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シズクガイをモデルにしたベントス個体群動態解析への分子遺伝学的手法の適用

研究課題

研究課題/領域番号 12876044
研究種目

萌芽的研究

配分区分補助金
研究分野 水産学一般
研究機関京都大学

研究代表者

林 勇夫  京都大学, 農学研究科, 教授 (70026540)

研究分担者 上野 正博  京都大学, 農学研究科, 助手 (30160196)
豊原 治彦  京都大学, 農学研究科, 助教授 (90183079)
研究期間 (年度) 2000 – 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2001年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2000年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードシズクガイ / ベントス / 二枚貝 / 幼生 / PCR / HaeIII / RILP / 遺伝子 / プライマー / DNA / 制限酵素 / RFLP
研究概要

1.舞鶴湾内での二枚貝浮遊幼生の出現状況
二枚貝浮遊幼生の出現状況を明らかにするために,湾内に設定した定点において,定期的に採集を行った.4月に採水量200リットルあたり10,000個体を超える幼生の出現がみられ,以後急減して数百個体のレベルで推移したが,その間ほぼ2,3ヶ月の間隔で1,000〜2,000個体レベルのピークが問歌的にみられた.
2.浮遊幼生の種判別のためのPCR/RFLP法の確立
幼生1個体から安定して遺伝子解析に必要なPCR増幅産物を得る目的で,試料調製法,酵素,反応条件などを検討し,90%以上の確率で28Sリボゾーム領域の増幅が可能な手法を確立した.約830bpの増幅産物をHaeIIIで切断したところ,本研究で対象としたシズクガイでは,約300bp付近に2本,150bp付近と120bp付近に各1本ずつの分解断片を認めた.この方法を用いて,シズクガイのみならず種々の二枚貝幼生の種同定も可能であることがわかった.
3.舞鶴湾定点におけるシズクガイ浮遊幼生の出現結果
平成13年7月から平成14年2月にわたり約1〜2ヶ月間隔で,上記の定点において,上述のPCR/RFLPを用いてシズクガイ浮遊幼生の出現状況を調べた.その結果,7月から11月末まではシズクガイ幼生はほとんど検出されなかったが,12月末には分析に供した全幼生のうち21%,2月初旬には96%,2月末にはすべてがシズクガイ幼生であった.
4.結論
本研究で確立した28Sリボゾーム領域をマーカーとしたPCR/RFLP法を適用することにより,二枚貝幼生のみならず,他のベントス幼生の種判別が可能であることが明らかとなった.この方法を用いることにより,当該海域のベントス幼生の初期の生態に関する知見を得ることが期待できる.

報告書

(2件)
  • 2001 実績報告書
  • 2000 実績報告書

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公開日: 2000-04-01   更新日: 2016-04-21  

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