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深海熱水域に生息する特異微生物の環境適応機構の分子的解明と地球環境修復への展開

研究課題

研究課題/領域番号 12J03037
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 水産学一般
研究機関北海道大学

研究代表者

美野 さやか  北海道大学, 水産科学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2014年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2013年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2012年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード深海底熱水活動域 / 生物地理学 / 集団遺伝学 / MLSA / Epsilonproteobacteria / N2O / Persephonella / N20 / 化学独立栄養細菌 / MALDI-TOF/MS / 群集生態学 / N_2O
研究実績の概要

本課題は、培養技術を駆使し、深海底熱水活動域に生息する特異な微生物の分離、生態学的研究、および地球環境修復への応用展開を目的としている。
2014年度は、熱水活動域に棲息するN2O還元細菌に近縁な新規微生物の性状解析を行い、新種として提唱した。具体的には、昨年度分離培養に成功した新規化学合成独立栄養細菌の性状を決定し、深海熱水活動域由来の中温性細菌で報告例のない水素酸化-チオ硫酸還元能を有し、近縁種の中では稀な絶対嫌気性細菌であることを明らかにした。本分離株をSulfurovum aggregansとして提唱し、微生物系統分類を扱う国際雑誌IJSEMにて発表した。
また、N2O還元細菌に近縁な化学合成独立栄養細菌集団の種内多様性の解明に向けて、新たな微生物分離株の遺伝子情報を加え、ゲノムレベルの遺伝的多様性解析に成功した。具体的には、昨年度得られた新規沖縄トラフ熱水サイト由来の分離株のもつ11個の遺伝子塩基配列を決定し、これらの分離株を含め、4海域15フィールド(サイト)由来の微生物分離株の種内遺伝的多様性の比較を可能とした。本遺伝子解析から、海域に固有の遺伝的特徴を有する微生物集団が存在することを突き止めた。
さらに、米国Woods Hole Oceanographic Institutionが実施した東太平洋海膨熱水活動域の調査航海に参加し、25種類に及ぶ熱水活動域由来の試料を採取した。これまで本海域由来の分離株が持つ遺伝子情報を上記の遺伝的多様性解析に考慮できておらず、本熱水性試料は全球規模の微生物遺伝的多様性の解明に向けて極めて重要である。これらの熱水性試料から、既に12株以上の分離株を取得しており、今後、新たな分離株を用いてN2O還元能の評価および微生物集団の遺伝的多様性解析に取り組む予定である。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Sulfurovum aggregans sp. nov., a novel hydrogen-oxidizing, thiosulfate-reducing chemolithoautotroph within the Epsilonproteobacteria isolated from a deep-sea hydrothermal vent chimney at the Central Indian Ridge, and an emended description of the genus Sulfurovum.2014

    • 著者名/発表者名
      Mino S, Kudo H, Arai T, Sawabe T, Takai K, Nakagawa S.
    • 雑誌名

      IJSEM

      巻: 64 号: Pt_9 ページ: 3195-3201

    • DOI

      10.1099/ijs.0.065094-0

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Biogeography of Persephonella in deep-sea hydrothermal vents of the Western Pacific.2014

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Mino, Hiroko Maikita, Tomohiro Toki, Junichi Miyazaki, Shingo Kato, Hiromi Watanabe, Hiroyuki Imachi, Tomo-o Watsuji, Takuro Nunoura, Shigeaki Kojima, Tomoo Sawabe, Ken Takai, Satoshi Nakagawa
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: Volume 4, Article 107 ページ: 1-12

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Global biogeography and population structure of deep-sea vent chemolithoautotrophs inferred from multilocus sequence analysis (MLSA).2014

    • 著者名/発表者名
      Mino S.
    • 学会等名
      ISME15
    • 発表場所
      Seoul, KOREA
    • 年月日
      2014-08-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Biogeography and population genetics of deep-sea vent chemolithoautotrophs inferred from multi-locus sequence analysis (MLSA)2014

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Mino
    • 学会等名
      Ocean Science Meeting 2014
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center (USA)
    • 年月日
      2014-02-24
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する化学合成微生物の分布様式と集団構造の解明2014

    • 著者名/発表者名
      美野さやか
    • 学会等名
      BLUE EARTH'14
    • 発表場所
      東京海洋大学(東京都品川区)
    • 年月日
      2014-02-19
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 深海底熱水活動域に優占する化学合成細菌の集団遺伝構造の解明2013

    • 著者名/発表者名
      美野さやか
    • 学会等名
      極限環境生物学会2013年度
    • 発表場所
      明治大学(東京都川崎市)
    • 年月日
      2013-10-27
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 深海底熱水活動域に生息する化学合成細菌の集団遺伝構造は系統群毎に異なるか?2013

    • 著者名/発表者名
      美野さやか
    • 学会等名
      極限環境生物学会2013年度
    • 発表場所
      明治大学(東京都川崎市)
    • 年月日
      2013-10-26
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Population structure of deep-sea chemolithoautotrophs : identification of phenotypic and genotypic correlations2012

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Mino
    • 学会等名
      American Geophysical Union's 46th annual Fall Meeting
    • 発表場所
      Moscone Center (U.S.A)
    • 年月日
      2012-12-03
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Population genetic structure of deep-sea vent chemolithoautotrophs inferred from multilocus sequence analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Mino
    • 学会等名
      14th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14
    • 発表場所
      Bella Center (Denmark)
    • 年月日
      2012-08-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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