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膜タンパク質の膜貫通領域におけるタンパク質-タンパク質相互作用の検出

研究課題

研究課題/領域番号 13206061
研究種目

特定領域研究(C)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関九州大学

研究代表者

阿部 義人  九州大学, 医学研究院, 助手 (60315091)

研究期間 (年度) 2001
研究課題ステータス 完了 (2001年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2001年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
キーワード膜タンパク質 / タンパク質間相互作用 / 化学修飾 / バンド3タンパク質 / 質量分析計
研究概要

本研究はタンパク質の疎水性の膜貫通領域の相互作用をどう評価するかを主眼として、系統的に膜タンパク質の機能、構造を見ていくことを目的とする。本研究期間での具体的な研究目的は膜タンパク質の相互作用の検出方法の構築であった。化学修飾試薬DTBPA(4,4ユ-Dithiobis(1-azidobenzene))は疎水的な性質を持つ膜内領域への化学修飾試薬であり、クロスリンカーでもある。これを使用し、膜内領域において近接しているタンパク質を検出する方法の開発を行った。当研究室では以前より赤血球膜の膜内ペプチドを検出できる系を確立してたが、さらに高感度なMALDI-TOF MASSとHPLCとの併用により赤血球膜タンパク質であるバンド3タンパク質とグリコフォリンの膜内ドメインのすべてのトリプシン分解ペプチドを検出できる方法を開発した(投稿準備中)。また、有機溶媒による抽出法により、赤血球膜に存在するタンパク質およびペプチドを簡便かつ迅速に検出する方法を開発した(投稿準備中)。DTBPAおよびその他のクロスリンカーによる修飾とこれらの方法を併用し、現在膜内ペプチドの近接部位の同定を続けている。様々な膜タンパク質についての構造と機能の解析は世界各地で精力的に行われている。しかし、これまで膜タンパク質は疎水性性質のため解析の手法が限られているのも事実である。今回のこの研究はこれら膜タンパク質の相互作用の解析方法に一石を投じるものとなると信じている。

報告書

(1件)
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (3件)

  • [文献書誌] Ohkuri T, Ueda T, Abe Y, Hamasaki N, Imoto T.: "Depression of aggregation in the folding process of reduced mutant lysozyme by ligand binding to its denatured structures"Biopolymers. (in press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] H Kuma, Y Abe, D Askin, L J.Bruce, T Hamasaki, M J.A.Tanner, N Hamasaki.: "Molecular Basis and Functional Consequences of the Dominant Effects of the Mutant Band 3 on the Structure of Normal Band 3 in Southeast Asian Ovalocytosis"Biochemistry. (in press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] N Hamasaki, Y Abe, M J. A. Tanner.: "Frexible Rrgions within the Membrane-Embedded Portions of Polytopic Membrane proteins"Biochemistry. (in press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2018-03-28  

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