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レーザー光を用いる遺伝子操作法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 13308033
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物有機科学
研究機関京都大学

研究代表者

斎藤 烈 (齋藤 烈)  京都大学, 工学研究科, 教授 (20026082)

研究分担者 岡本 晃充 (岡本 晃光)  京都大学, 工学研究科, 助手 (60314233)
藤本 健造  北陸先端科学技術大学, 大学院・材料科学科, 助教授 (90293894)
研究期間 (年度) 2001 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
42,380千円 (直接経費: 32,600千円、間接経費: 9,780千円)
2003年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
2002年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
2001年度: 21,840千円 (直接経費: 16,800千円、間接経費: 5,040千円)
キーワード5ビニルウラシル / 5-ヨードデオキシウリジン / ピリミジン類縁体 / 可逆的な核酸連結
研究概要

5-ヨードデオキシウリジンより各種ビニルウラシル類縁体を良好な収率で合成することに成功した。それらをアミダイト化しDNA合成機を用いて5端末に修飾塩基を含む機能性オリゴ核酸を合成し、3端末にピリミジンを有するオリゴ核酸との光連結反応を行った。鋳型核酸存在下、光照射した後に、電気泳動を行い、連結された核酸を定量した結果、5位にカルボキシビニル基を含むピリミジンを用いると光連結に関する反応性が10倍向上することを見いだした。さらに、これら機能性核酸の合成の簡便化を行うべく、5位にホルミル基を有する核酸の合成を行った。DNA合成機後の固相担体からの切り出し及び脱保護条件において効率よくホルミル基を含むオリゴ核酸を合成し、その後、Wittig反応により効率よく目的とするビニル基の隣にカルボニル基をもつ光連結性核酸の合成に成功した。ビニル基の隣にカルボニル基を有するものだけでなくシアノ基を有するものも本手法により簡便に合成可能である。よって、本反応により共通の合成中間体から目的とする様々な光連結性核酸が容易に合成可能になった。この新しいポスト修飾法により酵素には調整できないようなユニークな構造を有する核酸(枝分かれ核酸・架橋型核酸・環状核酸)を合成することが可能となった。5-ビニルリジンのα-体を端末につけたDNAを用いて初めて3-端末側で連結できることを発見し、その応用を企った。

報告書

(4件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (17件)

  • [文献書誌] Akimitu Okamot, Kazuki Tainaka, Isao Saito: "Clear Distinction of Purine Bases on the Complementary Strand by a Fluorescence Change of a Novel Fluorescent Nucleoside."JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(17). 4972-4973 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akimitu Okamoto, Kazuo Tanaka, Tetsuo Fukuta, Isao Saito: "Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleoside and Its Application to T/C SNP Typing."JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(31). 9296-9297 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kazuhiko Nakatani, Souta Horie, Isao Saito: "Affinity Labeling of Single Guanine Bulge."JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(30). 8972-8973 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Chikara Dohno, Atsusi Ogawa, Kazuhiko Nakata, Isao Saito: "Hole Trapping at N^6-Cyclopropyldeoxyadenosine Suggests a Direct Contribution Of Adenine Bases to Hole Transport through DNA."JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(34). 10154-10156 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akimitsu Okamoto, Kazuki Tainaka, Isao Saito: "Clear distinction of Purine Baces on the Complementary Strand by a Fluorescence Change of a Novel Fluorescent Nucleoside"J.Am.Chem.Soc.. 125(17). 4972-4973 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akimitsu Okamoto, Kazuo Tanaka, Tetsuo Fukuta, Isao Saito: "Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleoside and Its Application to T/C SNP Typing"J.Am.Chem.Soc.. 125(31). 9296-9297 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kazuhiko Nakatani, Souta Horie, Isao Saito: "Affinity Labeling of Single Guanine Bulge"J.Am.Chem.Soc.. 125(30). 8972-8973 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Chikara Dohno, Atsishi Ogawa, Kazuhiko Nakatani, Isao Saito: "Hole Trapping at N6-Cyclopropyldeoxyadenosine Suggests a Direct Contribution of Adenine Bases to Hole Transport through DNA"J.Am.Chem.Soc.. 125(34). 10154-10155 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akimitu Okamoto, Kazuki Tainaka, Isao Saito: "Clear Distinction of Purine Bases on the Complementary Strand by a Fluorescence Change of a Novel Fluorescent Nucleoside"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(17). 4972-4973 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Akimitu Okamoto, Kazuo Tanaka, Tetsuo Fukuta, Isao Saito: "Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleoside and Its Application to T/C SNP Typing"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(31). 9296-9297 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kazuhiko Nakatani, Souta Horie, Isao Saito: "Affinity Labeling of Single Guanine Bulge"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(30). 8972-8973 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Chikara Dohno, Atsusi Ogawa, Kazuhiko Nakatand, Isao Saito: "Hole Trapping at N^6-Cyclopropyldeoxyadenosine Suggests a Direct Contribution Of Adenine Bases to Hole Transport through DNA"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(34). 10154-10155 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Akimitu Okamoto, Kazuhito Tanabe, Isao Saito: "Site-specific Discrimination of Cytosinee and 5-methylcytosine in Duplex DNA by Pentide Nucleic Acids"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 124(35). 10262-10263 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Chikara Dohno, Kazuhiko Nakatani, Isao Saito: "Guanine of the Third Strand of C・G^*G Triplex Serves as an Effective Hole Trap"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 124(49). 14580-14585 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Akimitu Okamoto, Keiichiro Kanatani, Toshiji Taiji, Isao Saito: "^<15>N NMR Study on Site-Selective Binding of Metal Ions to Guanine Runs in DNA : A Good Correlation with HOMO Distribution"JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 125(5). 1172-1173 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kenzo Fujimoto, Yutaka Ikeda, Shigenori Ishihata, Isao Saito: "Deoxyribonolactone formation in photoirradiation of 5-bromouraci-containing ologonucleotides by direct Cl' hydrogen abstraction"テトラヘドロン抄録紙. 43. 2243-2245 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kenzo Fujimoto, Naoki Ogawa, Shigeo Matsuda, Isao Saito: "Template Directed DNA Photoligation via Substituted 2'-deoxyuridine"Nucleic Acid Research Supplement. 1. 185-186 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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