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単一生細胞内における複数種mRNA蛍光イメージング法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 12J08481
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 分析化学
研究機関東京大学

研究代表者

山田 俊理  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2012年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードバイオテクノロジー / 一分子イメージング / RNA / 選択的スプライシング / トロポミオシン / 蛍光タンパク質再構成法
研究実績の概要

本申請研究においては、生きた細胞内のRNA分子を特異的に標識する機能性分子プローブを開発することで、内在性のRNA動態を一分子レベルで解明することを目的とした。具体的には、単一の遺伝子から選択的スプライシングによって産生される複数種のmRNA(トロポミオシン mRNA)を生きた細胞内において、同時蛍光観察する手法の開発を行うこととした。さらには、染色体末端のテロメア領域から産生される非翻訳性長鎖RNAであるテロメアRNAの動態を解析することを目指した。
基本的なプローブの構造は、RNA結合タンパク質PUM1と蛍光タンパク質の断片を融合したものとした。対象RNAの特異的な配列をPUM1の結合配列とし、変異体PUMを作製した。この変異体PUMに蛍光タンパク質の断片を融合させた。本プローブは、対象のRNAに結合して初めて蛍光を発する。プローブの蛍光を蛍光顕微鏡を用いて検出することで、細胞内のRNA量および分布が明らかとなる。
生きた細胞内のRNAの動態を一分子レベルで解析した結果、トロポミオシンは成長因子存在下では、選択的スプライシングの結果、局在が変化することが明らかとなった。また、テロメアRNAに関しては、一過的にテロメア領域に局在する現象を発見した。本研究課題において開発したRNAイメージング技術は、既存の方法では観察できなかった現象を可視化することに成功した。また、このRNAイメージング技術は多様なRNA種に対して応用可能であり、今後普遍的なRNA解析技術となりうることが期待される。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli2014

    • 著者名/発表者名
      Imamura K, Imamachi N, Akizuki G, Kumakura M, Kawaguchi A, Nagata K, Kato A, Kawaguchi Y, Sato H, Yoneda M, Kai C, Yada T, Suzuki Y, Yamada T, Ozawa T, Kaneki K, Inoue T, Kobayashi M, Kodama T, Wada Y, Sekimizu K and Akimitsu N.
    • 雑誌名

      Molecular cell

      巻: 53 号: 3 ページ: 393-406

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2014.01.009

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Single molecule imaging of TERRA in living cells2015

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、瀬川尋貴、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      千葉県、日本大学 船橋キャンパス
    • 年月日
      2015-03-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内における内在性テロメアRNAの動態解析2014

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、瀬川尋貴、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      第4回 CSJ化学フェスタ
    • 発表場所
      東京、タワーホール船掘
    • 年月日
      2014-10-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] A method to visualize endogenous long non-coding RNA with single molecule level2014

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、瀬川尋貴、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      北海道、札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Live-cell imaging of telomere-repeat containing RNA with single molecule sensitivity2014

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、瀬川尋貴、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      第37回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      北海道 ニセコ
    • 年月日
      2014-07-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Fluorescence Imaging of Telomeric Repeat-Containing RNA in Living Cells2014

    • 著者名/発表者名
      山田俊理, 吉村英哲, 服部満, 小澤岳昌
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2014-03-27
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生きた細胞内における内在性テロメアRNAの一分子動態解析2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理, 吉村英哲, 服部満, 小澤岳昌
    • 学会等名
      日本生物物理学会第51回年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府)
    • 年月日
      2013-10-28
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内における内在性テロメリアRNA可視法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理, 吉村英哲, 服部満, 小澤岳昌
    • 学会等名
      CSJ化学フェスタ2013
    • 発表場所
      タワーホール船掘(東京都)
    • 年月日
      2013-10-21
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Fluorescent Probes for single molecule imaging of non-engineered RNAs in living cells2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、小澤岳昌
    • 学会等名
      Seeing is Believing Imaging the Processes of Life
    • 発表場所
      Heidelberg (EMBL)
    • 年月日
      2013-10-05
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 緑色蛍光タンパク質を利用した内在性テロメアRNAの一分子イメージング法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      日本分析学会第62年会
    • 発表場所
      近畿大学(大阪府)
    • 年月日
      2013-09-10
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] A FIuorescent Probe to Visualize Telomeric RNAs in Living Cells with Single Molecule Sensitivity2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理、吉村英哲、瀬川尋貴、服部満、小澤岳昌
    • 学会等名
      RSC Tokyo International Conference 2013
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉県)
    • 年月日
      2013-09-05
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 緑色蛍光タンパク質を利用した生細胞内テロメアRNA可視化法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館(滋賀)
    • 年月日
      2013-03-23
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Visualization of Single β-actin mRNA Using Fluorescence Reconstitution Technique2013

    • 著者名/発表者名
      山田俊理
    • 学会等名
      第14回国際細胞膜研究フォーラム
    • 発表場所
      京都大学(京都)
    • 年月日
      2013-03-16
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A Fluorescent Probe for Visualizing Non-Engineered mRNA with Single Molecule Sensitivity2012

    • 著者名/発表者名
      山田俊理
    • 学会等名
      The Seventh International Forum on chemistry of Functional Organic Chemicals
    • 発表場所
      東京大学(東京)
    • 年月日
      2012-11-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] A Genetically Encoded Probe for Imaging Non-Engineered mRNA dynamics with Single Molecule Sensitivity2012

    • 著者名/発表者名
      山田俊理
    • 学会等名
      RSC Tokyo International Conference 2012
    • 発表場所
      幕張メッセ(千葉)
    • 年月日
      2012-09-07
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 生細胞内における内在性mRNAの一分子蛍光イメージング法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      山田俊理
    • 学会等名
      第72回分析化学討論会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島)
    • 年月日
      2012-05-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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