| 研究課題/領域番号 |
13F03704
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 外国 |
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| 研究分野 |
ゲノム生物学
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| 研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
PLESSY Charles (2014) 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, ユニットリーダー (60391984)
PLESSY Charles (2013) 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, ユニットリーダー
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| 研究分担者 |
KRATZ Anton 独立行政法人理化学研究所, サイエンス技術基盤研究センター, 外国人特別研究員
クラッツ アントン 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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| 配分額 *注記 |
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2014年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2013年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
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| キーワード | CAGE / プルキンエ細胞 / CAGEscan / リボソーム・キャプチャー / トランスクリプトーム / トランストラトーム / ncRNA / library preparation / sequencing / immunofluorescence / mass-spectrometry / sample preparation |
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| 研究実績の概要 |
私たちはプルキンエ細胞内に存在するRNAを研究した。当該細胞は脳内の小脳と 呼ばれる部位に見られる神経細胞で、その役割の１つは体の動き を制御するこ とである。そのため、また、プルキンエ細胞は大型の細胞で発見しやすいことか ら、脳の可塑性を解明するための数々の研究の対象と なってきた。プルキンエ 細胞のシナプス内にリボソームが存在することが報告されたことを受け、当プロ ジェクトでは、これらのリボソームに関連 するRNAの特徴付けと定量化を目指し た。これらのリボソームがシナプス可塑性を制御するタンパク質の生成あるいは 翻訳自体に関連している可 能性があるためである。
私たちは理化学研究所脳科学総合研究センターLauney研究ユニットとの共同研究 により、リボソーム・キャプチャーと呼ばれる方法を用いて プルキンエ細胞内 のリボソームを選択的に標識化し、これらのリボソームと結合したRNAを収集し た。そして、収集したRNAを理化学研究所ラ イフサイエンス技術基盤研究セン ターが開発したCAGEscan法を用いて解析し、RNAの転写開始点を同定、その量を 計測し、構造の特性を 明らかにした。この方法により私たちはプルキンエ細胞 のための新たなRNAマーカーを発見し、当該リボソームと同時精製されたことか ら翻訳の 制御にかかわっている可能性のあるノンコーディングRNAを同定。この 研究結果は『Genome Research』誌に発表した（Kratz et al. , 2014）。
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| 現在までの達成度 (段落) |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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