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酵素タンパクの戦略的耐熱化・有機溶媒耐性化研究

研究課題

研究課題/領域番号 13836004
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物機能・バイオプロセス
研究機関信州大学

研究代表者

八森 章  国立大学法人信州大学, 繊維学部, 教授 (30082811)

研究分担者 内海 利男  新潟大学, 理学部, 教授 (50143764)
研究期間 (年度) 2001 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2003年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2002年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2001年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワード大腸菌 / 無機ピロフォスファターゼ / 熱安定性 / 有機溶媒耐性 / 部位特異的変異 / 枯草菌 / 好熱性細菌 / 部位特異的変異法 / 酵素 / タンパク / 耐熱性
研究概要

遺伝子工学的、タンパク質化学的、酵素学的手法を用いて、本研究により次のことを明らかにした
1)Family II PPase無機ピロフォスファターゼ(PPase)13種類に共通して存在するKKR配列(枯草菌PPaseでは295Kから297R)前2者のKKは触媒活性中心、特に基質認識に重要であることを明らかにした。また、3番目のRは基質が通過する通路の大きさを整えていると推定された。
2)Family II PPaseは2量体で存在し、サブユニットあたりマンガンイオン3分子が配位していることを明らかにした。
3)枯草菌PPaseの2つのドメイン(1-187、193-323)を結ぶヒンジ領域は機能発現に重要であり、189Gはその中でも特に重要な機能を有している。
4)Family I PPaseに属する好熱菌PPaseの12個のプロリン残基のうち外部環境接触面に存在するものは機能発現に何の影響ももっていないが、その他の残基はサブユニット間相互作用に多かれ少なかれ影響を有する。特に72番目のプロリンは6量体形成に決定的役割をもっており、その変異体は単量体でしか存在できない。
5)酵素タンパク質の安定性・有機溶剤耐性はタンパク分子の(1)外部親水性、(2)内部疎水性と充填性、(3)ヘリックス安定性、(4)サブユニット間相互作用に依存している。大腸菌PPaseの一次構造と、その一次構造が類似している7種の好熱菌PPaseの一次構造と比較し、7種の好熱菌PPaseに共通して保存されているが大腸菌PPaseでは異なっているアミノ酸残基を好熱菌型に置換し、タンパク質の安定化、有機溶剤耐性化向上を目指す事をめざした。
現在までF40K,Y57I,P74I,Q80L,S111Eの変異体を作製し、疎水クロマトグラフィーにより電気泳動的に単一な標品を得た。これら標品について酵素学的特性と、変異導入によるタンパクの高次構造に及ぼす影響を現在検討している

報告書

(4件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 2001 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (28件)

  • [文献書誌] Nomura, T., Hachimori, A, Uchiumi, T.et al.: "A point mutation in ribosomalprotein L7/L12 reduce its ability to form a compact dimmer structure and to assemble into GTPase center"Biochemistry. 42. 4691-4698 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishiyama, T., Hachimori, A., Uchiumi, T., Nakashima, N: "Structural elements in the internal ribosome entry site of Plautia stali intestine virus responsible for binding with ribosomes"Nucleic Acids Res.. 31. 2434-2442 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masuda, H., Uchiumi, T., Hachimori, A.: "Effects of replacement of prolines with alanines on the catalytic activity and thermostability of inorganic pyrophosphatase from thermophilic bacterium PS-3"J.Biochem.. 131. 53-58 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Honnma, S., Hachimori, A.: "Translation elogation by a hybrid ribsome in which proteins at the GTPase center of the Escherichia coli ribosome are replaced with rat counterparts"J.Biol.Chem.. 277. 3857-3862 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hachimori, A., Baykov, A.A., Lapti, R: "Quaternary structure and metal ion requirement of family 2 pyrophosphatase from B.subtilis, S.gordonii and S.mutans"J.Biol.Chem.. 276. 24511-24518 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shizawa, N., Uchiumi, T., Hachimori, A.: "Direct mutagenesis studies of the C-terminal fingerprint region of Bacillus subtilis pyrophosphatase"Eur.J.Biochem.. 268. 1-4 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nomura, T., Mochizuki, R., Dabbs, E.R., Shimizu, Y., Ueda, T., Hachimori, A., Uchiumi, T.: "A point mutation in ribosomalprotein L7/L12 reduce its ability to form a compact dimmer structureand to assemble into GTPase center."Biochemistry. 42. 4691-4698 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishiyama, T., Yamamoto, H., Shibuya, N., Hatakeyama, Y., Hachimori, A., Uchiumi, T., Nakashima, N.: "Structural elements in the internal ribosome entry site of Plautia stali intestine virus responsible for binding with ribosomes."Nucleic Acids Res.. 31. 2434-2442 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Masuda, H., Uchiumi, T., Wada, M., Ichiba, T., Hachimori, A.: "Effects of replacement of prolines with alanines on the catalytic activity and thermostability of inorganic pyrophosphatase from thermophilic bacterium PS-3."J.Biochem.. 131. 53-58 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Honnma, S., Nomura, T., Dabbs, E.R., Hachimori, A.: "Translation elogation by a hybrid ribsome in which proteins at the GTPase center of the Escherichia coli ribosome are replaced with rat counterparts."J.Biol.Chem.. 277. 3857-3862 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shimizu, T., Nakagaki, M., Nishi, Y., Kobayashi, Y., Hachimori, A., Uchiumi, T.: "Interaction among silkworm ribosomal proteins P1, P2 and P0 required for functional protein binding to the GTPase domain 28S rRNA."Nucleic Acids Res.. 30. 2620-2627 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Honma, S., Endo, Y., Hachimori, A.: "Ribosomal proteins at the stalk region modulate rRNA structures in the GTPase center."J.Biol.Chem.. 277. 41401-41409 (2002)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Parfenyev, A.N., Salminen, A., Halonen, P., Hachimori, A., Baykov, A.A., Lapti, R.: "Quaternary structure and metal ion requirement of family 2 pyrophosphatase from B. subtilis, S. gordonii and S. mutans."J.Biol.Chem.. 276. 24511-24518 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wada, M., Uchimi, T., Ichiba, T., Hachimori, A.: "Enhancement of the thermostability of thermophilic bacterium PS-3 PPase on substitution of Ser-89 with carboxylic amino acids."J.Biochem.. 129. 955-961 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shizawa, N., Uchiumi, T., Taguchi, J., Kisseleva, N.A., Baykov, A.A., Lahti, R., Hachimori, A.: "Direct mutagenesis studies of the C-terminal fingerprint region of Bacillus subtilis pyrophosphatase"Eur.J.Biochem.. 268. 1-4 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nomura, T., Hachimori, A., Uchiumi, T.et al.: "A point mutation in ribosomalprotein L7/L12 reduce its ability to form a compact dimmer structureand to assemble into GTPase center"Biochemistry. 42. 4691-4698 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Nishiyama, T., Hachimori, A., Uchiumi, T., Nakashima, N: "Structural elements in the internal ribosome entry site of Plautia stali intestine virus responsible for binding with ribosomes"Nucleic Acids Res.. 31. 2434-2442 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Masuda, H., Uchiumi, T., Hachimori, A.: "Effects of replacement of prolines with alanines on the catalytic activity and thermostability of inorganic pyrophosphatase from thermophilic bacterium PS-3"J. Biochem.. 131. 53-58 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Honnma, S., Hachimori, A.: "Translation elogation by a hybrid ribsome in which proteins at the GTPase center of the Escherichia coli ribosome are replaced with rat counterparts"J.Biol.Chem.. 277. 3857-3862 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hachimori, A., Baykov, A.A., Lapti, R: "Quaternary structure and metal ion requirement of family 2 pyrophosphatases from B. subtilis, S. gordonii, and S. mutans."J.Biol.Chem.. 276. 24511-24518 (2001)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Shizawa, N., Uchiumi, T., Hachimori, A: "Directed mutagenesis studies of the C-terminal fingerprint region of Bacillus subtilis pyrophosphatase"Eur.J.Biochem.. 268. 1-4 (2001)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Uchiumi T., Hachimori A.et al.: "Interaction among silkworm ribosomal proteins P1, P2 and P0 required for functional protein binding to the GTPase-associated domain of 28S rRNA"Nucleic Acids Res.. 30. 2620-2627 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Hachimori A.et al.: "Translation elongation by a hybrid ribosome in which proteins at the GTPase center of the Escherichia coli ribosome are replaced with rat counterparts"J. Biol. Chem.. 277. 3857-3862 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Uchiumi, T., Hachimori A.et al.: "Ribosomal proteins at the stalk region modulate functional rRNA structures in the GTPase center"J. Biol. Chem.. 277. 41401-41409 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.N.Parfenyev, A.Hachimori 他: "Quaternary structure and metal requirement of family II Pyrophosphatase from Bacillus subtilis, Streptococcus gordinii and streptoca mutans"J. Biol. Chem. 276. 24511-24518 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] M. Wada, A. Hachimori 他: "Enhancement of the thermostability of thermophilic bacterium PS-3 PPase on substitution of Ser-89 with Carboxylic amino acids"J. Biochem. 129. 955-961 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] N. Shizawa, A. Hachimori: "Directed mutagenesis studies of the c-terminal fingerprint region of Bacillus sublilis pyrophosphatase"Eur. J. Biochem. 268. 5771-5775 (2001)

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書
  • [文献書誌] Masuda, H, Hachimori, A: "Effects of replacement of Prolines with Alanines on the catalytic activity and thermostability of inorganic pyrophosphatase from thermophilic bacterium PS-3"

    • 関連する報告書
      2001 実績報告書

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公開日: 2001-04-01   更新日: 2016-04-21  

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