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TGF-β誘導性新規lincRNAの同定・解析

研究課題

研究課題/領域番号 13J05974
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 病態医化学
研究機関東京大学

研究代表者

荒瀬 麻友  東京大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワードlincRNA / TGF-β / apoptosis / EMT / non-coding RNA
研究実績の概要

本研究は、Transforming growth factor (TGF)-βによる腫瘍形成・悪性化における転写調節機構の解明を目的とし、以下の検討を行った。初年度までに、TGF-β誘導性新規lincRNAがTGF-βの抗アポトーシス作用を増強し、癌の悪性化に寄与している可能性を見出していた。
初年度の予備実験より、TGF-β誘導性新規lincRNAは、TGF-βによりEpithelial-mesenchymal transition (EMT:上皮間葉移行)が誘導される細胞において高発現していることが明らかになった。そのため、TGF-β誘導性新規lincRNAのEMTに対する影響を評価するために、TGF-β誘導性新規lincRNAが高発現しているマウス乳腺上皮細胞NMuMG細胞において、siRNAを用いてTGF-β誘導性新規lincRNAをノックダウンした。定量的RT-PCRおよびwestern blottingにより各種上皮マーカーや間葉系マーカーの発現変動を検討した結果、TGF-β誘導性新規lincRNAノックダウン群とコントロール群において顕著な差は認められなかった。また、phallodin染色によりアクチンストレスファイバーの形成を評価したところ、TGF-β誘導性新規lincRNAノックダウン群とコントロール群との差は観察されなかった。これまでの実験結果を論文としてまとめ、投稿・アクセプトされた。
TGF-β誘導性新規lincRNAのEMTに対する影響の評価の一環として、クロマチンの開閉の状態をTGF-β誘導性EMTの獲得前後で検討することにより、転写因子などのクロマチン作用部位、構造変化などの解析を試みた。その結果、TGF-β誘導性EMT獲得前後における各種EMT関連因子のクロマチン開閉変化や制御機構を見出した。現在論文としてまとめ、投稿準備中である。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Transforming growth factor-β-induced lncRNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer JygMC(A) cells2014

    • 著者名/発表者名
      Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 105 号: 8 ページ: 974

    • DOI

      10.1111/cas.12454

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] FAIRE-seq analysis of TGF-β-induced EMT in mouse mammary gland epithelial cells2015

    • 著者名/発表者名
      Arase M, Koinuma D, Isogaya K, Mizutani A, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K.
    • 学会等名
      the 4th international Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β family Signaling”
    • 発表場所
      つくば国際会議場 (茨城県つくば市)
    • 年月日
      2015-01-12 – 2015-01-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Transforming growth factor-β-induced long non-coding RNA-Smad7 (lncRNA-Smad7) inhibits apoptosis of mouse breast cancer JygMC(A) cells2014

    • 著者名/発表者名
      Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館 (京都府京都市)
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] TGF-β-induced long non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells2014

    • 著者名/発表者名
      Arase M, Ehata S, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
    • 学会等名
      第73回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Transforming growth factor-β-induced long non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells2014

    • 著者名/発表者名
      Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
    • 学会等名
      第14回東京大学生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学 (東京都文京区)
    • 年月日
      2014-04-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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