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無細胞翻訳系を用いたSecYEGトランスロコンの機能発現メカニズムの解析

研究課題

研究課題/領域番号 13J06852
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 構造生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

松林 英明  東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード無細胞翻訳系 / PURE system / SecYEG / タンパク質膜透過 / liposome / GUV / 1分子観察 / 全反射顕微鏡 / MPIase / YidC / LepB / SecDF / 膜透過反応の蛍光測定 / 無細胞翻訳系 PURE system / Liposome / SecYEGトランスロコン / 脂質 / 膜タンパク質複合体 / タンパク質膜挿入
研究実績の概要

昨年度までに、無細胞翻訳系によるSecYEGの再構築と、それに基づいて合成する膜タンパク質のliposome膜上でのトポロジー制御について成果をまとめ、論文発表と複数の学会での発表をすることができた。本年度は、さらに研究を発展させるべく、SecYEGの無細胞合成に必要な脂質組成の解析と、合成したSecYEGの1分子観察を行った。
脂質組成の解析について、昨年度までは脂質抽出物を用いた場合でしかSecYEGの活性がみられていなかったが、脂質の脂肪酸の条件検討により合成脂質で再構成することに成功した。脂質抽出物はGiant Unilamellar Vesicle (GUV)の作成などに適さなかったため、今回得られた結果により、人工細胞システムや膜タンパク質の試験管内進化への幅広い応用が期待できる。また、昨年度に見出された糖脂質様の分子について、微量な分子なために解析が難しかったが、岩手大学西山研究室との共同研究先で引き続き解析を行って頂いている。
SecYEGの膜透過活性について、基質の分泌タンパク質であるpOmpAのアミノ酸長を短くした場合に、再構成系においても膜透過のターンオーバーが検出された。詳細な速度論の解析を行うため東京大学野地研究室との共同研究で1分子観察に取り組んだ。まず、無細胞系によるSecY、SecEの蛍光標識と人工脂質平面膜上への再構成の条件を確立し、全反射顕微鏡によって観察したところ、SecYやSecEのサブユニットが単独で存在する場合も、純粋な脂質膜上では安定的に拡散することが初めて明らかになった。また、膜透過反応を観察するためpOmpAを蛍光標識して1分子観察を行ったが、脂質膜への非特異的な結合が見られた。条件検討を行ったものの、顕微鏡上に再構成する平面膜の不安定性もあり膜透過反応を解析するには至らなかったが、精製と再構成の煩雑さから1分子観察系の例が少ない膜タンパク質について、無細胞翻訳系の有用性を示す結果を得た。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2016 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (9件) (うち招待講演 1件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] In Vitro Synthesis of the E. coli Sec Translocon from DNA.2014

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda.
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition.

      巻: 53 号: 29 ページ: 7535-7538

    • DOI

      10.1002/anie.201403929

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Purified cell-free system as standard parts for synthetic biology. Current Opinion In Chemical Biology.2014

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Matsubayashi, Takuya Ueda.
    • 雑誌名

      Current Opinion In Chemical Biology.

      巻: 22 ページ: 158-162

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2014.09.031

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell-Free Synthesis of SecYEG Translocon as the Fundamental Protein Transport Machinery2014

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda.
    • 雑誌名

      Origins of Life and Evolution of Biospheres.

      巻: 44 号: 4 ページ: 331-334

    • DOI

      10.1007/s11084-014-9389-y

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 無細胞タンパク質合成系2014

    • 著者名/発表者名
      松林英明,上田卓也
    • 雑誌名

      高分子学会誌「高分子」

      巻: 63 ページ: 379-381

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 無細胞翻訳系によるSecYEGトランスロコンの合成と解析2016

    • 著者名/発表者名
      松林英明
    • 学会等名
      生化学若い研究者の会 関東支部 Biological Science Graduate Seminar
    • 発表場所
      御茶ノ水女子大学本館103会議室
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] In Vitro Synthesis of SecYEG Translocon2016

    • 著者名/発表者名
      松林英明
    • 学会等名
      ソフトマター若手勉強会
    • 発表場所
      東京大学検見川セミナーハウス
    • 年月日
      2016-03-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Cell-free synthesis of Sec translocon on liposome membrane2015

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda.
    • 学会等名
      Biophysical Society 59th Annual Meeting. Baltimore
    • 発表場所
      Baltimore Convention Center, Baltimore, Maryland, USA
    • 年月日
      2015-02-07 – 2015-02-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 無細胞翻訳系によるSecYEGトランスロコンの合成2014

    • 著者名/発表者名
      松林 英明、車 兪澈、上田 卓也
    • 学会等名
      第37回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県、横浜市、パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 無細胞翻訳系による SecYEG トランスロコンの合成2014

    • 著者名/発表者名
      松林 英明、車 兪澈、上田 卓也
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会
    • 発表場所
      北海道、札幌市、札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] In Vitro Synthesis of Sec Translocon from DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda.
    • 学会等名
      Open Questions on the Origin of Life 2014
    • 発表場所
      京都府、木津川市、国際高等研究所
    • 年月日
      2014-07-12 – 2014-07-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 膜タンパク質合成システム-Secトランスロコン-を創る2013

    • 著者名/発表者名
      松林英明
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会6.0
    • 発表場所
      鶴岡慶應義塾大学鶴岡タウンキャンパス
    • 年月日
      2013-11-14
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 無細胞タンパク質合成系を用いたSecYEGトランスロコンの構築2013

    • 著者名/発表者名
      松林英明
    • 学会等名
      第8回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      新潟新潟大学
    • 年月日
      2013-10-21
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] In vitro synthesis of Membrane Protein Machinery toward the Construction of Artificial Cell2013

    • 著者名/発表者名
      車ゆうてつ
    • 学会等名
      12th European Conference on Artificial Life (ECAL 2013)
    • 発表場所
      タオルミナ(イタリア)
    • 年月日
      2013-09-03
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 機能性細胞膜の合成に成功、人工細胞にむけて大きな一歩(東京大学 新領域創成科学研究科 ニュース)

    • URL

      http://www.k.u-tokyo.ac.jp/info/entry/22_entry315/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 機能性細胞膜の合成に成功、人工細胞にむけて大きな一歩(東工大ニュース)

    • URL

      http://www.titech.ac.jp/news/2014/028029.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 機能性細胞膜の合成に成功、人工細胞にむけて大きな一歩

    • URL

      http://www.k.u-tokyo.ac.jp/info/entry/22_entry315/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 機能性細胞膜の合成に成功、人工細胞にむけて大きな一歩

    • URL

      http://old.elsi.jp/ja/press_release/0623/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 上田卓也研究室ホームページ

    • URL

      http://park.itc.u_tokyo.ac.jp/molbio/

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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