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2本鎖DNAに対して選択的な反応を誘起する新規反応性核酸の開発

研究課題

研究課題/領域番号 13680673
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物有機科学
研究機関九州大学

研究代表者

永次 史  九州大学, 薬学研究院, 助手 (90208025)

研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2002年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2001年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード2-アミノ6-ビニルプリン / アンチセンス / 反応性核酸 / ゲノム標的化学 / 化学的点変異誘導 / クロスリンク反応 / 3本鎖形成 / 反応性オリゴマーDNA / 2-アミノ-6-ビニルプリン / 点変異誘起
研究概要

本研究者は2本鎖DNAに対して選択的に反応する分子の開発及びそれを用いた選択的点変異誘導の実現を目指して研究を展開している。平成13年度には独自にデザインした反応性核酸2-アミノ-6-ビニルプリンを糖からスペーサーで結合した分子を含むオリゴヌクレオチドが、2本鎖に対してシチジンあるいはアデノシンに対して非常に選択的に反応することを明らかにした。さらに平成14年度はこの反応性オリゴヌクレオチドを反応させたプラスミドDNAが修復酵素欠損細胞内で複製させることで反応点であるシチジンあるいはアデノシンに対してのみ非常に選択的に点変異が誘導されることを明らかにした。また3本鎖を安定に形成できる誘導体からなるオリゴヌクレオチドにこの反応性核酸を組み込んだオリゴヌクレオチドを用いて、その変異の位置のみではなくその変異の種類までコントロールできることを明らかにした。変異効率は低いものの標的に対してピンポイント的に変異を誘導できたことは、今後その反応の効率を改善することで新たなバイオテクノロジーとしての展開も期待できると考えている。
さらに反応性を向上させる試みとしてビニル基に電子吸引基としてスルフォキシド基を導入したビニル誘導体を糖とスペーサーでつないだ新たな反応性核酸の合成も行った。この反応性部分は既に2本鎖内で中性条件下でも反応することを確認しており3本鎖内でも中性条件において反応することを期待し設計したものである。それらの反応性を評価したところ残念ながら中性あるいは酸性条件下でもまったく反応しないことがわかった。これらの誘導体を含むオリゴヌクレオチドの3本鎖形成能を調べたところ、いずれの誘導体も反応条件下では3本鎖を形成しておらず、安定な3本鎖を形成できないことが反応しなかったことの原因であることが考えられる。今後は様々な反応性塩基を含むオリゴヌクレオチドを簡便に合成する方法(ポストモディフィケーション法)を用いて、スペーサーの長さあるいは反応性部分の構造を検索することで反応性の高い分子の開発を行う予定である。

報告書

(3件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (26件)

  • [文献書誌] F.Nagatsugi, D.Usui, T.Kawasaki, M.Maeda, S.Sasaki: "Selective Reaction to a Flipping Cytidine of the Duplex DNA Mediated by Triple Helix Formation"Bioorg & Med.Chem Lett.. 11(9). 343-345 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Tokuda, N., Maeda, M., Sasaki, S: "A New Reactive Nucleoside Analogue for Highly Reactive and Selective Cross-Linking Reaction to Cytidine under Neutral Condition"Bioorg & Med.Chem Lett.. 11(9). 2577-2579 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Tokuda, N., Kawasaki, T., Maeda, M., Sasaki, S: "Efficient Cross-Linking to Cytidine under Neutral Conditions Using the 2-Amino-6-Vinylpurine Derivatives Having an Additional Activating Group"Nucleic Acids Res.Suppl. 44. 87-88 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sasaki, S., Yamauchi, H., Nagatsugi.F., Takahashi, R., Taniguchi, Y., Maeda, M.: "W-Shape Nucleic Acid (WNA) for Selective Formation of Non-Natural Anti-Parallel Triplex Including a TA Interrupting Site"Tetrahedron Letters. 42(39). 6915-6918 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F.Nagatsugi, T.Kawasaki, N.Tokuda, M.Maeda, S.Sasaki: "Site-Directed Alkylation to cytidine within Duplex by the Oligonucleotides Containing Functional Nucleobases"Nucleoside, Nucleotides & Nucleic Acids,. 20. 915-918 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Matsuyama, Y., Maeda, M., Sasaki, S.: "Selective cross-linking to the adenine of the TA interrupting site within the triple helix"Bioorg Med Chem Lett. 12. 487-489 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi F., Sasaki S., Miller P.S., Seidman M.M.: "Mutagenesis Targeted by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing A Reactive Nucleoside Analogue"Nucleic Acids Res.Suppl.. 2. 35-36 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Md.Monsur Ali, Nagatsugi F., Yamamoto F., Maeda M., Sasaki S: "2-Amino-6-Vinylpurine as a Tool of Post Synthetic Conjugation of Oligonucleotides with Radio-, Spin-, Fluorescence Label and Peptides"Nucleic Acids Res.Suppl.. 2. 149-150 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi F., Sasaki S., Miller P.S., Seidman M.M.: "Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue"Nucleic Acids Research. 6. e31-e41 (2003)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F. Nagatsugi, D. Usui, T. Kawasaki, M. Maeda, S. Sasaki: "Selective Reaction to a Flipping Cytidine of the Duplex DNA Mediated by Triple Helix Formation"Bioorg. Med. Chem. Lett.. 11. 343-345 (2001)

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  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi, Natsuko Tokuda, Minoru Maeda and Shigeki Sasaki: "A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions"Bioorg. Med. Chem. Lett.. 11. 2577-2579 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shigeki Sasaki, Hiroyuki Yamauchi, Fumi Nagatsugi, Ryo Takahashi, Yosuke Taniguchi and Minoru Maeda: "W-shape nucleic acid (WNA) for selective formation of non-natural anti-parallel triplex including a TA interrupting site"Tetrahedron Lett.. 42(39). 6915-6918 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F. Nagatsugi, T. Kawasaki, N. Tokuda, M. Maeda, S. Sasaki: "Site-Directed Alkylation to cytidine within Duplex by the Oligonucleotides Containing Functional Nucleobases"Nucleoside, Nucleotides & Nucleic Acids. 20. 915-919 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi, Natsuko Tokuda, Minoru Maeda and Shigeki Sasaki: "Efficient cross-linking to cytidine under neutral conditions using the 2-amino-6-vinylpurine derivative having an additional activating group"Nucleic Acids Res. Supplement. 1. 87-88 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi F, Matsuyama Y, Maeda M, Sasaki S: "Selective cross-linking to the adenine of the TA interrupting site within the triple helix"Bioorg Med Chem Lett.. 12. 487-489 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi F., Sasaki S., Miller P. S. and Seidman M. M.: "A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions"Nucleic Acids Res. Suppl.. 2. 35-36 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Md. Monsur Ali, Nagatsugi F., Yamamoto F., Maeda M., Sasaki S.: "2-Amino-6-Vinylpurine as a Tool of Post Synthetic Conjugation of Oligonucleotides with Radio-, Spin-, Eluorescence Label and Peptides"Nucleic Acids Res. Supp.. 2. 149-150 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagatsugi F, Sasaki S, Miller P. S, and Seidman M. M.: "Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue."Nucleic Acids Research. 6. e31-e40 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi et al.: "Selective cross-linking to the adenine of the TA interrupting site within the triple helix"Bioorg Med Chem Lett. 12. 487-489 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi et al.: "A new reactive nucleoside analogue for highly reactive and selective cross-linking reaction to cytidine under neutral conditions"Nucleic Acids Res. Suppl.. 2. 35-36 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi et al.: "2-Amino-6-Vinylpurine as a Tool of Post Synthetic Conjugation of Oligonucleotides with Radio-, Spin-, Fluorescence Label and Peptides"Nucleic Acids Res Supp. 2. 149-150 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Fumi Nagatsugi et al.: "Site-Specific Mutagenesis by Triple-Helix Forming Oligonucleotides Containing a Reactive Nucleoside Analogue"Nucleic Acids Res. (In press). (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Tokuda, N., Maeda, M., Sasaki, S: "A New Reactive Nucleoside Analogue for Highly Reactive and Selective Cross-Linking Reaction to Cytidine under Neutral Condition"Bioorg & Med. Chem Lett.. 11(9). 2577-2579 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Matsuyama, Y., Maeda, M., Sasaki, S.: "Selective Cross-linking to the Adenine of the TA Interrupting Site within Homopurin Homopyrimidine Duplex"Bioorg & Med. Chem Lett.. 12(3). 487-489 (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Nagatsugi, F., Tokuda, N., Kawasaki, T., Maeda, M., Sasaki, S.: "Efficient Cross-Linking to Cytidine under Neutral Conditions Using the 2-Amino-6-Vinylpurine Derivatives Having an Additional Activating Group"Nucleic Acids, Symp. Ser.. 44. 87-88 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Sasaki, S., Yamauchi, H., Nagatsugi, F., Takahashi, R., Taniguchi, Y., Maeda, M.: "W-Shape Nucleic Acid (WNA) for Selective Formation of Non-Natural Anti-Parallel Triplex Including a TA Interrupting Site"Tetrahedron Letters. 42(39). 6915-6918 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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