• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

半導体表面を利用した分子認識機構の解明とバイオエレクトロニクスへの応用

研究課題

研究課題/領域番号 14205007
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 表面界面物性
研究機関東北大学

研究代表者

庭野 道夫  東北大学, 電気通信研究所, 教授 (20134075)

研究分担者 石井 久夫  東北大学, 電気通信研究所, 助教授 (60232237)
木村 康男  東北大学, 電気通信研究所, 助手 (40312673)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
54,600千円 (直接経費: 42,000千円、間接経費: 12,600千円)
2004年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
2003年度: 17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円)
2002年度: 28,080千円 (直接経費: 21,600千円、間接経費: 6,480千円)
キーワードDNA / ハイブリダイゼーション / 赤外分光法 / バイオエレクトロニクス / 細胞 / アポトーシス / 半導体表面 / 分子認識 / DNAチップ / 脂質分子 / 生体機能
研究概要

本研究の目的は、半導体表面上に構造制御された有機薄膜を形成し、それに吸着する生体分子や高分子の吸着状態を赤外分光法で検知することにより、分子認識機能を持たせることを目的とした。
先ず、DNAやタンパク質、細胞などは、水の変角振動モードと同じ波数領域に吸収ピークをもつために、通常の水の替わりに重水を用いる必要があった。重水を用いると一部の官能基で重水素置換が起こるため、従来のデータベースを活用できない。そのため、第一原理計算等の結果をも利用し、新たな赤外振動のデータベースを構築した。その結果、(1)赤外分光によるDNAの相補対形成の高感度検出、(2)Si表面上に固定したDNAの相補対形成過程の解明に成功した。ハイブリダイゼーション反応に伴うスペクトル変化を第一原理計算と比較することにより、塩基のC=O伸縮振動モードが大きく影響を受けることが明らかになった。さらに、DNA検出の高感度化のために、(3)溶液中のDNAの電気泳動法を確立し、印加電圧によりDNA分子は効率よくSi表面上に引き寄せられ、吸収強度も桁違いに増強することが確かめられた。このとき引き寄せられたDNA分子は、浮遊状態の場合と異なる赤外吸収スペクトルを示した。この変化は、DNA分子の塩基部がプロトン化することによることが判明した。プロトン化は溶液のpH濃度の変化で起こることが報告されているが、われわれは電極表面の電気化学反応でもこの反応が促進されることを初めて明らかにした。また、(4)ナノ構造を用いたDNAの高感度検出とDNA弁別法の確立も試み、DNAが固定されたポーラスシリコンやポーラスアルミナなどの多孔質薄膜を用いてもDNAハイブリダイゼーション反応が見地できることを示した。さらに、(5)細胞の機能解析法の研究にも着手し、計画された細胞死として注目されている「アポトーシス」を、赤外分光法を用いて解析し、細胞死に至るまでの細胞内の化学状態の変化を追跡することに成功した。現在この研究をさらに発展させている。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (18件) 文献書誌 (12件)

  • [雑誌論文] Label-free detection and classification of DNA by surface vibration spectroscopy in conjugation with electrophoresis2005

    • 著者名/発表者名
      Ko-ichiro Miyamoto
    • 雑誌名

      Applied Physics Letter 86

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Label-free detection and classification of DNA by surface vibration spectroscopy in conjugation with electrophoresis2005

    • 著者名/発表者名
      Ko-ichiro Miyamoto
    • 雑誌名

      Applied Physics Letter Vol.86

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Adsorption of naphthalene on a Si(100)-2 x 1 surface investigated by infrared spectroscopy2005

    • 著者名/発表者名
      K.Okamura et al.
    • 雑誌名

      Surface Science 576

      ページ: 45-55

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Oxidation of the hydrogen terminated silicon surfaces by oxygen plasma investigated by in-situ infrared spectroscopy2005

    • 著者名/発表者名
      M.Shinohara et al.
    • 雑誌名

      Thin Solid Films 475

      ページ: 128-132

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Label-free detection and classification of DNA by surface vibration spectroscopy in conjugation with electrophoresis2005

    • 著者名/発表者名
      K.Miyamoto et al.
    • 雑誌名

      Applied Physics Letters 86

      ページ: 53902-53903

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Investigation of formation processes of an anodic porous alumina film on a silicon substrate2004

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Shiraki
    • 雑誌名

      Applied Surface Science 237

      ページ: 369-373

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Investigation of formation processes of an anodic porous alumina film on a silicon substrate2004

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Shiraki
    • 雑誌名

      Applied Surface Science Vol.237

      ページ: 369-373

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Investigation of formation processes of an anodic porous alumina film on a silicon substrate2004

    • 著者名/発表者名
      H.Shiraki et al.
    • 雑誌名

      Applied Surface Science 237

      ページ: 369-373

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Adsorption of cata-condensed aromatics on a Si(100)-2 x 1 surface investigated by infrared absorption spectroscopy2004

    • 著者名/発表者名
      K.Okamura et al.
    • 雑誌名

      Applied Surface Science 237

      ページ: 439-443

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Plasma oxidation process of silicon surfaces investigated by infrared spectroscopy2003

    • 著者名/発表者名
      M.Shinohara et al.
    • 雑誌名

      Journal of Advanced Oxidation Technologies 8

      ページ: 41-46

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] DETECTION OF DNA HYBRIDIZATION ON POROUS BY INFRARED SPECTROSCOPY : APPLICATION TO BIOSENSING

    • 著者名/発表者名
      Ryo-taro Yamaguchi
    • 雑誌名

      Proceedings of 2004 Joint International Meeting of The Electrochemical Society (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 顕微赤外分光法によるポーラスシリコン表面上におけるDNA分子の検出

    • 著者名/発表者名
      山口僚太郎
    • 雑誌名

      表面化学 (投稿中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 多重内部反射型赤外吸収分光法によるDNAハイブリダイゼーションの液中その場観察

    • 著者名/発表者名
      宮本浩一郎
    • 雑誌名

      表面化学 (投稿中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In-situ, real-time infrared spectroscopy study of formation of porous anodic alumina on Si

    • 著者名/発表者名
      Yasuo Kimura
    • 雑誌名

      The Journal of The Electrochemical Society (submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DETECTION OF DNA HYBRIDIZATION ON POROUS BY INFRARED SPECTROSCOPY : APPLICATION TO BIOSENSING

    • 著者名/発表者名
      Ryo-taro Yamaguchi
    • 雑誌名

      Proceedings of 2004 Joint International Meeting of The Electrochemical Society (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of DNA molecules on porous Si surfaces by infrared spectromicroscopy

    • 著者名/発表者名
      Ryo-taro Yamaguchi
    • 雑誌名

      Journal of The Surface Science Society of Japan (Submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In-situ observation of DNA hybridization in aqueous solution by infrared absorption spectroscopy in the multiple internal reflection geometry

    • 著者名/発表者名
      Ko-ichiro Miyamoto
    • 雑誌名

      Journal of The Surface Science Society of Japan (Submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] In-situ, real-time infrared spectroscopy study of formation of porous anodic alumina on Si

    • 著者名/発表者名
      Yasuo Kimura
    • 雑誌名

      The Journal of Electrochemical Society (Submitted)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 庭野道夫: "半導体表面における水素の挙動-赤外分光解析-"Journal of Vacuum Society of Japan (真空). 46・8. 600-606 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Satoshi Ogawa: "Carrier injection characteristics in Organic Field Effect Transistors Studied by Displacement Current Measurement"Japanese Journal of Applied Physics. 42. L1275-L1273 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara et al.: "Behavior of hydride species on Si surface during methane plasma irradiation investigated by in-situ infrared spectroscopy"Thin Solid Films. 435. 13-18 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara et al.: "Interaction of hydrogen-terminated Si(100), (110), and (111) surfaces with hydrogen plasma investigated by in situ real-time infrared absorption spectroscopy"Journal of Vacuum Science & Technology A. 21・1. 25-31 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 渡辺隼人: "Si(100)表面上のベンゼン分子吸着過程"表面科学. 24・2. 98-104 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 木村康男: "多重内部反射型赤外吸収分光法によるシリコン表面の電気化学エッチング過程の"その場"観察"表面科学. 25・2. 82 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 渡辺 隼人: "Si(100)表面上のベンゼンの分子吸着過程"表面科学. 24. 36-42 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara: "Interaction of hydrogen-terminated Si(100), (110), and (111) surfaces with hydrogen plasma investigated by in situ real-time infrared absorption spectroscopy"Journal of Vacuum Science and Technology. A21. 25-31 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara: "Formation and decomposition of Si hydrides during adsorption of Si_2H_6 onto Si(100)(2×1)"Physical Review B. 65. 075319-1-075319-7 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara: "Infrared spectroscopy study of adsorption of silane on Si(001)"Surface Science. 502-503. 96-101 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Masanori Shinohara: "Infrared Reflection Spectroscopic Investigation of Adsorption of SiH_x(CH_3)_<4-x> on Si surfaces"Electronics and Communications in Japan Part 2. 85. 59-65 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 庭野 道夫: "半導体表面・界面反応の赤外分光観察"応用物理. 71. 1143-1147 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

URL: 

公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi