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3本鎖形成配列を拡張可能な新規人工ヌクレオシドの創製

研究課題

研究課題/領域番号 13J04516
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 化学系薬学
研究機関九州大学

研究代表者

岡村 秀紀  九州大学, 薬学府, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード3本鎖DNA / 人工核酸 / アンチジーン / CG障害部位 / TFO / 遺伝子発現制御 / 核酸化学 / 本鎖DNA / 機能性人工核酸 / 分子認識 / ゲノム標的分子 / 塩基対認識 / ミスマッチ認識 / 核酸合成
研究実績の概要

3本鎖DNAは、2本鎖DNAの主溝にもう1本のDNA鎖 (TFO) が配列特異的に結合することで形成される複合体であり、ゲノム標的技術への展開が期待される。しかし、その形成は2本鎖DNAの片方の鎖がプリン塩基 (A・G) のみで構成されるホモプリン領域に限定され、ピリミジン塩基 (T・C) が1つでも存在すると、障害部位として3本鎖DNAの安定性を顕著に低下させてしまう。このような背景のもと、申請者は、3本鎖DNA形成配列を拡張するための人工核酸の創製を目指した。
昨年度は研究計画通り、人工核酸の構造最適化(擬シチジン誘導体の開発)ならびに遺伝子発現阻害実験の予備検討を行った。これらの結果をもとに、今年度は、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOによる遺伝子発現阻害実験を検証した。標的遺伝子には、がん原遺伝子であるhTERTを選択した。hTERTプロモーター配列には、天然型ヌクレオシドでは認識できないCG障害部位が4ヵ所存在する。予備検討として、このhTERTプロモーター配列に対するTFOを設計し、3本鎖形成能を評価したところ、CG塩基対に対応する箇所にTを組み込んだTFOが3本鎖DNAを形成できないのに対し、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOが高い親和性をもって3本鎖を形成することを確認した。そこで、これらのTFOをHela細胞にトランスフェクションし、hTERT遺伝子の転写阻害効果を検証した。その結果、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOは、hTERT遺伝子のmRNA発現量を有意に減少させることを確認した。
以上の内容は、3本鎖形成配列を拡張した点、またTFOによる転写阻害効果を実証した点において、擬シチジン誘導体がゲノム標的技術の拡張に貢献できることを示す意義ある結果と考えられる。今後、本研究で開発された人工核酸が、医療やバイオテクノロジーへと展開されることを期待する。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] An Isocytidine Derivative with a 2-Amino-6-methylpyridine Unit for Selective Recognition of the CG Interrupting Site in an Antiparallel Triplex DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • 雑誌名

      ChemBioChem

      巻: 15 号: 16 ページ: 2374-2378

    • DOI

      10.1002/cbic.201402328

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] N-(Guanidinoethyl)-2'-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of a CG interrupting site for the formation of anti-parallel triplexes2013

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • 雑誌名

      Organic and Biomolecular Chemistry

      巻: 11 号: 23 ページ: 3918-3924

    • DOI

      10.1039/c3ob40472b

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Synthesis of novel pseudocytidine derivatives for the selective recognition of CG base pairs in triple-helix DNA2015

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      ハワイ
    • 年月日
      2015-12-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 3本鎖DNA中のCG塩基対を選択的に認識する擬シチジン誘導体の合成と機能評価2015

    • 著者名/発表者名
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • 学会等名
      第13回次世代を担う有機化学シンポジウム
    • 発表場所
      大津
    • 年月日
      2015-05-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] CG塩基対を選択的に認識する擬シチジン誘導体の合成と3本鎖形成能の評価2015

    • 著者名/発表者名
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • 学会等名
      日本薬学会第135年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-25 – 2015-03-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Specific recognition of CG base pairs by novel pseudo-cytidine derivatives in antiparallel DNA triplexes2014

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • 学会等名
      The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      北九州
    • 年月日
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] CG塩基対を選択的に認識可能な擬シチジン誘導体の合成と3本鎖形成能評価2014

    • 著者名/発表者名
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • 学会等名
      アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2014
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-09-08 – 2014-09-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Selective CG Base Pair Recognition by Pyrimidine Nucleoside Analogues in All Four Flanking Base Pairs within Antiparallel Triple Helix DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • 学会等名
      XXI Round Table on Nucleoside, Nucleotides and Nucleic Acids
    • 発表場所
      Poznan, Poland
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] N^2-Modified Isocytidine Derivatives for Selective CG Base Pair Recognition in the Triplex DNA2013

    • 著者名/発表者名
      岡村 秀紀
    • 学会等名
      3^<rd> Junior International Conference on Cutting- Edge Organic Chemistry in Asia
    • 発表場所
      生命の森リゾート(千葉県長生郡)
    • 年月日
      2013-11-24
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] CG 塩基対を選択的に認識するN^2-修飾イソシチジン誘導体の合成と3本鎖形成能評価2013

    • 著者名/発表者名
      岡村 秀紀
    • 学会等名
      第43回複素環化学討論会
    • 発表場所
      長良川国際会議場(岐阜県岐阜市)
    • 年月日
      2013-10-18
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] CG 塩基対を選択的に認識可能なN-修飾イソシチジン誘導体の合成と3本鎖形成能の評価2013

    • 著者名/発表者名
      岡村 秀紀
    • 学会等名
      第25回若手研究者のためのセミナー
    • 発表場所
      九州大学馬出キャンパス(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2013-08-24
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] N-(Guanidinoethyl)-2'-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of the CG inversion site for the formation of anti-parallel triplex DNA2013

    • 著者名/発表者名
      岡村 秀紀
    • 学会等名
      The First Asian Conference for "MONODUKURI" Strategy by Synthetic Organic Chemistry
    • 発表場所
      サザンビーチホテル&リゾート(沖縄県糸満市)
    • 年月日
      2013-07-18
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] CG 塩基対を選択的に認識可能なN-グアニジノエチルイソシチジンの合成と3本鎖形成能の評価2013

    • 著者名/発表者名
      岡村 秀紀
    • 学会等名
      第50回化学関連支部合同九州大会
    • 発表場所
      九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • 年月日
      2013-07-06
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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