| 研究課題/領域番号 |
14014241
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| 研究種目 |
特定領域研究
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 審査区分 |
生物系
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| 研究機関 | 宮崎大学 (2004)
宮崎大学(医学部) (2002-2003) |
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研究代表者 |
林 哲也 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
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| 研究分担者 |
小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助手 (40363585)
大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助手 (50363594)
戸邉 亨 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教授 (70207596)
清水 徹 金沢大学, 大学院医学研究科, 教授 (80235655)
飯田 哲也 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (90221746)
中山 恵介 宮崎大学, 医学部, 助手 (10347057)
大西 真 宮崎医科大学, 医学部, 助教授 (10233214)
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| 研究期間 (年度) |
2002 – 2004
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| 研究課題ステータス |
完了 (2004年度)
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| 配分額 *注記 |
70,500千円 (直接経費: 70,500千円)
2004年度: 24,000千円 (直接経費: 24,000千円)
2003年度: 24,000千円 (直接経費: 24,000千円)
2002年度: 22,500千円 (直接経費: 22,500千円)
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| キーワード | 病原性大腸菌 / ウェルシュ菌 / 賜炎ビブリオ / 病原性 / ゲノム多様性 / 発現制御ネットワーク / 二成分制御系 / III型分泌系 / 腸炎ビブリオ / ゲノム / マイクロアレイ / 2成分制御系 / PCR |
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| 研究概要 |
病原性大腸菌・ウェルシュ菌・腸炎ビブリオを対象とした本研究の主な成果は以下の通りである。
1.大腸菌:(1)O157堺株のゲノム情報を基にマイクロアレイと全ゲノムPCRスキャンニング法を開発した。(2)両手法を用いてO157およびnon-O157タイプの腸管出血性大腸菌(EHEC)菌株の大規模比較ゲノム解析を行い、プロファージおよびISの変化を原動力とするO157 EHECのゲノム多様化の実体とメカニズムを明らかにした。また、non-O157 EHECにはO157と異なる菌株特異的配列が大量に存在することを明らかにした。(3)マイクロアレイ等を用いた発現解析により、RcsCDB二成分制御系を介したシグナル伝達と重炭酸塩応答が病原性の発現制御に関わること、これらの制御に関与するO157特異的制御因子としてGrvAとPchを発見し、本菌の病原性発現制御機構が大腸菌共通の環境応答システムに菌株特異的制御因子を組み込むことによって構築されていることを示した。(4)プロテオーム解析により、新たなIII型分泌系(TTSS)のエフェクターを多数発見し、さらにこれらのエフェクターを含む86種類のO157特異的な分泌・菌体表層蛋白質に対する抗体を作製した。
2.ウェルシュ菌:(1)strain 13の全ゲノム配列を決定した。(2)strain 13のゲノム配列を基に作成したマイクロアレイを用いた解析等により、VirR/S二成分制御系あるいはVirR/S-VR-RNA系によって制御される141遺伝子を同定し、本制御システムが病原性だけでなく、エネルギー産生系やアミノ酸・糖代謝系遺伝子群の制御を通じて菌の生体内での増殖にも関与することを明らかにした。(3)VirR結合配列のゲノムワイドな検索により、2種類の新規調節RNAを同定した。
3.腸炎ビブリオ:(1)RIMD2210633株の全ゲノム配列を決定した。(2)ゲノム解析から見出された2つのIII型分泌系(TTSS1,TTSS2)の機能解析を行い、TTSS1が細胞毒性に、またTTSS2は下痢原性に関与することを明らかにした。(3)各分泌系のエフェクターを数種類ずつ同定するとともに、それぞれが異なるエフェクターを分泌することを明らかにした。
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