リン脂質14分子のうち13分子がチトクロム酸化酵素の複数のサブユニットと相互作用し、サブユニット間にできる隙間を埋めていたことから、これらリン脂質が4次構造形成を補助する役割を持つことが明らかとなった。さらに、2量体を形成する本酵素の2分子間の結合もリン脂質が補助していた。チトクロム酸化酵素におけるリン脂質はその構成成分の一つとして、機能に関与した役割を担っていることが明らかとなった。

報告書

(2件)
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] Lee S.J., etc.: "Intermonomer interactions in dimer of bovine heart cytochrome c oxidase"Acta Cryst.. D57. 941-947 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nakai, et al: "Crystal structure of N-carbamyl-D-amino acid amidohydrolase with a novel catalytic framework common to amitohydrolases"Structure. 8. 729-737 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Fei M.J., et al: "X ray structure of azide-bound fully oxidized cytochrome C oxidase from bovine heart at 2.9Å resolution"Acta Cryst. D56. 529-535 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] M.Odoko, et al: "Optimization of the energy constant of the methionine S^8-C^8 bond for X-PLOR refinement of protein structure"J.Appl.Cryst. 34. 80-81 (2001)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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