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「小腸-膵β細胞」を枢軸とした候補遺伝子プールの構築による糖尿病遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 13204008
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関群馬大学

研究代表者

堀川 幸男  群馬大学, 生体調節研究所, 助教授 (10323370)

研究期間 (年度) 2000 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
36,400千円 (直接経費: 36,400千円)
2004年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2003年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2002年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2001年度: 10,000千円 (直接経費: 10,000千円)
キーワードEST / MODY / 2型糖尿病 / SNP / マイクロアレイ / 関連解析 / HNF / アデノウィルス
研究概要

日本人2型糖尿病は「インスリン分泌不全」を第一義的理由とするため、若年発症成人型糖尿病は良いモデル疾患である。現在まで6種類の若年発症成人型糖尿病の原因遺伝子が同定されているが、これらの遺伝子は同一カスケード内で相互に機能連関したHNF転写因子をコードする。しかも発生原基が膵β細胞と共通である小腸ですべて発現している。そこで膵β細胞と小腸の共通発現遺伝子群を網羅すべく発現遺伝子(EST)を大量集積してきた。ヒト膵島腫瘍細胞の25753個のESTの分類化、集団化(クラスタリング)を施行し、膵島発現遺伝子データベースと照合した結果、3103種類の既知遺伝子と3054種類の未知遺伝子を獲得した。そして新たに3384個のESTが膵島に発現していることを明らかにできた。さらに機能別分布も施行し、遺伝子発現・蛋白生成に関与するESTが既知のものでは最も多く256種類を占めることを確認した。そして転写因子のESTからなる独自のマイクロアレイを作成して解析し、膵、肝、小腸に共通に発現する12個の新規糖尿病候補転写因子を獲得した。また糖尿病候補転写因子HIF-1αを用いた関連解析を施行し、糖尿病発症に係る変異(P582S)を同定した。次にラット膵島並びにRINm5FのESTを合計40170個採取し、分類化、クラスタリングを施行し、4078種類の既知遺伝子と6328種類の未知遺伝子を獲得した後、上記ラットのESTをプローブとして用いて現在まで3326種類のラージスケールin situハイブリを行い129個の膵島特異的発現遺伝子を獲得した。また2型糖尿病を含むストレス関連疾患の発症機構解明のためラット海馬の発現遺伝子も網羅し7173種類のESTを獲得したり、合併症の遺伝素因を網羅するため、先ずラットの網膜発現遺伝子に関しても約13000個のESTを獲得した。

報告書

(5件)
  • 2005 研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2005 2004 2003 2002 その他

すべて 雑誌論文 (24件) 文献書誌 (12件)

  • [雑誌論文] Genetic variants in the calpain-10 gene and the development of type2 diabetes in the Japanese population2005

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki N, et al.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 50

      ページ: 92-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Gene expression profile in rat pancreatic islet and RINm5F cells2005

    • 著者名/発表者名
      Wang H, et al.
    • 雑誌名

      J Mol Endocrinol 35

      ページ: 1-12

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variation in the HIF-1α gene is associated with type 2 diabetes in Japanese2005

    • 著者名/発表者名
      Yamada N, et al.
    • 雑誌名

      J Clin Ehdocrinol Metab 90

      ページ: 5841-5847

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variants in the calpain-10 gene and the development of type2 diabetes in the Japanese population.2005

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki N, et al.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 50

      ページ: 92-98

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variation in the HIF-la gene is associated with type 2 diabetes in Japanese2005

    • 著者名/発表者名
      Yamada N, et al.
    • 雑誌名

      J Clin Endocrinol Metab 90

      ページ: 5841-5847

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variants in the calpain-10 gene and the development of type2 diabetes in the Japanese population2005

    • 著者名/発表者名
      Iwasaki N, et al.
    • 雑誌名

      J Hum Genet (in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification of a de novo case of hepatocyte nuclear factor-1β mutation with highly varied phenotypes2004

    • 著者名/発表者名
      Shihara N, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 47

      ページ: 1128-1129

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variations in the WFS1 gene in Japanese with type 2 diabetes and bipolar disorder2004

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto T, et al.
    • 雑誌名

      Mol Genet Metab 82

      ページ: 238-245

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Expression profile of mRNAs from rat hippocampus and its application to microarray2004

    • 著者名/発表者名
      Tanaka T, et al.
    • 雑誌名

      Brain Res Mol Brain Res 129

      ページ: 20-32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of a de novo case of hepatocyte nuclear factor-1β mutation with highly varied phenotypes.2004

    • 著者名/発表者名
      Shihara N, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 47

      ページ: 1128-1129

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variations in the WFSI gene in Japanese with type 2 diabetes and bipolar disorder.2004

    • 著者名/発表者名
      Kawamoto T, et al.
    • 雑誌名

      MolGenetMetab 82

      ページ: 238-245

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profile of mRNAs from rat hippocampus and its application to microarray.2004

    • 著者名/発表者名
      Tanaka T, et al.
    • 雑誌名

      Brain Res Mol Brain Res 129

      ページ: 20-32

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of de novo case of hepatocyte nuclear factor-1 deficiency with highly varied phenotypes2004

    • 著者名/発表者名
      Shihara N, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 47

      ページ: 1128-1129

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Expression profile of mRNAs from rat hippocampus and its application to microarray2004

    • 著者名/発表者名
      Tanaka T, et al.
    • 雑誌名

      Mol Brain Res 129

      ページ: 20-32

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Genetic variations in calpain-10 gene are not a major factor in the occurrence of type 2 diabetes in Japanese2003

    • 著者名/発表者名
      Horikawa Y, et al.
    • 雑誌名

      J Clin Endocrinol Metab 88

      ページ: 244-247

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] T130I mutation in HNF-4α gene is a loss-of-function mutation and is associated with late-onset type 2 diabetes in Japanese subjects2003

    • 著者名/発表者名
      Zhu Q, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 46

      ページ: 567-573

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profile of mRNAs from human pancreatic islet tumors2003

    • 著者名/発表者名
      Jin L, et al.
    • 雑誌名

      J Mol Endocrinol 31

      ページ: 519-528

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Meta-analysis confirms a role for Calpain-10 variation in type 2 diabetes suscentibility2003

    • 著者名/発表者名
      Weedon MN, et al.
    • 雑誌名

      Am J Hum Genet 73

      ページ: 1208-1212

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genetic variations in calpain-10 gene are not a major factor in the occurrence of type 2 diabetes in Japanese2003

    • 著者名/発表者名
      Horikawa Y, et al..
    • 雑誌名

      J Clin Endocrinol Metab 88

      ページ: 244-247

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] T130I mutation in HNF-4a gene is a loss-of-function mutation and is associated with late-onset type 2 diabetes in Japanese subjects2003

    • 著者名/発表者名
      Zhu Q, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 46

      ページ: 567-573

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression profile of mRNAs from human pancreatic islet tumors.2003

    • 著者名/発表者名
      Jin L, et al.
    • 雑誌名

      J Mol Endocrinol 31

      ページ: 519-528

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Meta-analysis confirms a role for Calpain-10 variation in type 2 diabetes susceptibility2003

    • 著者名/発表者名
      Weedon MN, et al.
    • 雑誌名

      Am J Hum Genet 73

      ページ: 1208-1212

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] High frequency of mutations in the HNF-1α gene in non-obese patients with diabetes of youth in Japanese and identification of a case of digenic inheritance.2002

    • 著者名/発表者名
      Tonooka N, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 45

      ページ: 1709-1712

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] High frequency of mutations in the HNF-la gene in non-obese patients with Diabetes of youth in Japanese and identification of a case of digenic inheritance2002

    • 著者名/発表者名
      Tonooka N, et al.
    • 雑誌名

      Diabetologia 45

      ページ: 1709-1712

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Jin L, et al.: "Expression profile of mRNAs from human pancreatic islet tumors"J Mol Endocrinol. 31. 519-528 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Horikawa Y. et al.: "Genetic variations in calpain-10 gene are not a major factor in the occurrence of type 2 diabetes in Japanese"J Clin Endocrinol Metab. 88. 244-247 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Zhu Q.et al.: "T130l mutation in HNF-4a gene is a loss-of-function mutation and is associated with late-onset type 2 diabetes in Japanese subjects"Diabetologia. 46. 567-573 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Lynn, S. et al.: "Variation in the calpain-10 gene affects blood glucose levels in the British population"Diabetes. 51. 247-250 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fullerton, S.M. et al.: "Geographic and haplotype structure of candidate type 2 diabetes susceptibility variants at the calpain-10 locus"Am. J. Hum. Genet.. 70. 1096-1106 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ehrmann, D.A. et al.: "Relationship of calpain-10 genotype to phenotypic features of polycystic ovary syndrome"J Clin Endocrinol Metab. 87. 1669-1673 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Shore, A.C.et al.: "Association of the calpain-10 gene with microvascular function"Diabetologia. 45. 899-904 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Tonooka N. et al.: "High frequency of mutations in the HNF-1αgene in non-obese patients with diabetes of youth in Japanese and identification of a case of digenic inheritance"Diabetologia. 45. 1709-1712 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Del Bosque-Plata, L., et al.: "β-cell transcription factors and diabetes : no evidense for diabetes-associat ed mutations in the coding region of the proendocrine neurogenin 3 gene (NEUROG3) in Japanese patients with MODY"Diabetes. 50. 694-696 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yang, X., et al.: "Reduced skeletal muscle calpain-10 transcript level is due to a cumulative decrease in major isoforms"Mol. Genet. Metab. 73(1). 111-113 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Sreenan, S.K., et al.: "Calpains play a role in insulin secretion and action"Diabetes. 50. 2013-2020 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Evans, J.C., et al.: "Association studies of the calpain-10 gene with type 2 diabetes mellitus in the United Kingdom"Am. J. Hum. Genet. 69(3). 544-552 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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