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Methanosarcina属アーキアにおける膜内在性電子キャリアの生合成

研究課題

研究課題/領域番号 12J05479
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用微生物学
研究機関名古屋大学

研究代表者

小川 拓哉  名古屋大学, 生命農学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2014年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2013年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2012年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードアーキア / イソプレノイド / 生合成 / プレニル基転移酵素 / プレニル基還元酵素 / メタノフェナジン / メタン生成アーキア
研究実績の概要

1. 我々は前年度に、メタン生成アーキア由来のカロテノイド生合成酵素CrtIのホモログタンパク質を、ユニークな位置選択性を示す新奇プレニル基還元酵素として同定した。本年度はこの研究を論文1報に取りまとめ学術雑誌に掲載した [FEBS J. (2014) 281,3165]。また、本酵素の反応特異性に注目し、非天然型新奇化合物の創出への応用を試みた。本酵素と変異型フシコッカジエン合成酵素をゲラニルゲラニル二リン酸と順次反応させ、新奇構造をもった二環式ジテルペンの合成に成功した。
2. ドリコールは一部のアーキアに必須の糖キャリア脂質である。同化合物は直鎖状ポリプレノールの構造をもつが、水酸基に隣接するイソプレン単位が飽和している。我々は、アーキアにおいてこの部分飽和構造を生じる未同定の還元反応をCrtIホモログが担う可能性を考え、ドリコール生産菌である好熱好酸性アーキア由来のCrtIホモログについて機能解析を行った。組換えタンパク質を用いたin vitroアッセイ、および同タンパク質の異種発現宿主を用いたトレーサー実験を実施したが、目的の還元活性は検出されなかった。
3. Methanosarcina属やその近縁種のメタン生成アーキアが生産する2,6,10,15,19-ペンタメチルイコサン (PMI) は、地球化学の分野において脂質バイオマーカーとして有用である。しかし、PMI生合成に関する知見は一切ない。我々は、Methanosarcina属アーキアに特異的に保存されるcis-プレニル基転移酵素 (cPT) ホモログがPMI生合成に関わる可能性を考えた。この仮説を検証するため、組換えタンパク質を用いた機能解析および生成物の構造解析を行った。その結果、本酵素が通常のcPT活性に加え、ユニークなプレニル基転移反応を触媒する二機能性のプレニル基転移酵素であることが明らかになった。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] A novel geranylgeranyl reductase from the methanogenic archaeon Methanosarcina acetivorans displays unique regiospecificity.2014

    • 著者名/発表者名
      Ogawa Takuya, Isobe Keisuke, Mori Takeshi, Asakawa Susumu, Yoshimura Tohru, Hemmi Hisashi
    • 雑誌名

      FEBS Journal

      巻: 281 号: 14 ページ: 3165-3176

    • DOI

      10.1111/febs.12851

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] メタン生成アーキア由来のシス型プレニルトランスフェラーゼホモログに触媒されるhead-to-tail型およびnon-head-to-tail型縮合2015

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉、吉村徹、邊見久
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Identification and application of a novel, regiospecific geranylgeranyl reductase from the methanogenic archaeon Methanosarcina acetivorans2014

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉、磯部圭祐、浅川晋、吉村徹、邊見久
    • 学会等名
      持続可能社会構築のための酵素と微生物の科学と工学に関する新潮流 日本-イタリアシンポジウム
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Creation of unnatural compounds using a novel geranylgeranyl reductase from the methanogenic archaeon Methanosarcina acetivorans2014

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉、磯部圭祐、森健、浅川晋、吉村徹、邊見久
    • 学会等名
      日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メタン生成アーキア由来のω-末端特異的ゲラニルゲラニル基還元酵素2014

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉、磯部圭祐、森健、浅川晋、吉村徹、邊見久
    • 学会等名
      イソプレノイド研究会例会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メタン生成アーキア由来新奇プレニル基還元酵素の生理的役割2014

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉、磯部圭祐、吉村徹、邊見久
    • 学会等名
      日本ビタミン学会
    • 発表場所
      姫路
    • 年月日
      2014-06-13 – 2014-06-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メタン生成アーキアMethanosarcina acetivorans由来新奇プレニルレダクターゼの機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉
    • 学会等名
      日本農芸化学会中部支部168回例会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2013-10-12
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] アーキア膜脂質生合成に関わる新奇フラビン酵素(2)2013

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第65回大会
    • 発表場所
      明治大学
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Exploring novel enzymes involved in archaeal membrane lipid biosynthesis2013

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉
    • 学会等名
      Archaea : Ecology, Metabolism & Molecular Biology
    • 発表場所
      Renaissance Tuscany II Ciocco Resort (イタリア)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Chain length determination mechanism of geranylfarnesyl diphosphate synthase from methanogenic archaeon Methanosarcina mazei2012

    • 著者名/発表者名
      小川拓哉
    • 学会等名
      The International Conference of Natural Product Biosynthesis
    • 発表場所
      兵庫県淡路市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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