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マルチオミクス解析によるクロマチンドメインレベルのエピジェネティック制御の解明

研究課題

研究課題/領域番号 13J04821
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生体生命情報学
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

野﨑 慎  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードクロマチン / ヌクレオソーム / 一分子イメージング / 超解像イメージング / ヒストン修飾 / ダイナミクス / イメージング / 一分子顕微鏡 / クロマチンドメイン
研究実績の概要

ヌクレオソームが不規則に折り畳まれることによって生じるクロマチンドメイン内部において,どのようにヌクレオソームがゆらいでいるのか,そしてそれがどのように遺伝子発現やDNA複製などの細胞機能と関連しているのかという問題を解決するために研究を行ってきた.2014年度までに,クロマチンの構造と動態を同時にライブセルで観察することができる1分子ヌクレオソームイメージング法の開発を行ってきた.2015年度は,1分子ヌクレオソームイメージング法を用いることで,生細胞におけるクロマチンの観察に取り組んだ.これまでに,トリコスタチンA (TSA)を用いたヒストンアセチル化の誘導によるクロマチンの変化を既に観察していたが,他にもクロマチン構造タンパク質であるコヒーシンのノックダウンや,核内の塩濃度の変化によっても大きく変化することを観察した.さらに,DRBなどの薬剤によって,細胞内における転写活性を低下させることによって,クロマチン自体の構造は変化しないが,その動態は大きく変化することを観察した.そして,ES細胞の分化過程において,クロマチンの構造と動態が変化することを観察した.これらの結果は,クロマチンの構造と動態の変化が,細胞の分化過程における転写活性などと関連していることを示唆している.1分子ヌクレオソームイメージング法の開発とそれを用いたクロマチンの観察に関する成果について,論文にまとめ,投稿を行った.

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] The physical size of transcription factors is key to transcriptional regulation in chromatin domains.2015

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima, Kazunari Kaizu, Sachiko Tamura, Tadasu Nozaki, Tetsuro Kokubo, Koichi Takahashi.
    • 雑誌名

      J. Phys.: Condens. Matter

      巻: 27 号: 6 ページ: 064116-064116

    • DOI

      10.1088/0953-8984/27/6/064116

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Single Nucleosome Imaging in Living Human Cells2014

    • 著者名/発表者名
      Tadasu Nozaki, Ryosuke Imai, Sachiko Tamura, Kazuhiro Maeshima.
    • 雑誌名

      CYTOLOGIA

      巻: 79 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1508/cytologia.79.1

    • NAID

      130004448261

    • ISSN
      0011-4545, 1348-7019
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chromatin as dynamic 10-nm fibers.2014

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima, Ryosuke Imai, Sachiko Tamura, Tadasu Nozaki.
    • 雑誌名

      Chromosoma

      巻: 123 号: 3 ページ: 225-237

    • DOI

      10.1007/s00412-014-0460-2

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Flexible and dynamic nucleosome fiber in living mammalian cells.2013

    • 著者名/発表者名
      Nozaki T, Kaizu K, Pack CG, Tamura S, Tani T, Hihara S, Nagai T, Takahashi K, Maeshima K.
    • 雑誌名

      Nucleus

      巻: 5 号: 5 ページ: 349-356

    • DOI

      10.4161/nucl.26053

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Visualization of chromatin structure and dynamics in living eukaryotic cells.2016

    • 著者名/発表者名
      野崎慎
    • 学会等名
      NIG International Symposium on Quantitative Biology
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所
    • 年月日
      2016-01-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Visualization of chromatin dynamics and domains in live mammalian cells.2015

    • 著者名/発表者名
      野崎慎
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Super-resolution imaging of chromatin domains in living mammalian cells.2014

    • 著者名/発表者名
      野崎慎,谷知己, 田村佐知子, 永井健治, 前島一博.
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(札幌)
    • 年月日
      2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Local structural similarity between interphase chromatin and mitotic chromosomes in living mammalian cells2013

    • 著者名/発表者名
      Nozaki T, Tani T, Tamura S, Nagai T, Maeshima K
    • 学会等名
      第51回生物物理学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2013-10-29
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 細胞のなかの「ゆらく」クロマチン2013

    • 著者名/発表者名
      野崎慎, 前島一博
    • 学会等名
      第65回細胞生物学会大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2013-06-20
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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