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機能性ミニチュアRNAタンパク質複合体の構築

研究課題

研究課題/領域番号 14035226
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関京都大学

研究代表者

森井 孝  京都大学, エネルギー理工学研究所, 講師 (90222348)

研究分担者 牧野 圭祐  京都大学, 国際融合創造センター, 教授 (50159141)
研究期間 (年度) 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2002年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードタンパク質デザイン / RNA-タンパク質複合体 / ライブラリー / in vitroセレクション / リセプター / ファージ・ディスプレイ
研究概要

本年度の研究ではRNA・ペプチドサブユニット間、およびサブユニット・基質間の相互作用様式を基質の結合に協同的に働くように設計したRNA・ペプチドサブユニットから形成される機能性RNA・ペプチド複合体の設計と構築を行った。
リボヌクレオペプチド・リセプターはRNAをライブラリー化することによる機能化と、ペプチドサブユニットをライブラリー化することによる機能化の二つの機能化方法を同時または順次適用することが出来る。今回、ペプチドライブラリーを新たに作製してリボヌクレオペプチド・ライブラリーを作成し、ATP結合性リボヌクレオペプチド・リセプターのATP選択性を向上させることを目的とした。RevペプチドのN末端にランダム化した7アミノ酸を導入し、ファージディスプレイを作製した。7アミノ酸領域はS-S結合を形成することによりλファージのtail capsidに発現され、ループ構造をとることができる。このファージとRNAとの複合体を用いて、ATP/AMP選択性を上げることを指標にしてスクリーニングを行った。
Revペプチドを用いたリボヌクレオペプチド・ライブラリーのin vitro selectionから得られたRNA配列(UCUCGU-GUGUA-UGGGG-UA-UG-CU-GCGUUGG)を用いた場合、ランダムアミノ酸配列はFTPRDADに代表される類似配列が得られた。これらを用いたリボヌクレオペプチド複合体のATP結合活性はRevペプチドからなるリボヌクレオペプチド複合体と同等のものであったが、AMPに対する選択性およびdATPに対する選択性ははるかに高いものであった。この結果から、ペプチド・ライブラリーを用いることにより、リボヌクレオペプチド・リセプターの高機能化が行えることが明らかになった。

報告書

(1件)
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] T.Morii: "A General Strategy to Determine a Target DNA Sequence of Short Peptide : Application to a D-Peptide"J. Am. Chem. Soc.. 124. 180-181 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "A New Fluorescent Biosensor for Inositol Trisphosphate"J. Am. Chem. Soc.. 124. 1139-1140 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "Structure-Based Design of a Leucine Zipper Protein with New DNA Contacting Region"Biochemistry. 41. 2177-2183 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "In Vitro Selection of ATP-binding Receptors Using a Ribonucleopeptide Complex"J. Am. Chem. Soc.. 124. 4617-4622 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "Chemical Approach to Untangle the Sequence-Specific DNA Binding by Proteins"Chem-Eur. J.. 22. 5067-5071 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "Functional Reassembly of a Split PH Domain"J. Am. Chem. Soc.. 124(in press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2018-03-28  

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