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TALEヌクレアーゼを用いた遺伝子ノックイン/ノックアウト技術の確立と応用

研究課題

研究課題/領域番号 12J06938
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関広島大学

研究代表者

佐久間 哲史  広島大学, 大学院・理学研究科, 特別研究員(PD) (90711143)

研究期間 (年度) 2012 – 2013
研究課題ステータス 採択後辞退 (2012年度)
配分額 *注記
1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2012年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードTALEN / Golden Gate法 / 人工ヌクレアーゼ / ゲノム編集
研究概要

本年度は、TALENの効率的な作製法と評価法を確立し、哺乳動物培養細胞および動物個体への応用が可能であることを確かめるため、以下の通り研究を実施した。TALENは標的のDNA配列を認識するリピートを任意の並びで組み合わせることで、配列特異的にゲノムDNAを切断できる人工ヌクレアーゼである。切断されたゲノムDNAはただちに修復されるが、この際の偶発的なエラーによって目的の遺伝子を破壊することが可能となる。Addgeneから配布されているTALEN作製キットであるGolden Gate TALEN and TAL Effector Kitは、汎用性が高く世界中で広く利用されているが、リピートの連結効率に難があり、また構築したTALENの活性評価に多くの時間を要するという難点があった。本研究では、キットのベクターに改変を加えることで、一度に連結するリピートの数を減らし、アセンブリーの成功率を飛躍的に上昇させることに成功した。また、TALENの活性評価法として、ヒト培養細胞であるHEK293T細胞を用いたアッセイ系を採用することで、オリジナルの酵母でのアッセイ系と比べて大幅な時間短縮と作業効率の向上を実現した。本研究によって確立されたTALENの作製システムは、既に国内外で広く使用されており、ヒトiPS細胞を含む哺乳動物培養細胞に加え、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、アフリカツメガエル、ラットなど様々な動物に適用可能であることが示されている。本研究で開発した改変ベクターは、近くオリジナルのキットのアドオンとして配布が開始される見込みであり、今後世界中で更なる利用が期待される。

報告書

(1件)
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Efficient gene targeting by TAL effector nucleases coinjected with exonucleases in zygotes2013

    • 著者名/発表者名
      Tomoji Mashimo
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 3 号: 1 ページ: 1253-1253

    • DOI

      10.1038/srep01253

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High efficiency TALENs enable F0 functional analysis by targeted gene disruption in Xenopus laevia embryos2013

    • 著者名/発表者名
      Ken-ichi T Suzuki
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative assay for TALEN activity at endogenous genomic loci.2013

    • 著者名/発表者名
      Hisano Y.
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: BIO20133871 号: 4 ページ: 363-367

    • DOI

      10.1242/bio.20133871

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient TALEN construction and evaluation methods for human cell and animal applications.2013

    • 著者名/発表者名
      Sakuma T, Hosoi S, Woltjen K, Suzuki KI, Kashiwagi K, Wada H, Ochiai H, Miyamoto T, Kawai N, Sasakura Y, Matsuura S, Okada Y, Kawahara A, Hayashi S, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: (In press) 号: 4 ページ: 315-326

    • DOI

      10.1111/gtc.12037

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The 3'UTR of Nanos2 directs enrichment in the germ cell lineage of the sea urchin2013

    • 著者名/発表者名
      Nathalie Oulhen
    • 雑誌名

      Developmental Biology

      巻: (in press) 号: 1 ページ: 275-283

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2013.01.019

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient targeted mutagenesis in medaka using custom-designed transcription activator-like effector nucleases (TALENs)2013

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ansai
    • 雑誌名

      Genetics

      巻: 193 号: 3 ページ: 739-749

    • DOI

      10.1534/genetics.112.147645

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancer activity sensitive to the orientation of the gene it regulates in the chordate genome2013

    • 著者名/発表者名
      Akiko Hozumi
    • 雑誌名

      Developmental Biology

      巻: 375 号: 1 ページ: 79-91

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2012.12.012

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] TALE nuclease (TALEN)を用いた培養細胞におけるゲノム編集2013

    • 著者名/発表者名
      落合博
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 31 ページ: 95-100

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Non-transgenic genome modifications in a hemimetabolous insect using zinc-finger and TAL effector nucleases.2012

    • 著者名/発表者名
      Watanabe T, Ochiai H, Sakuma T, Horch HW, Hamaguchi N, Nakamura T, Bando T, Ohuchi H, Yamamoto T, Noji S, Mito T.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 3 号: 1 ページ: 1017-1017

    • DOI

      10.1038/ncomms2020

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Zinc-finger nuclease-mediated targeted insertion of reporter genes for quantitative imaging of gene expression in sea urchin embryos.2012

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H, Sakamoto N, Fujita K, Nishikawa M, Suzuki K, Matsuura S, Miyamoto T, Sakuma T, Shibata T, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 109 号: 27 ページ: 10915-10920

    • DOI

      10.1073/pnas.1202768109

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient targeted mutagenesis of the chordate Ciona intestinalis genome with zinc-finger nucleases.2012

    • 著者名/発表者名
      Kawai N, Ochiai H, Sakuma T, Yamada L, Sawada H, Yamamoto T, Sasakura Y.
    • 雑誌名

      Development, Growth & Differentiation

      巻: 54 号: 5 ページ: 535-545

    • DOI

      10.1111/j.1440-169x.2012.01355.x

    • NAID

      10031136923

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 人工ヌクレアーゼを用いたゲノム編集2012

    • 著者名/発表者名
      佐久間哲史
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: 38 ページ: 328-329

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人工ヌクレアーゼを利用したゲノム編集研究の現状2012

    • 著者名/発表者名
      佐久間哲史
    • 学会等名
      第2回ゲノム編集研究会
    • 発表場所
      愛知県岡崎市
    • 年月日
      2012-09-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Improved TALEN construction and evaluation methods for animal and human cell applications2012

    • 著者名/発表者名
      Tetsushi Sakuma
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conference Genome Engineering - Research & Applications
    • 発表場所
      Lucca, Italy
    • 年月日
      2012-09-03
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Advanced methods for the construction, evaluation and application of TALENs2012

    • 著者名/発表者名
      Tetsushi Sakuma
    • 学会等名
      Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists & The 64th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology
    • 発表場所
      兵庫県神戸市
    • 年月日
      2012-05-28
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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