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蛋白質の折りたたみ反応の階層的モデルの検証

研究課題

研究課題/領域番号 13780522
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関独立行政法人産業技術総合研究所 (2002)
東京大学 (2001)

研究代表者

新井 宗仁  独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 研究員 (90302801)

研究期間 (年度) 2001 – 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2002年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2001年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワード蛋白質 / フォールディング / モルテン・グロビュール状態 / 反応速度論 / 遷移状態 / 構造 / 蛋白質工学 / 生体高分子 / 蛋白質の構造・物性 / 安定性
研究概要

昨年度に引き続き、α-ラクトアルブミン(α-LA)のフォールディング反応における遷移状態の構造特徴づけを、Φ値解析法を用いて行った。今年度は特に、α-LAのβドメインやCヘリックス周辺に変異を導入した一アミノ酸置換体を多数作成し、α-LAの遷移状態の構造解析を行った。平衡条件下でのアンフォールディング測定の結果、変異体はどれも野生型より不安定化しており、Φ値解析に有効な試料であった。次に、ストップトフロー円二色性スペクトル法を用いてこれらの変異体の巻き戻り反応とアンフォールディング反応を測定し、Φ値を計算した結果、I89A, I89V, I55VについてはΦ=0.4〜0.6程度であったが、W60A, K93A, L96Aについては、Φ〜0となった。これらの結果は、I89, I55の周りは遷移状態において側鎖の密なパッキングが部分的に形成されているが、W60,K93,L96周辺は、遷移状態では側鎖の秩序化はまだ起きていないことを示している。
この2年間の研究結果を総合すると、α-LAの遷移状態の構造について次のような知見が得られた。(1)αドメイン内の側鎖は、天然状態様の密なパッキングをまだ形成していないが、(2)αドメインとβドメインの間、および、カルシウム結合部位近傍では、側鎖の密なパッキングが部分的に形成されている。ここで、モルテン・グロビュール(MG)状態においては、2つのドメイン間にあるCヘリックスが比較的安定なヘリックス構造を形成していることを考慮に入れると、α-LAのフォールディング反応は、MG中間体で形成され始めた構造が遷移状態に進むにつれて更に構造化していくという階層的な反応で記述できると結論づけることができる。

報告書

(2件)
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (11件)

  • [文献書誌] 新井 宗仁: "Fast Compaction of α-lactalbumin During Folding Studied by Stopped-Flow X-ray Scattering"Journal of Molecular Biology. 321(1). 121-132 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 桑島 邦博: "Two views of protein folding : what is the universal view?"蛋白質・核酸・酵素. 47(6). 657-662 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 桑島 邦博: "The use of the time-resolved X-ray solution scattering for studies of globular proteins"Spectroscopy. 16(3-4). 127-138 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 伊野部 智由: "Equilibrium and Kinetics of the Allosteric Transition of GroEL Studied by Solution X-ray Scattering and Fluorescence Spectroscopy"Journal of Molecular Biology. 327(1). 182-191 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 新井 宗仁: "Denaturation and Reassembly of Chaperonin GroEL Studied by Solution X-ray Scattering"Protein Science. 12(4). 672-680 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 新井 宗仁: "Testing the Relationship between Foldability and the Early Folding Events of Dihydrofolate Reductase from Escherichia coli"Journal of Molecular Biology. 328(1). 273-288 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 新井 宗仁: "Effects of the Difference in the Unfolded-State Ensemble on the Folding of Escherichia coli Dihydrofolate Reductase"Journal of Molecular Biology. (発表予定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 伊野部 智由: "The Allosteric Transition of GroEL induced by Metal Fluoride-ADP Complexes"Journal of Molecular Biology. (発表予定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 田之倉 優: "物理生化学"医学出版. 785 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Zhi-jie Qin: "Refolding of beta-lactoglobulin studied by stopped-flow circular dichroism at subzero temperatures"FEBS letters. 507. 299-302 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] 桑島邦博: "蛋白質フォールデイングの2つの描像:普遍的描像は可能か?"蛋白質・核酸・酵素. (in press). (2002)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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