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ダイナミックな構造変化が駆動する鉄硫黄クラスター合成機構の全容解明

研究課題

研究課題/領域番号 12J01292
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

平林 佳  大阪大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2012年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード鉄硫黄クラスター / 鉄硫黄タンパク質 / X線結晶構造解析 / 構造変化
研究実績の概要

鉄硫黄(Fe-S)タンパク質は生物界に普遍的に分布しており、生命活動の根幹に関わる反応を担っている。それらの機能を支えるのがFe-Sクラスターである。このFe-Sクラスターの生合成は、SUFマシナリーが担っており、6種類のタンパク質から構成されている。本研究では、マシナリーの心臓部といえるSufBCD複合体に焦点をあてた。この複合体は、SufCのATPase活性に共役してダイナミックな構造変化を起こし、分子内部の必須残基を露出させることで、Fe-Sクラスターを合成すると予想されている。本研究では、構造解析と機能解析の両面から、Fe-Sクラスター合成機構の全容解明を目的とした。将来的には本研究を基盤とした応用技術展開の可能性は計り知れない。
今年度は、SufBCD複合体の結晶学/生化学/遺伝学的解析によって、以下のような成果が得られた。1.SufBCD複合体の良質な結晶調製に成功し、PtおよびHgの異常分散効果を利用した、多重原子同形置換法を用いることで位相を求め、SufBCD複合体の立体構造を決定した。2.微量蛍光分析系では、決定したSufBCD複合体の立体構造に基づいた変異導入と、蛍光ラベル剤を組み合わせることで、SufBCD複合体のATP依存的な構造変化に伴う、必須残基の露出を検出することに成功した。3.遺伝学的な解析として、SufBCD複合体を構成するSufCに関して、大腸菌を用いた相補実験から、ATPase活性に必要な必須残基を同定した。
以上の通り、今年度は、本研究最大の目的であった、ターゲット蛋白質の結晶構造解析に成功することができた。この構造情報と、これまでの生化学データ・遺伝学的なデータによって、Fe-Sクラスター生合成メカニズムに関して、大きく理解を前進させたといえる。また本成果は、本研究分野の更なる発展に大きく貢献することが予想される。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (35件) (うち招待講演 3件)

  • [雑誌論文] The crystal structure of isoniazid-bound KatG catalase-peroxidase from Synechococcus elongatus PCC79422015

    • 著者名/発表者名
      Kamachi S., Hirabayashi K., Tamoi M., Shigeoka S., Tada T., Wada K.
    • 雑誌名

      FEBS Journal

      巻: 282(1) 号: 1 ページ: 54-64

    • DOI

      10.1111/febs.13102

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the catalase-peroxidase KatG W78F mutant from Synechococcus elongatus PCC7942 in complex with the antitubercular pro-drug isoniazid2015

    • 著者名/発表者名
      Kamachi S., Hirabayashi K., Tamoi M., Shigeoka S., Tada T., Wada K.
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 589(1) 号: 1 ページ: 131-137

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.11.037

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 第14回日本蛋白質科学会年会ポスター賞受賞者コラム2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 雑誌名

      日本蛋白質科学会ニュースレター

      巻: Vol. 14 No. 07 ページ: 4-4

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質立体構造解析の最前線2015

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      宮崎大学TT推進機構 医学系物質科学分野セミナー(総合討論会)
    • 発表場所
      宮崎大学図書館3F視聴覚室(宮崎・宮崎)
    • 年月日
      2015-03-23
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新規ABCタンパク質SufBCDのATP依存的構造変化とリンクした鉄硫黄クラスター合成2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、片山寿美枝、岩崎憲治、湯田瑛樹、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      日本結晶学会平成26年度年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      東京大学農学部(東京・東京)
    • 年月日
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] グルタチオン分解酵素γ-グルタミルトランスペプチダーゼの基質認識機構2014

    • 著者名/発表者名
      和田啓、平林佳、李春傑、高尾春奈、鈴木秀之、平竹潤、福山恵一
    • 学会等名
      日本結晶学会平成26年度年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      東京大学農学部(東京・東京)
    • 年月日
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成を支える新規ABCタンパク質SufBCDのATP依存的構造変化2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、片山寿美枝、岩崎憲治、湯田瑛樹、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(口頭発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスターの生合成におけるSufBの機能残基の同定とその役割2014

    • 著者名/発表者名
      湯田瑛樹、佐藤喬之、田中尚志、平林佳、和田啓、福山恵一、高橋康弘
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(口頭発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成を支える新規ABCタンパク質SufBCDのATP依存的構造変化2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、片山寿美枝、岩崎憲治、湯田瑛樹、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] グルタチオンの分解を担うγ-グルタミルトランスペプチダーゼの基質認識機構 ― γ-グルタミル基転移反応の新しいモデル ―2014

    • 著者名/発表者名
      和田啓、平林佳、李春傑、鈴木秀之、平竹潤、福山恵一
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シアノバクテリア由来ビリベルジンリダクターゼの構造・機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      高尾春奈、平林佳、渡邉彩、萩原義徳、榊原陽一、水光正仁、福山恵一、杉島正一、和田啓
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱細菌Aquifex aeolicusの鉄硫黄クラスター生合成系:新規なIscS-IscU-[2Fe-2S]複合体の形成2014

    • 著者名/発表者名
      山川誠、岩永朋子、平林佳、和田啓、福山恵一、高橋康弘
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスターの生合成におけるSufBの機能残基の同定とその役割2014

    • 著者名/発表者名
      湯田瑛樹、佐藤喬之、田中尚志、平林佳、和田啓、福山恵一、高橋康弘
    • 学会等名
      第87回日本生化学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都・京都)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 新規ABCタンパク質SufBCDの構造変化と共役した鉄硫黄クラスターの生合成2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第8回レドックス・ライフイノベーション第170委員会(ポスター発表)
    • 発表場所
      シーガイアコンベンションセンター サミットホール(宮崎・宮崎)
    • 年月日
      2014-08-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] グルタチオン分解系の鍵酵素γ-グルタミルトランスペプチダーゼの基質認識機構2014

    • 著者名/発表者名
      和田啓、平林佳、李春傑、高尾春奈、鈴木秀之、平竹潤、福山恵一
    • 学会等名
      第8回レドックス・ライフイノベーション第170委員会(ポスター発表)
    • 発表場所
      シーガイアコンベンションセンター サミットホール(宮崎・宮崎)
    • 年月日
      2014-08-22
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 細胞レドックス制御に関わる鉄硫黄クラスター生合成機構の構造生物学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第8回レドックス・ライフイノベーション第170委員会(口頭発表)
    • 発表場所
      シーガイアコンベンションセンター サミットホール(宮崎・宮崎)
    • 年月日
      2014-08-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Crystal structures of γ-glutamyl transpeptidase in complex with inhibitors2014

    • 著者名/発表者名
      Hirabayashi K., Ida T., Li C., Suzuki H., Fukuyama K., Hiratake J., Wada K.
    • 学会等名
      XXIII Congress of the International Union of Crystallography(ポスター発表)
    • 発表場所
      Montreal(Canada)
    • 年月日
      2014-08-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Structural analyses of the two cysteine desulfurases from Aquifex aeolicus2014

    • 著者名/発表者名
      Hirabayashi K., Iwanaga T., Yamakawa M., Tanaka N., Fukuyama K., Takahashi Y., Wada K.
    • 学会等名
      XXIII Congress of the International Union of Crystallography(ポスター発表)
    • 発表場所
      Montreal(Canada)
    • 年月日
      2014-08-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成を担う新規ABC蛋白質SufBCD複合体のATP依存的構造変化2014

    • 著者名/発表者名
      平林佳、片山寿美枝、岩崎憲治、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      ワークピア横浜 / 横浜産貿ホール マリネリア(神奈川・横浜)
    • 年月日
      2014-06-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱菌Aquifex aeolicusの鉄硫黄クラスター生合成系ISC様マシナリーの解析2014

    • 著者名/発表者名
      山川誠、岩永朋子、平林佳、和田啓、高橋康弘
    • 学会等名
      平成26年度日本生化学会関東支部例会(ポスター発表)
    • 発表場所
      茨城大学理学部 K棟インタビュースタジオ(茨城・水戸)
    • 年月日
      2014-06-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成に伴うSufBCD複合体の会合状態変換2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、長坂雄太、佐藤喬之、片山寿美枝、岩崎憲治、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      日本結晶学会平成25年度年会
    • 発表場所
      熊本大学 黒髪南キャンパス(熊本県熊本市)(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-10-12
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生物学分野における結晶学―鉄硫黄クラスター生合成系の研究―2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      2013年度結晶学若手の会
    • 発表場所
      熊本大学 大江キャンパス(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2013-10-11
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 新たなABC蛋白質ファミリーに属する鉄硫黄クラスター生合成装置の構造・機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、田中尚志、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第37回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      雲仙新湯ホテル(長崎県雲仙市)(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-09-26
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成装置のダイナミックな構造変化2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、長坂雄太、佐藤喬之、片山寿美枝、岩崎憲治、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第86回日本生化学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)(口頭発表)
    • 年月日
      2013-09-13
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成装置のダイナミックな構造変化2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、長坂雄太、佐藤喬之、片山寿美枝、岩崎憲治、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第86回日本生化学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市) (ポスター発表)
    • 年月日
      2013-09-12
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質複台体間の会合状態変換が生み出す、鉄硫黄クラスターの合成基盤2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、長坂雄太、佐藤喬之、片山寿美枝、岩崎憲治、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取県鳥取市)(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-06-13
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X-ray crystallographic analysis of a non-canonical cysteine desulfurase from the hyperthermophile, Aquifex aeolicus2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、岩永朋子、山川誠、田中尚志、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      7^<th> International Conference on Fe-S Cluster Biogenesis and Regulation
    • 発表場所
      University of South Carolina (アメリカ)(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-05-22
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X-ray crystallographic analysis of a non-canonical cysteine desulfurase from the hyperthermophile, Aauifex aeolicus2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、岩永朋子、山川誠、田中尚志、福山恵一、高橋康弘、和田啓
    • 学会等名
      7^<th> International Conference on Fe-S Cluster Biogenesis and Regulation
    • 発表場所
      University of South Carolina (アメリカ)(口頭発表)
    • 年月日
      2013-05-21
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis of protein-protein interaction manners in the plant-type [2Fe-2S] ferredoxin2013

    • 著者名/発表者名
      平林佳、亀田悠、高橋康弘、福山恵一、和田啓
    • 学会等名
      7^<th> International Conference on Fe-S Cluster Biogenesis and Regulation
    • 発表場所
      University of South Carolina (アメリカ)(ポスター発表)
    • 年月日
      2013-05-21
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成系ISCマシナリーを支えるタンパク質間相互作用の構造生物学的研究2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      第85回日本生化学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)(口頭発表)
    • 年月日
      2012-12-16
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター合成系ISCマシナリーを支えるタンパク質間相互作用の構造生物学的研究2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      第85回日本生化学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-12-15
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of the SUF system involved in de novo iron-sulfur cluster biosynthesis2012

    • 著者名/発表者名
      和田啓
    • 学会等名
      AsCA12/CRYSTAL28
    • 発表場所
      Adelaide Convention Centre(オーストラリア)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-12-03
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure of a non-canonical cysteine desulfurase from Aquifex a eolicus2012

    • 著者名/発表者名
      岩永朋子
    • 学会等名
      AsCA12/CRYSTAL28
    • 発表場所
      Adelaide Convention Centre(オーストラリア)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-12-03
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成の中核を担うコア複合体SufBCDのオリゴマー変換2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      日本結晶学会平成24年度年会
    • 発表場所
      東北大学片平キャンパス(宮城県)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-10-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ISCマシナリーによる鉄硫黄クラスターアセンブリー機構の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      サンホテルフェニックス(宮崎県)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-09-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスター生合成を担う多成分酵素系SUFマシナリーの作動機構2012

    • 著者名/発表者名
      和田啓
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      サンホテルフェニツクス(宮崎県)(ポスター発表)
    • 年月日
      2012-09-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスターのde novo合成を支える、脱硫黄酵素IscSを中心としたISC蛋白質群の相互作用2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県)
    • 年月日
      2012-06-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis of the protein-protein interactions among ISC proteins involved in de novo Fe-S clusters biosynthesis2012

    • 著者名/発表者名
      平林佳
    • 学会等名
      27th European Cryatallographic Meeting
    • 発表場所
      The Grieg Hall (ノルウェー)(ポスター発表)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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