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ダイズゲノムリソースを利用したジュウロクササゲの長莢化遺伝子の解明と利用

研究課題

研究課題/領域番号 13F03514
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 育種学
研究機関国立研究開発法人農業生物資源研究所

研究代表者

友岡 憲彦  国立研究開発法人農業生物資源研究所, 多様性活用研究ユニット, ユニット長 (40373253)

研究分担者 KONGJAIMUN ALISA  国立研究開発法人農業生物資源研究所, 多様性活用研究ユニット, 外国人特別研究員
KONGJAIMUN Alisa  独立行政法人農業生物資源研究所, 多様性活用研究ユニット, 外国人特別研究員
KONGJAIMUN A.  独立行政法人農業生物資源研究所, 多様性活用研究ユニット, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2015年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2014年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2013年度: 100千円 (直接経費: 100千円)
キーワード栽培化遺伝子 / 長莢化遺伝子 / 種子大型化遺伝子 / 遺伝子単離 / ゲノムリソース / ファインマッピング / 栽培化 / QTL解析 / トランスクリプトーム / 莢長
研究実績の概要

ジュウロクササゲは、莢長が90cmに達するアジアのマメ科作物であり、莢長を長くした最も寄与率の高い原因遺伝子は第7連鎖群に座上するPdl7.1である。この遺伝子は、莢の長さだけでなく、種子サイズも顕著に大型化する興味深い遺伝子である。
この遺伝子を単離するために、昨年度作成した分子SSRマーカー312個のうち両親間で多型を示した25個を用いてファインマッピングを実施した。ファインマッピング用の莢長調査は、BC3F3世代の種子1536粒からSSR遺伝子型情報に基づいて選抜した160粒を温室栽培して行った。その結果、当初予想していなかった新たな情報を得ることができた。それは、Pdl7.1 の近傍にPsn7.1という莢の柔らかさに関与する遺伝子が座上していることに基づくものである。具体的には、Psn7.1の座の遺伝子型が栽培種型であると莢が柔らかくなるが、その場合Pdl7.1遺伝子が莢を長くする効果がより大きく表現型に寄与することが判明した。すなわち、これら2つの遺伝子間の相互作用によって、 従来行っていたQTL解析に基づくPdl7.1の推定座上位置が本来の位置より上方(マーカーcp7863の方向)にずれて推定されていたことが明らかになったのである。今後は、新たに推定されたPdl7.1の座上領域の間に新たにマーカーを設計するとともに、新たな組み換え個体を用いてPdl7.1遺伝子の単離に迫っていく必要があることが明らかになった。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2015

すべて 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)

  • [学会発表] Fine mapping and candidate gene prediction of pod length QTL pdl7.1+ in yardlong bean [Vigna unguiculata (L.) Walp. cv.-gr. Sesquipedalis2015

    • 著者名/発表者名
      Kongjaimun A, Ogiso-Tanaka E, Takahashi Y, Kaga A, Naito K, Somta P, Srinives P and Tomooka N
    • 学会等名
      The Joint Conference of ISSAAS 2015 International Congress and General Meeting and 118th Annual Meeting of the Japanese Society for Tropical Agriculture
    • 発表場所
      東京農業大学
    • 年月日
      2015-11-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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