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光化学系I複合体を中心とした電子伝達メカニズムの構造基盤解明

研究課題

研究課題/領域番号 13J03550
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物物理学
研究機関基礎生物学研究所 (2015)
大阪大学 (2013-2014)

研究代表者

河合(久保田) 寿子 (2014-2015)  基礎生物学研究所, 環境光生物学研究部門, 特別研究員(PD)

河合 寿子 (久保田 寿子) (2013)  大阪大学, たんぱく質研究所, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,320千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 720千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2013年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード光合成 / 光化学系I / X線結晶構造解析 / フェレドキシン / 複合体結晶 / 電子伝達 / 電子伝達複合体 / 光化学系 / photosystem / ferredoxin / PSI / Fd
研究実績の概要

X線結晶構造解析によりPSI-Fd複合体の構造を4.2A分解能で解き明かすことに成功した。その成果は以下の三点である。
1.PSI-Fd複合体の構造基盤解明:FdはPSIのPsaC、PsaE、PsaAと相互作用して複合体を形成していた。相互作用アミノ酸情報からFdの変異体を作製し、閃光分光法にてPSI-Fd間の電子伝達速度を測定することにより、これらのアミノ酸が生化学的にも重要であることを証明した。さらに、 [2H, 15N]ラベルしたガリウム(Ga)置換Fdを用いてNMRによるTCS法の解析を行い、結晶構造は溶液中での相互作用を反映していることを確認した。
2.PsaFピストンモデルの提唱:Fd結合前後のPSI構造をCαで重ね合わせ、RMSD値を算出した。その結果、Fd結合によりPSIの表在性蛋白質PsaCとEが三量体の外側に向かって移動していた。さらにその動きは隣接する膜貫通ヘリックスのPsaFへと連続し、最終的にはルーメン側まで到達していた。PsaFのN末端はPSIを還元するPcが結合するサブユニットであり、PSIはPsaFを介してチラコイド膜内外の電子伝達蛋白質結合情報を共有するというモデルを提唱した。
3.二分子アンテナモデルの提唱:PSI三量体には三分子のFdが結合しており、Ga異常散乱強度が強いFdほどPSIに接近していた。また、FdがPSIに結合することで三量体の境界面にあるPsaKと隣の分子のPsaBが互いに近寄る方向に移動していた。これによりPSI間の距離が縮まり、三量体間に於ける効率のよいエネルギー移動が可能になると考えられる。これらのことから、PSI三量体が協調して機能する二分子アンテナモデル、即ちPSI 三量体中でFdが最も強く結合しているPSIが電化分離を行い、残り二分子のPSIはアンテナとして機能して光エネルギーを供給するモデルを提唱した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (8件)

  • [国際共同研究] Ruhr-University Bochum(Germany)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] X-ray Structure and Nuclear Magnetic Resonance Analysis of the Interaction Sites of the Ga-Substituted Cyanobacterial Ferredoxin2015

    • 著者名/発表者名
      Mutoh Risa, Muraki Norifumi, Shinmura Kanako, Kubota-Kawai Hisako, Lee Young-Ho, Marc M. Nowaczyk, Matthias Rögner, Hase Toshiharu, Ikegami Takahisa, Kurisu Genji
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 54 号: 39 ページ: 6052-6061

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.5b00601

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Concentration-dependent oligomerization of cross-linked complexes between ferredoxin and ferredoxin-NADP+ reductase2013

    • 著者名/発表者名
      Kimata-Ariga Y, Kubota-Kawai H, Lee YH, Muraki N, Ikegami T, Kurisu G, Hase T.
    • 雑誌名

      Biochemical and biophysical research communications

      巻: Vol. 17 ページ: 867-872

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 光化学系I-フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム2015

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子、武藤梨沙、Pierre SETIF、Marc Nowaczyk、Matthias Rogner、池上貴久、田中 秀明、栗栖源嗣
    • 学会等名
      第15回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール
    • 年月日
      2015-06-24 – 2015-06-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系I-フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム2015

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子,武藤梨沙,Pierre SETIF, Marc Nowaczyk,Matthias Rogner,池上貴久,田中秀明,栗栖源嗣
    • 学会等名
      第15回 日本蛋白質科学会年会(ワークショップ口頭発表)
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県、徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系I-フェレドキシンの電子伝達複合体構造から読み解く電子伝達の動的メカニズム2015

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子,武藤梨沙,Pierre SETIF, Marc Nowaczyk,Matthias Rogner,池上貴久,田中秀明,栗栖源嗣
    • 学会等名
      第15回 日本蛋白質科学会年会(ポスター発表)
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県、徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Crystal Structure of Photosystem I from Synechocystis sp. PCC6803 at 5.1 A Resolution2015

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子、坂本由佳、和田元、田中秀明、栗栖源嗣
    • 学会等名
      日本化学会 第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学 理工学部
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系Iとフェレドキシンが形成する電子伝達複合体の構造基盤2014

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子、武藤梨沙、池上貴久、Marc Nowaczyk、Matthias Rogner、田中秀明、栗栖源嗣
    • 学会等名
      平成26年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東京大学 農学部
    • 年月日
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 光化学系Iとフェレドキシンが形成する電子伝達複合体の構造基盤2014

    • 著者名/発表者名
      河合(久保田)寿子、武藤梨沙、池上貴久、Marc Nowaczyk、Matthias Rogner、田中秀明、栗栖源嗣
    • 学会等名
      第5回日本光合成学会年会
    • 発表場所
      近畿大学 農学部
    • 年月日
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure of photosystem I from Synechocystis sp. PCC6803 at 5.1 Å resolution2013

    • 著者名/発表者名
      Hisako Kubota-Kawai, Hajime Wada, Genji Kurisu
    • 学会等名
      The 12^<th> Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      香港科技大學(中国)
    • 年月日
      2013-12-08
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Crystal Structure of Ga-substituted Ferredoxin and its interaction sites for Photosystem I and Ferredoxin-NADP+ reductase2013

    • 著者名/発表者名
      武藤梨沙、村木則文、河合(久保田)寿子、長谷俊治、池上貴久、栗栖源嗣
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • 年月日
      2013-10-29
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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