| 研究課題/領域番号 |
13670892
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
皮膚科学
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| 研究機関 | 大分医科大学 |
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研究代表者 |
藤原 作平 大分医科大学, 医学部, 教授 (90181411)
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| 研究分担者 |
吉岡 秀克 大分医科大学, 医学部, 教授 (00222430)
澁谷 博美 (渋谷 博美) 大分医科大学, 医学部, 助手 (60253788)
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| 研究期間 (年度) |
2001 – 2002
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| 研究課題ステータス |
完了 (2002年度)
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| 配分額 *注記 |
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2002年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2001年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
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| キーワード | 水疱性類天疱瘡 / プレクチン / ヘミデスモゾーム / 基底膜 / 表皮細胞 / 中間径フィラメント / 細胞接着 / エピプラキン |
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| 研究概要 |
エピプラキンは、15.2kbのcDNA (DNA Data Bank of Japan, accession no.AB051895)でコードされ、5065個のアミノ酸からなる推定分子量552kDaの分子であるが、その遺伝子発現調節機構を解明し、また遺伝子改変動物を作製するために、このプロジェクトでは、(1)エピプラキンのヒトおよびマウスの遺伝子単離と構造 (2)染色体上の遺伝子座の2点を明らかにした。
ヒトエピプラキン遺伝子はATGからTGAまで、cDNA塩基配列の中断がなく、一つのエキソンから成り立っていた。5回存在する3'末端の1.6kbよりなる規則的な繰り返し配列の中に、GCCリピートが存在し、その数に変化が見られた。時にGCCらACCへの変異も見られた。国際ゲノムプロジェクトの結果からは、この遺伝子は7.5kbとされており、1.6kbよりなる規則的な繰り返し配列は殆ど含まれていなかった。国際ゲノムプロジェクトが採用しているショットガン・シークエンス法では規則的な繰り返し配列数を決定するには限界がある為と考えられた。
fluorescence in situ hybridization(FISH)法にて遺伝子座の決定を行なったところ、8q24.3にマップされ、これは、プレクチンの遺伝子座と同じであった。ゲノムブラウザーによれば、エピプラキンはプレクチンの60kbテロメア側に同方向に存在することが明らかになっていたが、一箇所に蛍光が集約されたことは、パラログが存在しないことを意味し、polyadenylated tailsを伴わないこともあわせ、単離した遺伝子が偽遺伝子でないこと、遺伝子発生のメカニズムとしてretrotranspositionが関与した可能性は低いことが明らかとなった。
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