| 研究課題/領域番号 |
13F03026
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 外国 |
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| 研究分野 |
ケミカルバイオロジー
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
菅 裕明 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00361668)
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| 研究分担者 |
JONGKEES SEINO 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
JONGKEES Seino 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
JONGKEES Seino 東京大学, 大学院理学系研究科, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2015年度: 200千円 (直接経費: 200千円)
2014年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2013年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
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| キーワード | ペプチド / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / シアリダーゼ / 人口触媒 / 糖転移 / ペルチド / 人工触媒 |
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| 研究実績の概要 |
Jongkees 博士は、まず 3,5-dihydrophenylalanine をフレキシザイム(菅研が開発した人工
RNA 酵素)で tRNA の 3’末端にチャージし、さらに FIT システムによって効率よくペプチド鎖に取 り込まれることを確認した。その上で、開始 tRNA に N-chloroacetyl-L-Tyrosine(N-ClAc-L-Tyr) をフレキシザイムでチャージして翻訳を開始することで、下流のシスティン残基側鎖と反応しチ オエーテル結合で架橋された大環状ペプチドライブラリーを構築に成功した。
また、Jongkees 博士は T. cruzi 由来の His タグ化された trans-sialidase に対して大環 状特殊ペプチドのリガンド探索を進めた。このタンパク質は市販されていないが、Jongkees 博士 の Ph.D.スーパーバイザーであり且つ共同研究者である Steve Withers 教授(ブリティッシュコ ロンビア大)から提供を受けた。この標的を磁気ビーズに固定化する条件を最適化後、2種類の ライブラリーを用いてセレクションを進めた。ひとつは、通常の大環状特殊ペプチドライブラリ ーで、確実なリガンドを獲得することを目的とした。もうひとつは、Pancreatic α-amylase で 試みた上記の 3,5-dihydrophenylalanine 含有大環状ペプチドライブラリーを用いて、セレクショ ンを試みた。前者は、非常に良好なセレクションのプロファイルが得られ、ペプチドリガンドの 獲得に成功した。この特殊ペプチド数種類を共同研究者に送付し、その阻害活性の評価を行った 結果、阻害活性をもつ特殊ペプチドがみつかり、現在その詳細な機能解析と結晶線解析をおこな っている。一方、後者のライブラリーでは、標的に対する特異的な特殊ペプチド群の濃縮がなか なか高くならず、現状では満足いく結果になっていない。現在、条件の再検討を行い、再度活性 種の濃縮に挑んでいるところである。
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| 現在までの達成度 (段落) |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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