| 研究課題/領域番号 |
13460070
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(B)
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 研究分野 |
林学
|
|---|
| 研究機関 | 九州大学 |
|---|
研究代表者 |
白石 進 九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (70226314)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2001 – 2002
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2002年度)
|
| 配分額 *注記 |
14,500千円 (直接経費: 14,500千円)
2002年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
2001年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
|
|---|
| キーワード | 林木育種 / DNA分子マーカー / マイクロサテライトDNA / SSR / 連鎖地図 / スギ / ヒノキ / クロマツ / TAC / アカシア / PIMA / ジーンマッピンギ |
|---|
| 研究概要 |
本研究は2年計画で実施し、主として次の成果を得ることができた。
(1)ゲノム中に散在するマイクロサテライトDNA(SSR;simple sequence repeats)領域を効率的に単離するため、TAC(triplex affinlty capture)法によるSSRマーカー開発法を確立した。
(2)モデルDNA(rbcL遺伝子に、[CT]_10、[CT]_15、[CT]_20、[CT]_25を挿入したDNA分子)を用いて、三重らせんDNA形成時のpH、温度条件等について検討した結果、pH64〜70の条件下で、繰り返し数の大きい(20回以上)SSR領域が選択的に単離できた。
(3)単離SSR分子のクローニングとこれを保有するコロニーの効率的なスクリーニングのために、PIMA(PCR-based isolation of microsatellite arrays)法の改良を行った。
(4)TAC法を用いて、スギ、クロマツ、ヒノキ、アカシアの4樹種のゲノムDNAを対象として、SSR領域のスクリーニングを実施し、スギで約300個のSSRの解析を行った。その塩基配列情報を基に、SCAR(sequence characterized amplified region)化し、PCRべースのSSRマーカーを開発した。
(5)スギ(早良1号の単相胚乳家系)、ヒノキ(姶良32号×薩摩8号の人工交配家系)、クロマツ(志摩64号の単相胚乳家系)、カラマツ(グイマツ)(カラマツ×グイマツの種間雑種個体の単相胚乳家系)の4樹種において、連鎖地図作成のための研究材料を作成した。
|
