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植物スフィンゴ脂質代謝酵素の機能同定と分子育種への利用

研究課題

研究課題/領域番号 12J10084
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関埼玉大学

研究代表者

石川 寿樹  埼玉大学, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2012 – 2015-03-31
研究課題ステータス 採択後辞退 (2014年度)
配分額 *注記
3,630千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2013年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2012年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードスフィンゴリピドミクス / LC-MS/MS / 長鎖塩基不飽和化 / イネ / シロイヌナズナ / スフィンゴ糖脂質 / 酸化ストレス耐性 / 低温ストレス耐性
研究概要

植物のスフィンゴ脂質には親水性糖鎖構造の異なる複数のクラスが存在し、さらにセラミド骨格の不飽和化及び水酸化に起因する構造多様性により、少なくとも数百種に及ぶ分子種が存在する。植物スフィンゴ脂質が担う役割とその制御機構を分子レベルで解明するためには、このような多様な分子種を生み出す代謝系全体を包括的に理解することが必要である。昨年度までに確立した、植物のスフィンゴ脂質分子種を網羅的に定量解析するスフィンゴリピドミクスの手法を用い、本年度はさらにスフィンゴ脂質とストレス耐性との関連性を追求した。はじめに、低温ストレスに高い感受性を示すスフィンゴ脂質不飽和化酵素SLD変異体および細胞死抑制因子BI-1欠損シロイヌナズナの低温応答とストレス耐性におけるスフィンゴ脂質代謝動態の解析により、低温に曝されたシロイヌナズナでは、長鎖塩基不飽和化を中心としたスフィンゴ糖脂質合成系の体系的な制御によるスフィンゴリピドーム再構成が起こり、それがシロイヌナズナの長期低温ストレス耐性に寄与することを明らかにした。
さらにスフィンゴ脂質代謝改変イネの脂質プロファイリングにより、長鎖塩基Δ4位及びΔ8位の不飽和化が、イネスフィンゴ糖脂質生合成系においてそれぞれ異なる様式で律速段階となっていることを明らかにした。このうち特にΔ4不飽和化酵素はBI-1と物理的・機能的に相互作用しており、過剰発現させることによりイネの酸化ストレス耐性が向上することを見出した。また本手法を膜脂質に拡張し、これまで解析が困難であった微量膜画分の脂質組成決定を容易に行うことができるようになった。以上の成果は、ストレス下における植物のスフィンゴ脂質代謝応答を分子レベルで初めて説明するものであり、今後の分子育種利用におけるスフィンゴ脂質代謝改変の有用性を期待させるものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

確立したスフィンゴリピドミクスの手法が様々な植物種に適用可能で、ストレス応答性や代謝改変の評価を迅速かつ網羅的に行うことができるようになったことは非常に大きな成果である。さらにこれまで困難であった膜脂質や酵素代謝産物等の微量成分への適用が可能であることも確認しており、より詳細な脂質分子や代謝酵素の機能解析、さらには代謝改変による分子育種に向けた今後の発展研究の基盤となる技術を確立することができた。

今後の研究の推進方策

本課題では、低温応答や酸化ストレスに対するスフィンゴ脂質の代謝応答や機能の一端を明らかにした。また代謝酵素の改変により、植物のストレス耐性が強化できることを見出した。今後はより詳細な分子機構に迫ると共に、様々なストレス種に対する応答性及び耐性機能を解析することで、スフィンゴ脂質代謝改変の有用性を検証していく必要がある。また確立した分析手法は、植物はもちろん他の生物種にも適用可能である点で優れている。今後は対象をモデル植物に限らず実用作物等に拡大することで、より現実的なストレス耐性分子育種を目指したスフィンゴ脂質機能研究の展開が期待される。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (11件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Development of an LC-MS/MS method for the analysis of free sphingoid bases using 4-fluoro-7-nitrobenzofurazan (NBD-F).2014

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa T, Imai, H, and Kawai-Yamada M.
    • 雑誌名

      Lipids

      巻: 49 号: 3 ページ: 295-304

    • DOI

      10.1007/s11745-013-3871-6

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Culture temperature affects gene expression and metabolic pathways in the 2-methylisoborneol-producing cyanobacterium Pseudanabaena galeata.2014

    • 著者名/発表者名
      Kakimoto M, ahikawa T, Miyagi A, Saito K, Miyazaki M, Asaeda T, Yamaguchi M, Uchimiya H, and Kawai-Yamada M.
    • 雑誌名

      J. Plant Physiol.

      巻: 171 号: 3-4 ページ: 292-300

    • DOI

      10.1016/j.jplph.2013.09.005

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nitrate addition alleviates ammonium toxicity without lessening ammonium accumulation, organic acid depletion and inorganic cation depletion in Arabidopsis thaliana shoots2012

    • 著者名/発表者名
      Hachiya T, Watanabe CK, Fujimoto M, Ishikawa T, Takahara K, Kawai-Yamada M, Uchimiya H, Uesono Y, Terashima I, Noguchi K
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 53 号: 3 ページ: 577-591

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs012

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis Bax inhibitor-1 promotes sphingolipid synthesis during cold stress by interacting with ceramide-modifying enzymes.

    • 著者名/発表者名
      Nagano M, Ishikawa T, Ogawa Y, Iwabuchi M, Nakasone A, Shimamoto K, Uchimiya H, Kawai-Yamada M.
    • 雑誌名

      Planta

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis glycerol-3-phosphate permease 4 is localized in the plastids and involved in the accumulation of seed oil.

    • 著者名/発表者名
      Kawai H, Ishikawa T, Mitsui T, Kore-eda S, Yamada-Kawai M, and Ohnishi J.
    • 雑誌名

      Plant Biotech.

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ストレス誘導性細胞死制御に関与する細胞膜マイクロドメインタンパク質.2014

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学(富山)
    • 年月日
      2014-03-18
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Bax inhibitor-1-mediated remodeling of plasma membrane microd omain confers resistance to stress-induced cell death.2013

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamada M.
    • 学会等名
      The 5th Asian Symposium on Plant Lipids
    • 発表場所
      キムデジュンコンベンションセンター(韓国・光州)
    • 年月日
      2013-11-29
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナの低温応答におけるスフィンゴリピドーム解析.2013

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、中曽根光、長野稔、内宮博文、川合真紀.
    • 学会等名
      第26回植物脂質シンポジウム
    • 発表場所
      北海道大学(札幌)
    • 年月日
      2013-09-15
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナの低温応答におけるスフィンゴ脂質代謝動態2013

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、中曽根光、長野稔、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌)
    • 年月日
      2013-09-13
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] スフィンゴリピドミクスによるイネ長鎖塩基不飽和化機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、中曽根光、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第54回植物生理学会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • 年月日
      2013-03-21
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 植物スフィンゴ脂質分子種の迅速同定法および一斉定量解析法の開発.2013

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第8回メタボロームシンポジウム
    • 発表場所
      九州大学(福岡)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] イネスフィンゴ脂質分子種のLC-MS/MS解析2012

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第25回植物脂質シンポジウム
    • 発表場所
      甲南大学(兵庫県)
    • 年月日
      2012-12-01
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] スフィンゴ脂質代謝制御によるBax inhibitor-1のストレス耐性機構2012

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第25回植物脂質シンポジウム
    • 発表場所
      甲南大学(兵庫県)
    • 年月日
      2012-11-30
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] イネのスフィンゴ脂質代謝と酸化ストレス耐性における長鎖塩基不飽和化酵素の役割2012

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第76回日本植物学会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2012-09-16
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] イネの酸化ストレス誘導性細胞死における細胞膜マイクロドメインの役割とその制御2012

    • 著者名/発表者名
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • 学会等名
      第30回日本植物細胞分子生物学会
    • 発表場所
      奈良先端科学技術大学(奈良県)
    • 年月日
      2012-08-05
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of oxidative stress-induced cell death via sphingolipid metabolism and remodeling of plasma membrane microdomain2012

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamada M.
    • 学会等名
      20th International Symposium on Plant Lipids
    • 発表場所
      Hotel Melia Lebreros (スペイン)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Methods in Enzymology2013

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamasa M.
    • 総ページ数
      18
    • 出版者
      Elsevier
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://park.saitama-u.ac.jp/~geneenvtech/

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2013-04-25   更新日: 2024-03-26  

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