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RNAエディティングによるDNAゲノム情報の変換-葉緑体ゲノムでの網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 13201001
研究種目

特定領域研究(C)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

杉浦 昌弘  名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 教授 (80027044)

研究分担者 小保方 潤一  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667)
櫻井 宣彦  名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 講師 (00255233)
研究期間 (年度) 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
6,700千円 (直接経費: 6,700千円)
2001年度: 6,700千円 (直接経費: 6,700千円)
キーワードRNAエディティング / タバコ / 葉緑体 / エンドウ / in vitro系 / mRNA / シス配列 / トランス因子
研究概要

葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。そこで最も研究の進んでいる、タバコ葉緑体を用いて以下の解析を進めている。
1)RNAエディティング部位の網羅的同定
組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域とそれ以外の転写領域を調べる必要がある。新たにrps2 mRNAに部位を発見した。ついで、エンドウ葉緑体でも調査を開始し、8ケ所の部位を同定した。
2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定
タバコ単離葉緑体より開発したin vitro RNAエディティング系を用いて、タバコ葉緑体psbE mRNAとpetB mRNAのシス配列を同定し、合わせて両者のトランス因子の同定も行った。

報告書

(1件)
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] Hirose, T.: "Involvement of a site-specific trans-acting factor and a common RNA-binding protein in the editing of chloroplast mRNAs"EMBO J.. 20. 1144-1152 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Arnaud, P.: "Analysis of the SINE S1 Pol III promoter from Brassica"Plant Journal. 26. 295-305 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Tsudzuki, T.: "Comparative analysis of RNA editing sites in higher plant chloroplasts"J.Mol.Evol.. 53. 327-332 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Wakasugi, T.: "The genomics of land plant chloroplasts: Gene content and alternation of genomic information by RNA editing"Photosynthesis Res.. 70. 107-118 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yukawa, Y.: "A tobacco nuclear extract supporting transcription,processing,splicing and modification from plant intron-containing tRNA precursors"Plant Journal. 28. 583-594 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura T.: "Chloroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosome-free mRNAs in the stroma"J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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