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種形成の分子機構の総括

研究課題

研究課題/領域番号 14087101
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京工業大学

研究代表者

岡田 典弘  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60132982)

研究分担者 堀 道雄  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40112552)
澤村 京一  筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 講師 (90247205)
石田 直理雄  産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 生物時計グルーブ長 (00344234)
長谷部 光泰  大学共同利用機関法人, 基礎生物学研究所, 教授 (40237996)
荻原 保成  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 教授 (40185533)
小熊 譲  筑波大学, 生物科学系, 教授 (90114074)
舘田 英典  九州大学, 大学院・理学研究院, 教授 (70216985)
渡邉 正勝  東京工業大学, 助手 (90323807)
研究期間 (年度) 2002 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
52,800千円 (直接経費: 52,800千円)
2008年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2007年度: 6,300千円 (直接経費: 6,300千円)
2006年度: 11,400千円 (直接経費: 11,400千円)
2005年度: 4,800千円 (直接経費: 4,800千円)
2004年度: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円)
2003年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2002年度: 17,600千円 (直接経費: 17,600千円)
キーワードシクリッド / ビクトリア湖 / 種形成 / ショウジョウバエ / シロイヌナズナ / コムギ / 集団遺伝 / 多様化 / パンコムギ
研究概要

特定領域研究「種形成の分子機構」は「生物の多様性が如何にして獲得されたのか?」という生物学における最も大きな問題を分子レベルで解き明かしていく事を目標としてきた。この問題は進化論が発表されて以来、多くの研究者が興味を持ち続けてきたテーマでもあるが、実際の研究方法を見出すことにおいて困難を極めていた。そこで我々は植物から昆虫、脊椎動物など様々な生物種を用い、統合的な視点から種の分化という問題に取り組んできた。この研究領域は平成19年度には終了していたが、その研究成果の取りまとめのために、本年度も期間を延長して研究を実施した次第である。本年度において、我々はこれまでに研究を続けてきたヴィクトリア湖シクリッド研究に関して次その生態調査で集めた膨大なシクリッドの生体情報を体系的にまとめあげ、「ヴィクトリア湖南部のシクリッド-種形成の現場]としてカラー図版を出版した。この図版は生きた状態のシクリッドカラー写真が1000枚以上掲載され、総ページ数が250を超えており次可能な限りの情報を組み込んである。この図版はシクリッド研究者だけでなく多くの進化生物学者にとって重要な意味合いをもつだろう。また、我々の視覚研究の内容が2008年のNature誌に掲載され、さらには、News and Viewsにも紹介されるなど、本特定領域研究で実施してきたこれまでの研究を世界に向けて発信することができたのではないかと考えている。

報告書

(7件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2008 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (17件) 図書 (1件) 備考 (12件) 文献書誌 (12件)

  • [雑誌論文] Speciation of Drosophila : A Role for Clock Genes in the Timing of Species-specific Mating and Locomotor Behavior2006

    • 著者名/発表者名
      N.Ishida, I.Nishinokubi, M.Shimoda
    • 雑誌名

      Formosan Entomol. 26

      ページ: 227-234

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Mating rhythms of Drosophila : rescue of tim01 mutants by D.ananassae timeless2006

    • 著者名/発表者名
      I.Nishinokubi, M.Shimoda, N.Ishida
    • 雑誌名

      Journal of Circadian Rhythms 4:4

      ページ: 1-6

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Transposon-mediated gene trapping in zebrafish.2006

    • 著者名/発表者名
      Kotani, T., Nagayoshi, S., Urasaki, A., Kawakami, K.
    • 雑誌名

      Methods 39

      ページ: 447-462

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Establishing interspecific mosaic genome lines between Drosophila ananassae and Drosophila pallidosa by means of parthenogenesis.2006

    • 著者名/発表者名
      K.Sawamura, Y.Tomimura, H.Sato, H.Yamada, M.Matsuda, Y.Oguma
    • 雑誌名

      Genetical Researc 88

      ページ: 1-11

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Parallelism of amino acid changes at the RH1 affecting spectral sensitivity among deep-water cichlids from Lakes Tanganyika and Malawi.2005

    • 著者名/発表者名
      Sugawara, T., Terai, Y., Imai, H., Turner, G.F., Koblmuller, S., S
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA 102

      ページ: 5448-5453

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A population genetic model for lateral dimorphism frequency in fishes.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, M., Matsuda, H., Hori, M.
    • 雑誌名

      Population Ecology 47

      ページ: 83-90

    • NAID

      40006818465

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Simple synthesis of the major sex pheromone components of Drosophila ananassae and D. pallidosa.2005

    • 著者名/発表者名
      Morita, A., Matsuyama, S., Oguma, Y., Kuwahara, S.
    • 雑誌名

      Bioscience Biotechnology and Biochemistry 69

      ページ: 1620-1623

    • NAID

      130000030255

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Genome-wide Expression Analysis Reveals 100 Adrenal Gland dependent Circadian Genes in the Mouse Liver2005

    • 著者名/発表者名
      Oishi K., Amagai N., Shirai H., Kadota K., Ohkura N., Ishida N.
    • 雑誌名

      DNA Research 12

      ページ: 191-202

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A Role for Glycogen Synthase Kinase-3β in the Mammalian Circadian Clock2005

    • 著者名/発表者名
      Iitaka C., Miyazaki K., Akaike T., Ishida N.
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry 280

      ページ: 29397-29402

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The modified ABC model explains the development of the petaloid perianth of Agapanthus praecox ssp. orientalis (Agapanthaceae) flowers.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, T., Fukuda, T., Nakano, M., Hasebe, M., Kameya, T., Kanno, A.
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology 58

      ページ: 435-445

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural dynamics of cereal mitochondrial genomes as revealed by complete nucleotide sequencing of the wheat mitochondrial genome.2005

    • 著者名/発表者名
      Ogihara, Y., Yamazaki, Y., Murai, K., Kanno, A., Terachi, T., Shiina, T., Miyashita, N., Nasuda, S., Nakamura, C., Mori, N., Takumi, S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acid Research 33

      ページ: 6235-6250

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The evolution of genes for pigmentation in African cichlid fishes2004

    • 著者名/発表者名
      Ayano Sugie, Yohey Terai, Ryoko, Ota, Norihiro Okada
    • 雑誌名

      GENE 343/2

      ページ: 337-346

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Persistence and fluctuation of lateral dimorphism in fishes.2004

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, M., Matsuda, H., Hori, M
    • 雑誌名

      American Naturalis 163(5)

      ページ: 692-698

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Female mate recognition and sexual isolation depending on courtship song in Drosophila sechellia and its siblings2004

    • 著者名/発表者名
      Masatoshi Tomaru, Hirokazu Yamada, Yuzuru Oguma
    • 雑誌名

      Genes and Genetic Systems 79(3)

    • NAID

      130000062110

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Feeding is not a more potent Zeitgeber than the light-dark cycle in Drosophila2004

    • 著者名/発表者名
      Oishi K., Shiota M., Sakamoto K., Kasamatsu M., Ishida N
    • 雑誌名

      NeuroReport 15(4)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Characterization of MADS-box genes in charophycean green alga and its implication for the evolution of MADS-box genes.2004

    • 著者名/発表者名
      Tanabe^*, Y., Hasebe^*, M., Sekimoto, H., Nishiyama, T., Kitani, M., Henschel, K., Munster, T., Theissen, G., Nozaki, H., Ito, M.(^*both authors contributed equally)
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102

      ページ: 2436-2441

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Characterization and functional analysis of three wheat genes with homology to the CONSTANS flowering time gene in transgenic rice.2004

    • 著者名/発表者名
      Nemoto, Y., M.Kisaka, T.Fuse, M.Yano, Y.Ogihara
    • 雑誌名

      Plant J 36

      ページ: 82-93

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] ヴィクトリア湖南部のシクリッド-種形成の現場2008

    • 著者名/発表者名
      溝入真治、相原光人、岡田典弘(主執筆者)
    • 総ページ数
      273
    • 出版者
      工学図書株式会社
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.evolution.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://kawakami.lab.nig.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://ecol.zool.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://unit.aist.go.jp/brf/ci/research/group/ishida/index.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/evodevo

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pgenome.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.evolution.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://unit.aist.go.jp/brf/ci/research/group/ishida/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://pgenome.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://kawakami.lab.nig.ac.jp

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/evodevo

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://ecol.zool.kyoto-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [文献書誌] Terai Y., Morikawa N., Kawakami K., Okada N.: "The complexity of alternative splicing of hagoromo mRNA is increased in an explosively speciated lineage in East African cichlids"Proc Natl Acad Sci U S A.. 100. 12798-803 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kassam, D.: "Morphometric analysis on ecomorphologically equivalent cichlid species from Lake Tanganyika"Zoologica Science. 1-5 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] T Miyo, Y Oguma, B Charlesworth: "The comparison of intrinsic rates of increase among chromosome-substituted lines resistant and susceptible to organophosphate insecticides in Drosophila melanogaster"Jpn.J.Genet.. 78(5). 373-382 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Katsutaka Oishi, Koyomi Miyazaki, Koji Kadota, Reiko Kikuno, Takahiro Nagase, Gen-ichi Atsumi, Naoki Ohkura, Takashi Azama, Miho Mesaki, Shima Yukimasa, Hisato Kobayashi, Chisato Iitaka, Takashi Umehara, Masami Horikoshi, Takashi Kudo, Yoshihisa Shimizu, Masahiko Yano, Morito Monden, Kazuhiko Machida, Juzo Matsuda, Shuichi Horie, Takeshi Todo, Norio Ishida: "Genome-wide Expression Analysis of Mouse Liver Reveals CLOCK-regulated Circadian Output Genes"Journal of Biological Chemistry. 278. 41519-41527 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Nishiyama, T., Fujita, T., Shin-I, T., Seki, M., Nishide, H., Uchiyama, I., Kamiya, A., Carninci, P., Hayashizaki, Y., Shinozaki, K., Kohara, Y., Hasebe, M.: "Comparative genomics of Physcomitrella patens gemetophytic transcriptome and Arabidopsis thaliana : Implication for land plant evolution."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 100. 8007-8012 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ogihara, Y., K.Mochida, Y.Nemoto, K.Murai, Y.Yamazaki, T.Shin-I, Y.Kohara: "Correlated clustering and virtual display of gene expression patterns in the wheat life cycle by large-scale statistical analyses of expressed sequence tags."Plant Journal. 33. 1001-1011 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Terai, Y., Mayer, W., E.Klein, J.Tichy, H., Okada, N.: "The effect of selection on a long wavelength-sensitive (LWS) opsin gene of Lake Victoria cichlid fishes"Proc Natl Acad Sci USA. 99. 15501-15506 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Takahashi, T., Hori, M., Nakaya, K.: "Cyprichromis sonatus, a new species of the Tanganyikan cichlid fish"Copeia. 4. 1029-1036 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] H.Yamada, M.Matsuda, Y.Oguma: "Genetics of sexual isolation based on courtship song between two sympatric species : Drosophila ananassae and D.pallidosa"Genetica. 116. 225-237 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Inoue S, Shimoda M, Nishinokubi I, Siomi M, Okamura M, Nakamura A, Kobayashi S, Ishida N, Siomi H: "A role for the Drosophila fragile x-related gene in circadian output"Curr.Biol.. 12. 1331 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ishikawa, H., Ueno, Y., Semiarti, E., Onouchi, H., Kojima, S., Tsukaya, H., Hasebe, M., Soma, T., Ikezaki, M., Machida, C., Machida, Y.: "The ASYMMETRIC LEAVES2 gene of Arabidopsis thaliana, required for formation of a symmetric flat leaf lamina, encodes a member of a novel family of proteins characterized by cysteine repeats and a leucine zipper"Plant Cell Phys. 43. 467-478 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuoka, Y., Y.Yamazaki, Y.Ogihara, K.Tsunewaki: "Whole chloroplast genome comparison of rice, maize, and wheat : Implications for chloroplast gene diversification and phylogeny of cereals"Molecular Biology and Evolution. 19. 2084-2091 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2025-11-17  

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