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全HLA領域のSNPsを用いたスギ花粉症の疾患感受性遺伝子の検索

研究課題

研究課題/領域番号 13671795
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 耳鼻咽喉科学
研究機関奈良県立医科大学

研究代表者

井手 武  奈良県立医科大学, 医学部, 助手 (20094550)

研究分担者 石谷 昭子  奈良県立医科大学, 医学部, 講師 (40112544)
研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2002年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2001年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードSNPs / HLA / Polymorphism / susceptible / KIR gene / allergy / Japanese cedar pollinosis / susceptible gene
研究概要

1)日本人健常対照およびスギ花粉症患者それぞれ92名のDNAサンプルについて検討した。健常対照としては、花粉症のいかなる症状も点く、スギ、ダニに対するIgE抗体陰性のものとした。スギ花粉症患者としてはスギ花粉症特異的IgE抗体のみ陽性で、ダニ、ヨモギ、カモガヤには陰性のものとした。
2)HLA領域のSNPsについては全領域にわたる150SNPsについて調べた。そのうち、23SNPsには多型が認められず、28SNPsについては10%以下の多型しか認められなかった。その他の99SNPsについては10%以上の多型が存在した。これらのSNPsはCaucassianにおいては10%以上のが多型が存在するものであり、この差はpopulationの違いによると考えられる。
3)領域のSNPsについてスギ花粉症についての相関解析を行い、X^2値=11、P=0.001、Odds Ratio=5と、高い相関を示す傾域を見出した。
現在、この相関を確認し、このピーク領域をさらに狭める目的で、JSNPs等の公開されているデータを用いて、さらなるSNPs解析を行いつつある。
4)同様のDNAサンプルについてKIR遺伝子の多型解析も行った。
スギ花粉症について相関解析を行ったところ健常対照とほとんど有意差はみられなかったが、1遺伝子についてのみサンプル数を増やすことにより、有意差がみられるのではないかと考えられるものがあった。現在さらにサンプル数を増やすべく準備中である。
5)今回用いたスギ花粉症サンプルのHLA型との相関をも調べるため、現在HLA型を検査中である。

報告書

(3件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (10件)

  • [文献書誌] 石谷昭子他: "Natural killer immunoglobulin-like receptor(KIR)遺伝子の多形解析"DNA多型. 9. 158-160 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Ishitani, et al.: "Definitive high resolution typing of HLA-E allelic polymorphisms : Identifying potential errors in existing allele data"Tissue Antigens. 60. 206-212 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Ishitani, et al.: "Genetics of immune response : identifying immune variation within the MHC and throughout the genome"Immunological Reviews. 190. 69-85 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Ishitani et al.: "Analysis of natural killer immunoglobulin-like reception (KIR) gene polymorphisms"DNA Polymorphism. 9. 158-160 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Ishitani et al.: "Definitive high resolution typing of HLA-E allelic polymorphisms: Identifying potential errors in existing allele data"Tissuere Antigens. 60. 206-212 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Ishitani et al.: "Genetics of immune response: identifying immune variation within the MHC and throughout the genome"Immunological Reviews. 190. 69-85 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 石谷昭子 他: "Natural killer immunoglobulin-like receptor (KIR)遺伝子の多形解析"DNA多形. 9. 158-160 (2001)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.Ishitani, et al.: "Definitive high resolution typing of HLA-E allelic polymorphisms : Identifying potential errors in existing allele data"Tissue Antigens. 60. 206-212 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.Ishitani, et al.: "Genetics of immune response : identifying immune variation within the MHC and throughout the genome"Immunological Reviews. 190. 69-85 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 石谷昭子 他: "Natural killer immunoglobulin-like receptor (KIR)遺伝子の多形解析"DNA多型. 9. 158-160 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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