ヒト21・22番染色体をモデルとする遺伝子発現制御機構の解析

• 研究課題/領域番号: 13204026
• 研究種目: 特定領域研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 丸山 和夫 東京医科歯科大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助教授 (90165944)
• 研究期間 (年度): 2001
• 研究課題ステータス: 完了 (2001年度)
• 配分額: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円); 2001年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
• キーワード: 遺伝子発現 / 発現制御 / 21番染色体 / 22番染色体 / マイクロアレイ / クラスタリング

研究概要

本研究は、染色体の全塩基配列情報とマイクロアレイ技術を使って、染色体のマクロ構造と遺伝子発現制御の関連を解析することを目的としている。
ヒト21番・22番染色体には、それぞれ225個・545個の遺伝子があると予想されているが、昨年度はそのうち計152遺伝子のマイクロアレイ化を行い解析した。今年度は、昨年分と合わせてマイクロアレイ化した計449遺伝子について解析を行った。内訳は、21番染色体が142遺伝子、22番染色体から307遺伝子であり、発現している遺伝子をほぼ網羅していると考えられる。解析に用いたサンプルは、薬剤(DNAメチル化やヒストンのアセチル化、その阻害剤など)で処理した様々な細胞のRNAである。
高密度の解析を行うために公開情報の利用を検討したが、信頼度の高い解析結果は得られなかった。現在、クラスタリング解析を進めるとともに、データの信頼性を高めるための更正系を構築している。