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鉄硫黄クラスター形成反応の分子機構:Isc蛋白質群の構造と機能的相互作用の解明

研究課題

研究課題/領域番号 13680690
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

高橋 康弘  大阪大学, 大学院・理学研究科, 講師 (10154874)

研究分担者 大岡 宏造  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助教授 (30201966)
福山 恵一  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80032283)
研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2002年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2001年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワード鉄硫黄蛋白質 / 鉄硫黄クラスター / iscオペロン / sufオペロン / 分子間相互作用 / 機能マシナリー / IscS / IscU / フェレドキシン / 分子シャペロン / Fdx
研究概要

鉄硫黄(Fe-S)蛋白質は、非ヘム鉄と無機硫黄原子から成るFe-Sクラスター([2Fe-2S]または[3Fe-4S]、[4Fe-4S])を持つ蛋白質の総称であり、細菌から高等動植物まで優に100を越える種類が分布している。これらのFe-Sクラスターはポリペプチドの翻訳後、蛋白質内部に形成されるものであるが、その生合成の機構は長い間未知の課題として残されていた。近年、我々は、過剰発現させるとFe-Sクラスター形成能を大幅に増加させる遺伝子群として大腸菌のiscオペロン(iscRSUA-hscBA-fdx-ORF3)を同定した。本研究ではこれを発展させ、以下の解析を進めた。
1.iscオペロンにコードされる遺伝子群を系統的に破壊した変異体を作成、解析し、Fe-Sクラスター形成を担う機能マシナリーであることを明確にした。
2.マシナリーの成分であるIscAについて生化学的な解析、Fdxについて結晶構造解析を行い、それぞれの特性を明らかにした。
3.マシナリーの8成分間の相互作用についてTwo-hybrid法とPull-down法を併用した解析を進め、複雑な機能ネットワークの実体を明らかにした。また、IscS-IscU間の相互作用について詳細な生化学的解析を行い、Fe-Sクラスター中間体形成の初発過程に関して重要な知見を得た。
4.iscオペロンの欠失変異体から生じた偽復帰変異体を契機として、独立した第二のFe-Sクラスターアセンブリー装置として、sufABCDSEオペロン(これまで機能未知)にコードされるSUFマシナリーを見出した。SUFマシナリーの成分は古細菌、グラム陰性細菌、ラン藻、(葉緑体)など、ISCマシナリーを持たない生物に広く分布している。Fe-Sクラスター合成系の進化を考える上でも、大変意義深い発見になった。

報告書

(3件)
  • 2002 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (24件)

  • [文献書誌] Sandrine Ollagnier-de-Choudens: "Iron-Sulfur Cluster Assembly : Characterization of IscA and Evidence for a Specific and Functional Complex with Ferredoxin"J. Biol. Chem.. 276・(25). 22604-22607 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Umechiyo Tokumoto: "Genetic Analysis of the isc Operon in Escherichia coli Involved in Biogenesis of Cellular Iron-Sulfur Proteins"J. Biochem.. 130・(1). 63-71 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimitsu Kakuta: "Crystal Structure of Escherichia coli Fdx, an Adrenodoxin-type Ferredoxin Involved in the Assembly of Iron-sulfur Clusters"Biochemistry. 40・(37). 11007-11012 (2001)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Keiichi Fukuyama: "Atomic Resolution Structures of Oxidized [4Fe-4S] Ferredoxin from Bacillus thremoproteolyticus in Two Crystal Forms : Systematic distortion of [4Fe-4S] Cluster in the Protein"J. Mol. Biol.. 315・(5). 1155-1166 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shin-ichiro Kato: "Cys328 of IscS and Cys63 of IscU are the sites of disulfide bridge formation in a covalently-bound IscS/IscU complex : Implication for the mechanism of iron-sulfur cluster assembly"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99・(9). 5948-5952 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Umechiyo Tokumoto: "Network of Protein-Protein Interactions among Iron-Sulfur Cluster Assembly Proteins in Escherichia coli"J. Biochem.. 131・(5). 713-719

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  • [文献書誌] Hisaaki Mihara: "The iscS gene is essential for the biosynthesis of 2-selenouridine in tRNA and the selenocysteine containing formate dehydrogenase H"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99・(10). 6679-6683 (2002)

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  • [文献書誌] Yasuhiro Takahashi: "A third bacterial system for the assembly of iron-sulfur clusters with homologs in archaea and plastids"J. Biol. Chem.. 277・(32). 28380-28383 (2002)

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  • [文献書誌] Sandrine Ollagnier-de-Choudens: "Iron-Sulfur Cluster Assembly : Characterization of IscA and Evidence for a Specific and Functional Complex with Ferredoxin"J. Bid Chem.. 276(25). 22604-22607 (2001)

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  • [文献書誌] Umechiyo Tokumoto: "Genetic Analysis of the ire Operon in Escherichia coli Involved in Biogenesis of Cellular Iron-Sulfur Proteins"J. Biochem.. 130(1). 63-71 (2001)

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  • [文献書誌] Yoshimitsu Kakuta: "Crystal Structure of Escherichia coli Fdx, an Adrenodoxin-type Fenedoxin Involved in the Assembly of Iron-sulfur Clusters"Biochemistry. 40(37). 11007-11012 (2001)

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  • [文献書誌] Keiichi Fukuyama: "Atomic Resolution Structures of Oxidized [4Fe-4S] Ferredoxin from Bacillus thremoproteolytics in Two Crystal Forms : Systematic distortion of [4Fe-4S] Cluster in the Protein"J. Mol. Biol.. 315(5). 1155-1166 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shin-ichiro Kato: "Cys328 of IscS and Cys63 of IscU are the sites of disulfide bridge formation in a covalently-bound IscS/IscU complex : Implication for the mechanism of iron-sulfur cluster assembly"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99(9). 5948-5952 (2002)

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  • [文献書誌] Uniechiyo Tokumoto: "Network of Protein-Protein Interactions among Iron-Sulfur Cluster Assembly Proteins in Escherichia coli"J. Biochem.. 131(5). 713-719 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hisaaki Mihara: "The iscS gene is essential for the biosynthesis of 2-selenouridine in tRNA and the selenocysteine containing formate dehydrogenase H"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99(9). 6679-6683 (2002)

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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasuhiro Takahashi: "A third bactetial system for the asshmbly of iron-sulfur clusters with homologs in Archaea and plaslids"J. Boil. Chem.. 277(32). 28380-28383 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2002 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shin-ichiro Kato: "Cys328 of IscS and Cys63 of IscU are the sites of disulfide bridge formation in a covalently-bound IscS/IscU complex : Implication for the mechanism of iron-sulfur cluster assembly"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99・(9). 5948-5952 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Umechiyo Tokumoto: "Network of Protein-Protein Interaction among Iron-Sulfur Cluster Assembly Proteins in Escherichia coli"J. Biochem.. 131・(5). 713-719 (2002)

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      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hisaaki Mihara: "The iscS gene is essential for the biosynthesis of 2-selenouridine in tRNA and the selenocysteine containing formate dehydrogenase H"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99・(10). 6679-6683 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yasuhiro Takahashi: "A third bacterial system for the assembly of iron-sulfur clusters with homologs in archaea and plastids"J. Biol. Chem.. 277・(32). 28380-28383 (2002)

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      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Sandrine Ollagnier-de-Choudens: "Iron-Sulfur Cluster Assembly : Characterization of IscA and Evidence for a Specific and Functional Complex with Ferredoxin"J. Biol. Chem.. 276・(25). 22604-22607 (2001)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Umechiyo Tokumoto: "Genetic Analysis of the isc Operon in Escherichia coli Involved in Biogenesis of Cellular Iron-Sulfur Proteins"J. Biochem.. 130・(1). 63-71 (2001)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshimitsu Kakuta: "Crystal Structure of Escherichia coli Fdx, an Adrenodoxin-type Ferredoxin Involved in the Assembly of Iron-sulfur Clusters"Biochemistry. 40・(37). 11007-11012 (2001)

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      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Keiichi Fukuyama: "Atomic Resolution Structures of Oxidized [4Fe-4S] Ferredoxin from Bacillus thremoproteolyticus in Two Crystal Forms : Systematic distortion of [4Fe-4S] Cluster in the Protein"J. Mol. Biol.. 315・(5). 1155-1166 (2002)

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      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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