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シアノバクテリアの走光性におけるフィトクロムの役割とシグナル伝達経路の解明

研究課題

研究課題/領域番号 13440235
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物生理
研究機関東京大学

研究代表者

池内 昌彦  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (20159601)

研究期間 (年度) 2001 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
14,700千円 (直接経費: 14,700千円)
2003年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2002年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2001年度: 5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
キーワードシアノバクテリア / ラン藻 / 走光性 / フラビンセンサー / 光変換 / フィトクロム / 光受容体 / フィコシアニン / 運動性 / 形質転換能 / 分割遺伝子
研究概要

Synechocystis sp. PCC 6803を用いて、正の走光性にかかわるフィトクロム様色素タンパク質をコードする新規遺伝子pixAを同定した。さらに、この遺伝子の近傍に、負の走光性にかかわる遺伝子群(nixB, nixC)を同定した。これらの遺伝子の2重変異株の解析から、pixAの下流にnixB/nixCが動いていると結論した。
正の走光性にかかわるフィトクロム様色素タンパク質をコードするpixJ1遺伝子をシアノバクテリアで大量発現し、単離して、ビリン色素が結合しており、既知のビリン色素とは約200nmも短波長域に吸収ピークをもち、青と緑の領域間での可逆的な光変換反応を示すことを明らかにした。
Synechocystis sp. PCC 6803を用いて、運動性の調節にかかわるシグナル伝達系の遺伝子群(piIG, pilH, pilI, pilJ, pilL-N, pilL-C)を同定した。とくに、このうちのpilLは、ゲノム上の全く異なる座位に分割されて存在し、しかも機能を持っていた。
正の走光性にかかわる新規フラビンタンパク質を精製し、結晶を作製して、X線の高解像度の散乱を得た。新規のフラビン結合ドメインの構造決定の有力な手がかりを得た。
シグナルセンサータンパク質をコードする一群の遺伝子を解析し、PASドメインのサブファミリーを大腸菌で発現させ、少なくとも4種のフラビン結合タンパク質を新規に同定した。これらは、青色光またはレドクスのセンサーである可能性が高い。
他のフィトクロム様遺伝子の破壊株の解析から、フィコシアニンリンカー遺伝子の発現を調節している光受容体遺伝子を同定し、その波長特性から、フィトクロム様発色団とともにフラビンの結合の可能性を推定した。後者については、大腸菌での発現実験により、FMNが結合していることを示した。また、この光受容体からシグナル伝達を受ける転写因子とその標的遺伝子を同定し、その上流配列に結合することを示した。

報告書

(4件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2004 2003 2001 その他

すべて 雑誌論文 (13件) 図書 (1件) 文献書誌 (19件)

  • [雑誌論文] Improved genetic transformation of the thermophilic cyanobacterium, Thermosynechococcus elongatus BP-12004

    • 著者名/発表者名
      Iwai et al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology 45

      ページ: 171-175

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Response to oxidative stress involves a novel peroxiredoxin gene in the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032004

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi et al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology 45

      ページ: 290-299

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Use of segment-based microarray in the analysis of global gene expression in response to various environmental stresses in the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 71202004

    • 著者名/発表者名
      Sato et al.
    • 雑誌名

      J. Gen. Appl. Microbiol. 50

      ページ: 1-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular evolution of PAS domain-containing proteins of filamentous cyanobacteria through the domain shuffling and domain duplication2004

    • 著者名/発表者名
      Narikawa et al.
    • 雑誌名

      DNA Research 11

      ページ: 69-81

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Iwai, M., Katoh, H., Katayama, M. and Ikeuchi, M. Improved genetic transformation of the thermophilic cyanobacterium, Thermosynechococcus elongatus BP-1.2004

    • 著者名/発表者名
      Iwai, M., Katoh, H., Katayama, M., Ikeuchi, M.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 45

      ページ: 171-175

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Response to oxidative stress involves a novel peroxiredoxin gene in the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.2004

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, M., Ishizuka, T., Katayama, M., Kanehisa, M., Bhattacharyya-Pakrasi, M., Pakrasi, H.B., Ikeuchi, M.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 45

      ページ: 290-299

    • NAID

      10012724002

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Use of segment-based microarray in the analysis of global gene expression in response to various environmental stresses in the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120.2004

    • 著者名/発表者名
      Sato, N., Ohmori, M., Ikeuchi, M., Tashiro, K., Wolk, P.C., Kaneko, T., Okada, K., Tsuzuki, M., Ehira, S., Katoh, H., Okamoto, S., Yoshimura, H., Fujisawa, T., Kamei, A., Yoshihara, S., Narikawa, R., Hamano, T., Tabata, S., Kuhara, S.
    • 雑誌名

      J.Gen.Appl.Microbiol. 50

      ページ: 1-8

    • NAID

      130004449126

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular evolution of PAS domain-containing proteins of filamentous cyanobacteria through the domain shuffling and domain duplication.2004

    • 著者名/発表者名
      Narikawa, R., Okamoto, S., Ikeuchi, M., Ohmori, M.
    • 雑誌名

      DNA Res. 11

      ページ: 69-81

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stable Positional Cloning of Long Continuous DNA in the Baclllus subti is genome vector2003

    • 著者名/発表者名
      Itaya et al.
    • 雑誌名

      J. Biochemistry 134

      ページ: 513-519

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Biochemical and functional characterization of a eukaryotic-type protein kinase, SpkB, in the eyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 68032003

    • 著者名/発表者名
      Kamei et al.
    • 雑誌名

      Curr Microbiol 46

      ページ: 296-301

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stable positional cloning of long continuous DNA in the Bacillus subtilis genome vector.2003

    • 著者名/発表者名
      Itaya, M., Fujita, K., Ikeuchi, M., Koizumi, M., Tsuge, K.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 134

      ページ: 513-519

    • NAID

      10012058225

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Biochemical and functional characterization of a eukaryotic-type protein kinase, SpkB, in the cyanobacterium, Synechocystis sp.2003

    • 著者名/発表者名
      Kamei, A., Yoshihara, S., Yuasa, T., Geng, X., Ikeuchi, M.
    • 雑誌名

      PCC 6803.Curr.Microbiol. 46

      ページ: 296-301

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Post-genome project of cyanobacteria.2001

    • 著者名/発表者名
      Ohmori, M., M.Ikeuchi
    • 雑誌名

      Tanpakushitu Kakusann Kouso 46

      ページ: 2486-2492

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [図書] タンパク質・核酸・酵素(分担)2001

    • 著者名/発表者名
      大森正之・池内昌彦
    • 総ページ数
      2492
    • 出版者
      シアノバクテリアの光合成遺伝子・タンパク質システムの解明
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Itaya et al.: "Stable Positional Cloning of Long Continuous DNA in the Bacillus subtilis genome vector"J.Biochemistry. 134. 513-519 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Narikawa et al.: "Newly identified motifs within PAS domains of filamentous cyanobacteria"Genome Informatics. 14. 444-445 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Iwai et al.: "Improved genetic transformation of the thermophilic cyanobacterium, Therm osynechococcus elongatus BP-1"Plant Cell Physiology. 45. 171-175 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi et al.: "Response to oxidative stress involves a novel peroxiredoxin gene in the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803"Plant Cell Physiology. 45(In press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Sato et al.: "Use of segment-based microarray in the analysis of global gene expression in response to various environmental stresses in the cyanobacterium Anabaena sp.PCC 7120"J.Gen.Appl.Microbiol.. (In press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Narikawa et al.: "Molecular evolution of PAS domain-containing proteins of filamentous cyanobacteria through the domain shuffling and domain duplication"DNA Research. (In press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshimura, H. et al.: "A cAMP receptor protein, SYCRP1, is responsible for the cell motility of Synechocystis sp. PCC 6803"Plant Cell Physiology. 43. 460-463 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshihara, S. et al.: "pilG gene cluster and split pilL genes involved in pilus biogenesis, motility and genetic transformation in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803"Plant Cell Physiology. 43. 513-521 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kamei, A. et al.: "Biochemical examination of the potential eukaryotic-type protein kinase genes in the complete genome of the unicellular cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803"DNA Research. 9. 71-78 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura, Y. et al.: "Complete genome structure of the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-1"DNA Research. 9. 123-130 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kashino, Y. et al.: "Low-molecular-mass polypeptide components of a photosystem II preparation from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus"Plant Cell Physiology. 43. 1366-1373 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kamei, A. et al.: "Biochemical and functional characterization of a eukaryotic-type protein kinase, SpkB, in the cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803"Current Microbiology. (in press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hihara, Y. et al.: "DNA microarray analysis of cyanobacterial gene expression during acclimation to high light"Plant Cell. 13. 793-806 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Katoh, H. et al.: "Functional analysis of psbV and a novel c-type cytochrome gene psbV2 of the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus strain BP-1"Plant and Cell Physiology. 42. 599-607 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ikeuchi, M., Tabata, S.: "Synechocystis sp. PCC 6803 - a useful tool in the study of the genetics of cyanobacteria"Photosynthesis Research. 70. 73-83 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ohmori, M. et al.: "Characterization of genes encoding multi-domain proteins in the genome of the filamentous nitrogen-fixing cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120"DNA Research. 8. 271-284 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshimura, H. et al.: "A cAMP receptor protein, SYCRP1, is responsible for the cell motility of Synechocystis sp. PCC 6803"Plant and Cell Physiology. (印刷中).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshihara, S. et al.: "pilG gene cluster and split pilL genes involved in pilus biogenesis, motility and genetic transformation in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803"Plant and Cell Physiology. (印刷中).

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 大森正之・池内昌彦: "タンパク質・核酸・酵素(分担)(シアノバクテリアの光合成遺伝子・タンパク質システムの解明)"2492 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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