• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

ミトコンドリアゲノム全塩基配列に基づく上位真骨類大分類群の再検討

研究課題

研究課題/領域番号 13640711
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 系統・分類
研究機関千葉県立中央博物館

研究代表者

宮 正樹  千葉県立中央博物館, 動物学研究科, 上席研究員 (30250137)

研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2002年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2001年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード真骨類 / 系統 / 高次分類 / ミトコンドリア / ゲノム / 魚類 / 分子系統 / 大規模データ / ミトコンドリアゲノム / 真骨魚類 / 分子系統学 / 大規模データセット / ロングPCR / 単系統群 / 大分類群 / 側棘鰭類
研究概要

諸説入り乱れている上位真骨魚類(とくに棘鰭類内部)系統解明の第一段階として,どのような包括的単系統群が認められ,それらがどのような相互関係をもつのか,計48種の真骨魚類から得られたミトコンドリアゲノム全塩基配列データを用いて大域的な系統解析を行った.その結果,さまざまな統計値によって強く支持される頑健な系統樹が得られ,系統樹の最上位に位置するスズキ類を除く上位真骨類系統の概容が明らかになった.それとともに,いくつかの分類群(側棘鰭類・キンメダイ目・カンムリキンメダイ目)について系統学的問題が存在することが明らかになった.
そこで,この問題に対処すべくこれら3つの分類群と他の上位真骨類から新たに計54種をリストアップし,これらのミトコンドリアゲノム全塩基配列を決定した.計100種からなる形質行列を作成し,系統解析を行った.その結果,側棘鰭類についてはまったく系統学的実体がない分類群であることが判明し,ギンメダイ類・サケスズキ類・タラ類・マトウダイ類の計4つのグループからなる分類群として再定義する必要があることを示した.また,キンメダイ類とカンムリキンメダイ類は双方ともに側系統群であることが明らかになった.さらに,真骨類の最上位に位置する"スズキ類"には,かつて原始的な上位真骨類と考えられていたアシロ類とアンコウ類を加えて,再定義する必要があることが明らかになった.
以上の結果はすでにMiya et al.(2001,2003)に発表され(下記参照),魚類高次系統学にこれまでにない大きなインパクトを与えた.

報告書

(3件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (29件)

  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Conger myriaster (Teleostei : Anguilliformes) : Novel gene order for vertebrate mitochondrial genomes and the phylogenetic implications for anguilliform"Journal of Molecular Evolution. 52(4). 311-320 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "A mitogenomic perspective on the basal teleostean phylogeny : Resolving higher-level relationships with longer DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 20(2). 275-285 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miya, M., A.Kawaguchi, M.Nishida: "Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies : A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly-determined complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Biology and Evolution. 18(11). 1993-2009 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Basal actinopterygian relationships : A mitogenomic perspective on the phylogeny of the "ancient fish""Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 110-120 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miya, M., 12 coauthors: "Major Patterns of higher teleostean phylogenies : A new perspective based on 100 complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 121-138 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Saito, K., M.Miya, J.G.Inoue, N.B.Ishiguro, M.Nishida: "Mitochondrial genomics of ostariophysan fish : Perspective on phylogeny and biogeography"Journal of Molecular Evolution. 56(1). 1-9 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J. G., M. Miya, K. Tsukamoto and M. Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Conger myriaster (Teleostei : Anguillioformes) : Novel gene order for vertebrate mitochondrial genomes and the phylogenetic implications for anguilliform families"Journal of Molecular Evolution. 52(4). 311-320 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishiguro, N., M. Miya and M. Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of ayu"Plecoglossus altivelis. Fisheries Science. 67. 474-481 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kawaguchi, A., M. Miya, M. Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Aulopus japonicus (Teleostei : Aulopiformes) , a basal Eurypterygii : Longer DNA sequences and the higher-level relationships"Ichthyological Research. 48(3). 213-223 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J. G., M. Miya, K. Tsukamoto and M. Nishida: "A mitogenomic perspective on the basal teleostean phylogeny : Resolving higher-level relationships with longer DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 20(2). 275-285 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J. G., M. Miya, K. Tsukamoto and M. Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of the Japanese anchovy"Engraulis japonicus. Fisheries Science. 67(5). 828-835 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miya, M., A. Kawaguchi, M. Nishida.: "Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies : A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly-determined complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Biology and Evolution. 18(11). 1993-2009 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Lee, J.-S., M. Miya, Y.-S. Lee, C. G. Kim, E.-H. Park, Y. Aoki and M. Nishida: "The complete DNA sequence of the mitochondrial genome of the self-fertilizing fish Rivulus marmoratus (Cyprinodontiformes, Rivulidae) and the first description of duplication of a control region in fish"Gene. 280(1/2). 1-7 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J. G., M. Miya, K. Tsukamoto and M. Nishida: "Basal actinopterygian relationships : A mitogenomic perspective on the phylogeny of the "ancient fish""Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 110-120 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Miya, M., H. Takeshima, H. Endo, N. B. Ishiguro, J. G. Inoue, T. Mukai, T. P. Satoh, M. Yamaguchi, A. Kawaguchi, K. Mabuchi, S. M. Shirai and M. Nishida: "Major Patterns of higher teleostean phylogenies : A new perspective based on 100 complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 121-138 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Saitoh, K., M. Miya, J. G. Inoue, N. B. Ishiguro and M. Nishida: "Mitochondrial genomics of ostariophysan fish : Perspectives on phylogeny and biogeography"Journal of Molecular Evolution. 56(1). 1-9 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishiguro, N., M. Miya and M. Nishida: "Basal euteleostean relationships : A mitogenomic perspective on the phylogenetic reality of the "Protacanthopterygii""Molecular Phylogenetics and Evolution. (In press). (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Conger myriaster (Teleostei : Anguillioformes) : Novel gene order for vertebrate mitochondrial genomes and the phylogenetic implications for anguilliform"Journal of Molecular Evolution. 52(4). 311-320 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "A mitogenomic perspective on the basal teleostean phylogeny : Resolving higher-level relationships with longer DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 20(2). 275-285 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Miya, M., A.Kawaguchi, M.Nishida: "Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies : A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly-determined complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Biology and Evolution. 18(11). 1993-2009 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Basal actinopterygian relationships : A mitogenomic perspective on the phylogeny of the "ancient fish""Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 110-120 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Miya, M., 12 coauthors: "Major Patterns of higher teleostean phylogenies : A new perspective based on 100 complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 26(1). 121-138 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Saitoh, K., M.Miya, J.G.Inoue, N.B.Ishiguro, M.Nishida: "Mitochondrial genomics of stariophysan fish : Perspectives on phylogeny and biogeography"Journal of Molecular Evolution. 56(1). 1-9 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Conger myriaster (Teleostei : Anguillioformes): Novel gene order for vertebrate mitochondrial genornes and the phylogenctic implications for anuuilliform families"Journal of Molecular Evolution. 52(3). 311-320 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Ishiguro, N., M.Miya, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of ayu, Plecoglossus altivelis"Fisheries Science. 67(4). 474-481 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi, A., M.Miya, M.Nishida: "Complete mitochondrial DNA sequence of Aulopus japonicus (Teleostei : Aulopiformes),a basal Eurypterygii : Longer DNA sequences and the higher-level relationships"Ichthyological Research. 48(3). 213-223 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida.: "A miltogenomic perspective on the basal teleostean phylogeny : Resolving higher-level relationships with longer DNA sequences"Molecular Phylogenetics and Evolution. 20(2). 275-285 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue, J.G., M.Miya, K.Tsukamoto, M.Nishida.: "Complete mitochondrial DNA sequence of the Japanese anchovy, Engraulis japonicus"Fisheries Science. 67(5). 828-835 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Miya, M., A.Kawaguchi, M.Nishida: "Mitogenomic exploration of higher teleostean phylogenies : A case study for moderate-scale evolutionary genomics with 38 newly-determined complete mitochondrial DNA sequences"Molecular Biology and Evolution. 18(11). 1993-2009 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

URL: 

公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi