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分子間距離測定に基づく脂質二重膜中アンフォテリシンB複合体の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 13J01527
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物分子科学
研究機関大阪大学

研究代表者

中川 泰男  大阪大学, 理学研究科, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードアンフォテリシンB / 固体NMR / 脂質二重膜 / 構造解析 / エルゴステロール / イオンチャネル / 表面プラズモン共鳴法 / 重水素化標識体
研究実績の概要

アンフォテリシンB (AmB)はその強力な抗カビ活性と耐性菌の出来にくい性質により、発見から50年以上経た現在でも深在性の真菌感染症治療薬として広く用いられている。AmBは、真菌細胞膜中でエルゴステロール(Erg)と共にイオン透過性チャネルを形成し生理活性を発現するといわれているが、ヒト細胞膜のコレステロールとも弱いながらも相互作用するため副作用を示す。このような薬理学的重要性にもかかわらず、AmB-Ergチャネル複合体の詳細な構造は明らかにはなっていない。そこで本研究では、近年、脂質膜中における構造解析法として注目されている固体NMRにより、複合体構造の全容を明らかにすることを目的とした。本研究により複合体構造が明らかになれば、よりErg選択性を高めた優れた薬の開発につながると期待される。
本年度は特に、昨年度までに合成したF-AmBと13C-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により分子間距離情報を取得することで、AmB-ErgおよびAmB-AmB二分子間の相互作用解析を行った。
まず、F-AmBおよび13C-Ergを用いたREDOR測定により平行型および反平行型で相互作用しているAmB-Ergの分子間距離をそれぞれ2点ずつ取得した。その分子間距離を制限情報とした分子力学計算により両者の結合様式を推定することに成功した。また、13C-AmBおよびF-AmBを用いたREDOR測定を行うことで3点のAmB同士の分子間距離情報を取得した。さらに、その分子間距離を満たすようにAmBを配置することでチャネル複合体中におけるAmB同士の相対配置の推定に成功した。
以上の実験から得られたAmB-ErgおよびAmB-AmBの相互作用を基に複合体の全体構造を推定することに成功した。本研究は脂質二重膜中で低分子が形成する複合体の構造を原子レベルで推定した初めての例であり、有機化学と固体NMRを組み合わせた本研究手法が膜環境下における分子間相互作用解析において有用な手法であることを示すことができた。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Axial Hydrogen at C7 Position and Bumpy Tetracyclic Core Markedly Reduce Sterol’s Affinity to Amphotericin B in Membrane2015

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, Y., Umegawa, Y., Nonomura, K., Matsushita, N., Takano, T., Tsuchikawa, H., Hanashima, S., Oishi, T., Matsumori, N., and Murata, M.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 54 号: 2 ページ: 303-312

    • DOI

      10.1021/bi5012942

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Effect of sterol side chain on ion channel formation by amphotericin B in lipid bilayers.2014

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, Y., Umegawa, Y., Takano, T., Tsuchikawa, H., Matsumori, N., and Murata, M.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 53 号: 19 ページ: 3088-3094

    • DOI

      10.1021/bi500122c

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Interactions of synthetic ergosterol analogues with amphotericin B toward understanding drug’s selective toxicity2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuo Nakagawa
    • 学会等名
      15th Tetrahedron Symposium
    • 発表場所
      London, UK
    • 年月日
      2014-06-24 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 分子間距離に基づく脂質二重膜に形成されるアンフォテリシンB複合体の構造解析2014

    • 著者名/発表者名
      中川 泰男
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2014-03-29
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Solid-state NMR-based structure elucidation of ion channel assembly for med by amphotericin B in lipid bilayers2013

    • 著者名/発表者名
      中川 泰男
    • 学会等名
      ・3rd Junior International Conference on Cutting-Edge Organic Chemistry in Asia
    • 発表場所
      生命の森リゾート(千葉県)
    • 年月日
      2013-11-23
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Solid-state NMR based analysis of interaction between amphotericin B and ergosterol in lipid bilayer2013

    • 著者名/発表者名
      中川 泰男
    • 学会等名
      ・Tetrahedron symposium Asia edition
    • 発表場所
      Soul, Korea
    • 年月日
      2013-10-22
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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