• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

大量遺伝情報解析による熱帯多雨林の葉圏菌相多様性と宿主樹木の遺伝的特性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 13J02516
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 森林科学
研究機関京都大学

研究代表者

伊津野 彩子  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2015年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2014年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2013年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード熱帯多雨林 / 葉圏菌類 / メタゲノム / 生物多様性 / 次世代シーケンサー / 多様性
研究実績の概要

菌類は地球上に510万種存在すると推定されているが、記載種は10万種に満たない。東南アジア熱帯域における菌相については、特に調査が遅れている。本研究では、メタゲノム解析を用い、熱帯多雨林の葉圏菌相の種多様性および群集構造を、効率的かつ網羅的に解明することを目的とした。
中央カリマンタンの植栽フタバガキ樹木に存在する葉圏菌類を対象にしたメタゲノム解析では、1樹木個体に由来する葉2.5 cm2から135種の菌類が検出され、その内の 94.6%は未記載種であった。また、菌類群集は一植栽林分内の数十メートルのスケールで異なることが示唆された。持続的な熱帯林管理に資する可能性のあるフタバガキ植栽林において未知の種多様性を明らかにし、新たな保全価値を付与することができた。
また、サケラート環境研究センター (タイ) の季節常緑林では、葉圏菌類の分布を3次元レベルで解明した。高さ40 mのタワーを用い、26種71個体の樹木を対象に19階層の高さから採取し、全144箇所の葉サンプルについて、サンプル毎に菌類群集を明らかにした。葉圏菌類の種多様性は、林床から林冠へと垂直高度が増すにつれて減少した。群集組成をサンプル間で比較したところ、林床部では様々な組成の菌類群集が見られる一方で、林冠部では近接する菌類群集は互いに類似しており、葉圏菌類の多様性は林床部において高いことが示された。尚、本成果に基づく学術論文は現在投稿中である。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 謝辞記載あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Gadjah Mada University(インドネシア)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] Sakaerat Environmental Research Station/Kasetsart University(タイ)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Zurich(スイス)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Structure of phyllosphere fungal communities in a tropical dipterocarp plantation: a massively parallel next-generation sequencing analysis2016

    • 著者名/発表者名
      Izuno A, Tanabe AS, Toju H, Yamasaki M, Indrioko S, Isagi Y
    • 雑誌名

      Mycoscience

      巻: 57 ページ: 171-180

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genome sequencing of Metrosideros polymorpha (Myrtaceae), a dominant species in various habitats in the Hawaiian Islands with remarkable phenotypic variations2016

    • 著者名/発表者名
      Izuno A, Hatakeyama M, Nishiyama T, Tamaki I, Shimizu-Inatsugi R, Sasaki R, Shimizu KK, Isagi Y
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: - 号: 4 ページ: 727-736

    • DOI

      10.1007/s10265-016-0822-3

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Development of microsatellite markers for the semi-natural grassland herb Veronicastrum japonicum (Plantaginaceae).2016

    • 著者名/発表者名
      Nakahama N, Izuno A, Arima K and Isagi Y.
    • 雑誌名

      Applications in Plant Sciences

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.3732/apps.1500096

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of novel microsatellite loci for the endangered orchid, Cypripedium japonicum (Orchidaceae)2016

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Y, Izuno A, Isagi Y, Kurosawa T, Kaneko S
    • 雑誌名

      Applications in Plant Sciences

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.3732/apps.1500097

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A quantitative analysis of phenotypic variations of Metrosideros polymorpha within and across populations along environmentalgradients on Mauna Loa, Hawaii.2015

    • 著者名/発表者名
      Tsujii Y., Onoda Y., Izuno A., Isagi Y., Kitayama K.
    • 雑誌名

      Oecologia

      巻: 180 号: 4 ページ: 1049-1059

    • DOI

      10.1007/s00442-015-3416-1

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Development of microsatellite markers for two endangered grassland butterflies, Melitaea ambigua and M. protomedia (Nymphalidae), using Ion Torrent next-generation sequencing2015

    • 著者名/発表者名
      Nakahama N, Izuno A, Arima K, Isagi Y
    • 雑誌名

      Conservation Genetics Resources

      巻: 印刷中 号: 2 ページ: 525-527

    • DOI

      10.1007/s12686-014-0412-4

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Current plantation practices have negligible genetic effects on planted dipterocarps in the tropical rainfores

    • 著者名/発表者名
      Izuno A, Indrioko S, Widiyatno, Prasetyo E, Kasmujiono, Isagi Y
    • 雑誌名

      Silvae Genetica

      巻: (出版中)(未定)

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 著しい形質多型で広域ニッチを優占するハワイフトモモのゲノム解析2016

    • 著者名/発表者名
      伊津野彩子, 畠山剛臣, 西山智明, 玉木一郎, 清水-稲継理恵, 清水健太郎, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第127回日本森林学会大会
    • 発表場所
      藤沢
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] クマガイソウ個体群の遺伝構造―断片化の遺伝的影響と種子繁殖の現状―2016

    • 著者名/発表者名
      山下由美, 伊津野彩子, 辻田有紀, 黒沢高秀, 井鷺裕司, 兼子伸吾
    • 学会等名
      第63回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤のゲノムワイド解析2016

    • 著者名/発表者名
      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 畠山剛臣, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 清水-稲継理恵, 清水健太郎, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第15回日本植物分類学会大会
    • 発表場所
      富山
    • 年月日
      2016-03-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ニューカレドニア産希少シソ科木本Oxera baladicaの集団遺伝構造―南北の分岐とその年代推定―2015

    • 著者名/発表者名
      成田あゆ, Gildas Gateble, 伊津野彩子, 陶山佳久, 永野惇, 手塚あゆみ, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第47回種生物学会シンポジウム
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2015-12-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムワイド解析に基づくハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤の解明2015

    • 著者名/発表者名
      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第79回日本植物学会大会
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2015-09-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クマガイソウ個体群の遺伝構造および繁殖様式の現状2015

    • 著者名/発表者名
      山下由美, 伊津野彩子, 辻田有紀, 黒沢高秀, 井鷺裕司, 兼子伸吾
    • 学会等名
      第79回日本植物学会大会,
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2015-09-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムワイドSNP解析に基づくハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤の解明2015

    • 著者名/発表者名
      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 内山憲太郎, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第62回日本生態学会大会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 年月日
      2015-03-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 熱帯樹種の実生における病害による負の密度効果と葉内菌群集の関係2015

    • 著者名/発表者名
      稲垣辰哉, Justin Schaffer, Elizabeth Arnold, Camilo Zalamea, Carolina Sarmiento, 伊津野彩子, 北島薫
    • 学会等名
      第62回日本生態学会大会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 年月日
      2015-03-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 小笠原諸島固有希少植物の比較保全遺伝学 I ―コヘラナレン・アサヒエビネ・シマカコソウ―2015

    • 著者名/発表者名
      成田あゆ, 成田智史, 中浜直之, 伊津野彩子, 田中健文, 小牧義輝, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第14回日本植物分類学会大会
    • 発表場所
      福島
    • 年月日
      2015-03-06 – 2015-03-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] The genetic bases of the variation in leaf traits of Metrosideros polymorpha uncovered by transcriptome and genomic sequencing2014

    • 著者名/発表者名
      Izuno A, Kitayama K, Ueno S, Nagano AJ, Onoda Y, Tsujii Y, Honjo MN, Kudoh H, Isagi Y
    • 学会等名
      Island Biology
    • 発表場所
      Honolulu
    • 年月日
      2014-07-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ハワイフトモモの葉形質多型における遺伝的基盤をRNA-seqにより解明する2014

    • 著者名/発表者名
      伊津野彩子, 上野真義, 永野惇, 小野田雄介, 辻井悠希, 北山兼弘, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • 学会等名
      第61回日本生態学会大会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-03-16
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ハワイフトモモの葉形質多型における生理的基盤―複数の環境因子に対するラミナとトライコームの個別的応答―2014

    • 著者名/発表者名
      辻井悠希, 小野田雄介, 伊津野彩子, 井鷺裕司, 北山兼弘
    • 学会等名
      第61回日本生態学会大会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-03-16
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Foliar fungi diversity in the tropical rainforest uncovered by massively parallel amplicon sequence analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Izuno A, Tanabe AS, Toju H, Yamasaki M, Indrioko S, Wach rinrat C, Kanzaki M, Isagi Y
    • 学会等名
      International Ecological Congress (INTECOL) 2013
    • 発表場所
      London, UK
    • 年月日
      2013-08-19
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi