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F_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの固体NMR法による構造決定

研究課題

研究課題/領域番号 13033012
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

藤原 敏道  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教授 (20242381)

研究分担者 八木 宏昌  大阪大学, たんぱく質研究所, 助手 (70332749)
研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2002年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2001年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード固体NMR / 安定同位体標識 / タンパク質高次構造 / 膜タンパク質 / F_0F_1-ATP合成酵素
研究概要

固体NMR測定のために安定同位体を用いたF_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの調製し脂質膜に再構成する法を確立し,固体2次元NMR実験を行った。
^<13>C,^<15>N完全標識には,大腸菌の大量発現系を用いた.精製は,有機溶媒を用いる方法で効率よく精製できることがわかった.再構成のためには、界面活性剤を加えて可溶化した後に、透析して膜に埋め込む方法が有効であることがわかった。完全標識したサブユニットcの^<13>C-^<13>C等方化学シフト相関スペクトルおよび^<15>N-^<13>C相関スペクトルを測定した。得られたスペクトルから、等方化学シフトを解析することにより、二次構造としてはαヘリックスが主であること、これ以外に、10分の1弱程度の残基が分子鎖が伸びた状態であることがわかった。これは、溶液NMRから提出されている構造とほぼ一致するものである。このように多次元NMRスペクトルに基ずく等方化学シフトの解析が構造解析に有効であることがわかった。現在さらに定量的な解析を行うために、原子座標から固体多次元NMRスペクトルをシュミレーションする方法を開発している。
^<13>C選択的標識サブユニットcについては、分子間の距離を測定するために、標識サブユニットcを天然存在比のサブユニットcで希釈した試料を作り、固体NMRの回転共鳴実験を行った。これにより4次構造に関する情報を得ることが期待できた。
まだ固体NMRスペクトルから2次構造の解析を行っている段階で、サブユニットcの構造決定に至っていないが、測定条件と測定法、解析法の確立により,これからの固体NMRによる3次および4次構造決定のための基礎ができた.

報告書

(2件)
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (8件)

  • [文献書誌] K.Sugase: "Designing Analogos of Mini Atrial Natriuretic Peptide Based on Structural Analysis by NMR and Restrained Molecular Dynamics"J.Medicinal Chem.. 45. 881 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.Y.Nosaka: "Photoinduced Changes of Surface and Adsorbed Water in TiO_2 Photocatalytic Systems as Studied by Solid State ^1H-NMR"Chemistry Letters. 2002. 420 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] E.Harada: "Redox-Coupled Conformational Alternations in Cytochrome c_3 from D. vulgaris Miyasaki F on the basis of its Reduced Solutuion Structure"J.Mol.Biol.. 319. 767 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Sato: "Synthesis of a Membrane Protein with Two Transmembrane Regions"J.Peptide Sci.. 8. 172 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.K.Khitrin: "Phase-Modulated Heteronuclear Decoupling in NMR of Solids"J.Magn.Reson.. (印刷中). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Matsuki: "Band-Selective Recoupling of Homonuclear Double-Quantum Dipolar Interaction with a Generalized Composite 0° Pulse"J.Magn.Reson.. (印刷中). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kenji Sugase: "Designing Analogos of Mini Atrial Natriuretic Peptide Based on Structural Analysis by NMR and Restrained Molecular Dynamics"J.Medical.Chem.. (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Atsuko Y.Nosaka: "Characterization of Water in TiO_2 Photocatalytic Systems by Solid State ^1H-NMR Spectroscopy"Chemistry Letters. (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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