• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

アブラナ科植物における病害抵抗性遺伝子の同定と進化遺伝学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 12J05450
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 育種学
研究機関新潟大学

研究代表者

清水 元樹  新潟大学, 大学院自然科学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2012 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2013年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2012年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードアブラナ科植物 / 萎黄病抵抗性遺伝子 / Brassica rapa / RNA-Seq法 / NBS-LRR型遺伝子 / B. oleracea / Marker Assisted Selection / Brassica oleracea / 抵抗性遺伝子 / 萎黄病 / 根こぶ病 / ファインマップ / NBS-LRR
研究概要

本研究では, アブラナ科植物における抵抗性遺伝子の単離と, 抵抗性遺伝子の進化遺伝学的解析を目的に実験を行っている。萎黄病抵抗性遺伝子については, Brassica rapaの抵抗性と感受性を示す系統に対して, RNA-Seq法によって系統間で発現量が異なるNBS-LRR型遺伝子を探索した。その中で, 抵抗性系統にのみ存在するBra012688、Bra012689遺伝子から, 遺伝子マーカー(感受性系統では増幅されない)を作成し, 抵抗性・感受性系統の後代F_2分離集団に供試したところ, 各個体の遺伝子型と罹病度の間に強い関連性が示された。また, 感受性系統では, 両遺伝子の欠失により罹病化したと考えられた。これらの結果は, Bra012688, Bra012689が, B. rapaの有力な萎黄病抵抗性遺伝子であることを示唆している。なお, 2遺伝子は同じ転写方向でタンデムに位置するが, アミノ酸配列の相同性が低く最近の重複ではないと考えられた。B. oleraceaの抵抗性遺伝子については, 24年度に, キャベツ(B. oleracea)において, 抵抗性・感受性系統の後代F_2分離集団における組み換え個体を用いた接種試験により, 2つの有力なNBS-LRR型の萎黄病抵抗性候補遺伝子(FocBol-A, -B)を見出した。転写解析によって, 抵抗性系統でFocBol-Bは転写されるがORFが得られない, 一方でFocBol-AではORFが確保できた。また, 感受性系統では一塩基の挿入によりフレームシフトが起きており, FocBo1-Aの機能が喪失したと考えられた。更に, 抵抗性のFocBol-A特異的増幅マーカーによって多数のキャベツ, ブロッコリーF_1品種を用いたMAS (Marker Assisted Selection)を行ったところ, 抵抗性品種と感受性品種を完全に判別することができた。この結果は, FocBo1-Aが真の萎黄病抵抗性遺伝子であることを更に裏付け, 確実なMASの基盤を提供するものと考えられた。また, B. oleraceaのFocBol-Aは, B. rapaのBra012688のオルソログであった。全く異なる手法で同定された遺伝子が互いにオルソログであることは, これら2遺伝子が真の抵抗性遺伝子であることを強く示唆している。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (6件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of candidate genes for fusarium yellows resistance in Chinese cabbage by differential expression analysis.2014

    • 著者名/発表者名
      Shimizu M, Fujimoto R, Ying H, Pu ZJ, Ebe Y, Kawanabe T, Saeki N, Taylor JM, Kaji M, Dennis ES, Okazaki K
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology

      巻: (印刷中) 号: 3 ページ: 889-900

    • DOI

      10.1007/s11103-014-0182-0

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Accumulation of quantitative trait loci conferring broad- spectrum clubroot resistance in Brassica oleracea2013

    • 著者名/発表者名
      H. TOMITA, M. SHIMIZU, MA U. DOULLAH, R. FUJIMOTO, K. OKAZAKI
    • 雑誌名

      Mol Breeding

      巻: 32 号: 4 ページ: 889-900

    • DOI

      10.1007/s11032-013-9918-9

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Screening of DNA markers suitable for purity test of inbred lines in Brassica oleracea2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroya Tomita, Motoki Shimizu and Chiori Kume(These authors equally contributed to this work)
    • 雑誌名

      Bull. Facul. Agric. Niigata Univ.

      巻: 65(2) ページ: 137-147

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Genetic mapping of a fusarium wilt resistance gene in Brassica oleracea2012

    • 著者名/発表者名
      Zi-jing Pu and Motoki Shimizu (These two authors contributed equally to this work)
    • 雑誌名

      Mol Breeding

      巻: 30 ページ: 809-818

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Differential expression解析を用いたハクサイ萎黄病抵抗生遺伝子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      清水元樹, 江部裕介, 川辺隆大, 佐伯なつみ, 加治誠, 岡崎桂一, 藤本龍
    • 学会等名
      園芸学会秋季大会
    • 発表場所
      筑波大学(つくば市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Brassica oleracea 品種における萎黄病抵抗性遺伝子FocBo1連鎖DNA マーカーと抵抗性との関連性2013

    • 著者名/発表者名
      清水元樹, 川辺隆大, Pu Zi-jing, 藤本龍, 岡崎桂一
    • 学会等名
      育種学会秋季大会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Collinearity among a short segment having the major recognition gene complex of Arabidopsis thaliana chromosome 4 and triplicated regions within the Brassica oleracea and B. rapa2012

    • 著者名/発表者名
      清水元樹
    • 学会等名
      International symposium on Comparative Genomics and Breeding of Brassicaceae crops
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 年月日
      2012-10-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] RNA-sequence法を用いたハクサイ品種間(S11×R09)特異的なNBS-LRRモチーフ遺伝子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      清水元樹
    • 学会等名
      第122回育種学会
    • 発表場所
      京都産業大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Characterization of NBS-LRR motif genes between S11 and R09 by RNA sequencing in Brassica rapa2012

    • 著者名/発表者名
      清水元樹
    • 学会等名
      10th International Congress on Plant Molecular Biology
    • 発表場所
      韓国
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Identification of Brassica rapa homologue of fusarium wilt resistance gene, Foc-Bo1 by genome synteny analysis between B. oleracea and B.rapa2012

    • 著者名/発表者名
      清水元樹
    • 学会等名
      6^<th> International symposium on Brassica and 18^<th> Crucifer Genetics Workshop
    • 発表場所
      イタリア
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [産業財産権] 萎黄病菌抵抗性を有するポリヌクレオチド、及びその利用、並びにアブラナ科植物の萎黄病菌に対する抵抗性の判定方法2013

    • 発明者名
      岡崎桂一, 清水元樹, 藤本龍, 川邊隆大, 蒲子婧, 加治誠, 長岡朝彦
    • 権利者名
      国立大学法人・新潟大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2013-10-11
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi