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ミトコンドリアDNA変異の検索による高精度大腸癌遺伝子診断法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 13770687
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 消化器外科学
研究機関群馬大学

研究代表者

萬田 緑平  群馬大学, 医学部, 助手 (70332559)

研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2002年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2001年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
キーワード食道癌 / ミトコンドリア / DNA mutation / esophageal cancer
研究概要

ミトコンドリアDNA(mtDNA)は全長16,569bpの環状二本鎖DNAよりなり、その全塩基配列が決定されている。また、mtDNAは変異を受けやすい。癌の発生及び進展過程におけるミトコンドリアDNA変異の意義を食道癌臨床検体にて検討した。当科の食道癌臨床検体癌部、非癌部のペア59検体からのDNAを材料とし、mtDNA(16,569bp)のうち、コードDNAを欠く唯一の領域であり、転写開始点であるD-loop領域(1119bp)にプライマーを設定し、ABI 310シークエンサーにてこの領域のDNA配列を解読した。変異は癌部非癌部のシークエンス波形パターンをで直接対比し、検討した。また臨床病理学的データとの相関も検討した。
その結果、全長16,569bpの内、D-loop領域(1119bp)のシークエンスのみの解析にて59検体中6例(10%)のDNAに変異を認めた。6例中4例はheteroplasmic、2例がhomoplasmicなパターンであった。予後、臨床病理学的データとの相関はなかった。
本年度はさらに検索を進めた。食道内多発病変の検体より、2症例より5箇所、上皮内癌症例3例、から新たなDNAを抽出した。また、さらに新たに5症例からの血中、リンパ節、奇静脈からDNAを抽出し、上述の変異部位のみに対し、ミトコンドリアDNA変異の検索を行ったが、同様の変異、新たな変異は認めることができなかった。

報告書

(2件)
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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