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複数の転写超複合体による遺伝子発現の包括的制御機構の生化学及び遺伝学的解明

研究課題

研究課題/領域番号 13470489
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物系薬学
研究機関大阪大学

研究代表者

大熊 芳明  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 助教授 (70192515)

研究分担者 浴 俊彦  豊橋技術科学大学, エコロジー工学, 助教授 (40192512)
横井 雅幸  大阪大学, 生命機能研究科, 助手 (00322701)
研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
14,400千円 (直接経費: 14,400千円)
2002年度: 4,000千円 (直接経費: 4,000千円)
2001年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
キーワードRNAポリメラーゼII / 転写メディエーター複合体 / 基本転写因子 / 古細菌 / TFIIE / 転写開始・伸長段階 / Znフィンガーモチーフ / TFIIH / CTD / リン酸化 / Znフィンガー領域
研究概要

1.転写メディエーター複合体の精製と解析
転写メディエーターは、細胞核外からの転写制御シグナルをRNAポリメラーゼII(PolII)へ伝える複合体である。これは20数サブユニットよりなるが、3種のサブユニットにタグを付けて各々発現するヒトHeLa細胞株を樹立し、細胞核抽出液からメディエーター複合体を精製した。その結果、1〜2Mda転写超複合体が共通に精製され、転写活性化を正に制御する機能を確認した。
2.ヒトTFIIEαのZnフィンガー領域の構造解析
ヒト基本転写因子TFIIEはαとβサブユニットがα2β2の4量体を形成し、転写開始と伸長への移行に機能する。αは中央コア領域にZnフィンガーモチーフを有しており、この欠失変異体は試験管内転写系においてドミナントネガティブとして機能することから、転写に重要と考えられる。さらに真正細菌と真核生物の中間に位置する古細菌にもZnフィンガー領域を含むTFIIEαのN末端相当領域だけが保存されていることが示され、種を越えた機能の重要性が考えられている。そこで我々は、この領域をNMR構造解析し、亜鉛を配位するZnフィンガーモチーフであること、DNA結合型の従来のものと異なり表面は負電荷を帯びて蛋白相互作用に重要な役割を持つことを明らかにした。
3.PolIIの転写開始から伸長への移行解析
TFIIEβサブユニットC末端ヘリックス領域に点変異を入れると、直鎖状DNA鋳型によるTFIIEの転写活性が失われた。これら変異は、TFIIHによるPolIICTDのリン酸化活性の促進能も失っていた。以上から、この領域は転写伸長への移行活性に関与すると考えられる。その機能メカニズムは、さらに検討中であるがTFIIHの転写伸長への移行に寄与するp44サブユニットとの結合が変異体では野生型より強くなっていたため、TFIIHとの作用の変化が寄与していると考えられる。

報告書

(3件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (23件)

  • [文献書誌] Watanabe, T. et al.: "The carboxy terminus of the small subunit of TFIIE regulates the transition from transcription initiation to elongation by RNA polymerase II"Mol.Cell.Biol.. 23・8. 2914-2926 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fujita, N. et al.: "MCAF mediates MBD1-dependent transcriptional repression"Mol.Cell.Biol.. 23・8. 2834-2843 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchida, A. et al.: "The carboxy-terminal domain of the XPC protein plays a crucial role in nucleotide excision repair through interactions with transcription factor IIH"DNA Repair. 1・6. 449-461 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fukumoto, Y. et al.: "Two budding yeast RAD4 homologs in fission yeast play different roles in the repair of UV-induced DNA damage"DNA Repair. 1・10. 833-845 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamamoto, S. et al.: "Studies of nematode TFIIE reveal a link between Ser-5 phosphorylation of RNA polymerase II and the transition from transcription initiation to elongation"Mol.Cell.Biol.. 21・1. 1-15 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Araki, M. et al.: "Centrosome protein cetrin2/caltractin is part of the xeroderma pigmentosum group C complex that initiates global genome nucleotide excision repair"J.Biol.Chem.. 276・22. 18666-18672 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 半田 宏 編集: "転写がわかる-基本転写から発生,再生,先端医療まで"羊土社. 128 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, T. et al.: "The carboxy terminus of the small subunit of TFIIE regulates the transition from transcription initiation to elongation by RNA polymerase II."Mol. Cell. Biol.. 23. 2914-2926 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fujita, A. et al.: "MCAF mediates MBDI-dependent transcriptional repression."Mol. Cell. Biol.. 23. 2834-2843 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchida, A. et al.: "The carboxy-terminal domain of the XPG protein plays a crucial role in nucleotide excision repair through interactions with transcription factor IIH."DNA Repair. 1. 449-461 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fukumoto, Y. et al.: "Two budding yeast RAD4 homologs in fission yeast play different roles in the repair of UV-induced DNA damage."DNA Repair. 1. 833-845 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Araki, M. et al.: "Centrosome protein cetrin2/caltractin 1 is part of the xeroderma pigmentosum group C complex that initiates global genome nucleotide excision repair."J. Biol. Chem.. 276. 18666-18672 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamamoto, Y. et al.: "Studies of nematode TFIIE reveal a link between ser-5 phosphorylation of RNA polymerase II and the transition from transcription inintiation to elongation."Mol. Cell. Biol. 1-15.

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] nishikawa, N. S. et al.: "E2F regulates growth-dependent transcription of genes encoding both catalytic and subunits of mouse primase."Genes to Cells. 6. 57-70 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, T. et al.: "The carboxy terminus of the small subunit of TFIIE regulates the transition from transcription initiation to elongation by RNA polymerase II"Mol. Cell. Biol.. 23・8(発表予定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fujita, N. et al.: "MCAF mediates MBD1-dependent transcriptional repression"Mol. Cell. Biol.. 23・8(発表予定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Uchida, A. et al.: "The carboxy-terminal domain of the XPC protein plays a crucial role in nucleotide excision repair through interactions with transcription factor IIH"DNA Repair. 1・6. 449-461 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fukumoto, Y. et al.: "Two budding yeast RAD4 homologs in fission yeast play different roles in the repair of UV-induced DNA damage"DNA Repair. 1・10. 845-883 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 大熊 芳明: "基本転写因子の形成する転写開始複合体による遺伝子発現の調節"実験医学増刊 ゲノム機能を担う核・染色体のダイナミクス-複製、修復、組換え、転写機構からエピジェネティクス、高次生命機能・医学とのかかわりまで-. 20・11. 1517-1524 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 半田 宏 編集: "転写がわかる-基本転写から発生,再生,先端医療まで"羊土社. 128 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yamamoto, S. et al.: "Studies of nematode TFIIE reveal a link between Ser-5 phosphorylation of RNA PolymeraseII and the transition from transcription initiation to elongation"Mol. Cell. Biol.. 21. 1-15 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Araki, M. et al.: "Centrisonne protein centrin 2/caltractin 1 is part of the xeroderma Pigmentosun group C complex that initiates global genome nucleatide excision repair"J. Biol. Chem.. 276. 18666-18672 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Uchida, A. et al.: "The Carboxy-terminal domain of the XPC protein plays a crucial role in nucleatide excision repair through interactions with transcription factor IIH"DNA Repair. (発表予定). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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