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DNA結合親和性に寄与するGATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーの生理機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 13J07201
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 医化学一般
研究機関東北大学

研究代表者

長谷川 敦史  東北大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
2014年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2013年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
キーワード転写因子のシス配列嗜好性 / GATA1 / アミノ末端側亜鉛フィンガー / 表面プラズモン共鳴法 / トランスジェニックマウス / 大腸菌人工染色体
研究実績の概要

本研究では、GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガー(N-フィンガー)生理的役割をDNA結合能の観点から解析し、多様なDNA結合様式の選択的利用により調節される、GATA1標的遺伝子発現制御メカニズムを実証することを目的とした。
第一に、網羅的ChIP-Seq解析による血球系細胞ゲノム上でのDNA結合能を解析した。ゲノム全域の回文状GATA配列に対し、N-フィンガー変異GATA1において結合能低下傾向が認められることを、生物情報学的に明らかにした。また単一GATA配列と回文状GATA配列が隣接する領域では、単一GATA配列への正常な結合が保たれていることで、領域全体として結合能が低下しない傾向にあることが、新たに明らかとなった。この結果は、これまでのマウス解析で限定的ないくつかのGATA1標的遺伝子座において検出されたDNA結合特性を、ゲノムレベルにまで拡大して適用できることを意味する。
第二に、ルシフェラーゼレポーター解析による、DNA結合能の差異が転写活性化能に与える影響を解析した。回文状GATA配列を有するレポーター遺伝子をN-フィンガー変異GATA1により誘導した場合、GATA1の発現量および発現時間に依存したレポーター活性の上昇が、野生型GATA1により誘導した場合と比較して低下することがわかった。一方で単一GATA配列を有するレポーター遺伝子では、N-フィンガー変異GATA1であっても野生型GATA1と同等の転写活性化能を示すことがわかった。この結果は、多様なGATA配列に対しそれぞれ適切な結合様式が形成されることが、GATA1の転写活性化能を直接的に支えていることを意味する。
以上の知見は、これまでの生化学解析から得られたGATA1のDNA結合特性をより一般化し、マウス個体での標的遺伝子発現制御および血球分化制御の分子メカニズムと連結させる、重要な研究成果である。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2014 実績報告書
  • 2013 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Verification of the in vivo activity of three distinct cis-acting elements within the Gatal gene promoter-proximal enhancer in mice2013

    • 著者名/発表者名
      Shimizu R, Hasegawa A, Ottolenghi S, Ronchi A, Yamamoto M.
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 18(11) 号: 11 ページ: 1032-1041

    • DOI

      10.1111/gtc.12096

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] GATA1 N-フィンガーによるDNA結合様式調節が赤血球分化に果たす役割2014

    • 著者名/発表者名
      長谷川敦史, 金子寛, 中村正裕, 渡辺亮, 山本雅之, 清水律子
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都市 国立京都国際会館
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーによるDNA結合様式調節が赤血球分化に果たす役割2014

    • 著者名/発表者名
      長谷川敦史, 金子寛, 中村正裕, 渡辺亮, 山本雅之, 清水律子
    • 学会等名
      新学術領域研究「転写代謝システム」 平成26年度領域班会議
    • 発表場所
      仙台市 秋保温泉 岩沼屋
    • 年月日
      2014-07-11 – 2014-07-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーによるDNA結合親和性調節機構が赤血球分化に果たす役割2013

    • 著者名/発表者名
      長谷川 敦史, 清水 律子, 金子 寛, 山本 雅之
    • 学会等名
      日本生化学会東北支部 第79回例会・シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学 片平さくらホール
    • 年月日
      2013-05-11
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2014-01-29   更新日: 2024-03-26  

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