アジア地域の新興腸管感染症の分子疫学的研究

• 研究課題/領域番号: 14256004
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 海外学術
• 研究分野: 細菌学(含真菌学)
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 西渕 光昭 京都大学, 東南アジア研究所, 教授 (50189304)
• 研究期間 (年度): 2002 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 33,410千円 (直接経費: 25,700千円、間接経費: 7,710千円); 2004年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2003年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円); 2002年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
• キーワード: アジア / 分子疫学 / コレラ / 腸炎ビブリオ / 大腸菌O157 / 新型腸炎ビブリオ / O139型コレラ菌 / MLST法 / DNAフィンガープリント / ベンガル / バングラディッシュ / 新興感染症 / 世界的大流行 / コレラ菌

研究概要

新型腸炎ビブリオによる患者が多発したタイとベトナムで分離した菌株のDNAファインガープリントをパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)法により比較解析した。タイでは二枚貝中の菌株が現地で感染症の原因となっていることを示す証拠が得られ、ベトナムではO3:K6血清型以外にO1:K25型などが順次出現したことが明らかになった。アジア各地で分離した代表的新型腸炎ビブリオ60菌株の系統関係を明らかにするため、11種類の遺伝子の塩基配列を連結し、系統解析を行った。その結果、近年流行し始めているO4:K68やO1:KUTなどについても新型O3:K6と同じグループに分類されることを確認した。また新型O3:K6菌株の祖先型菌株ではないかと考えられる菌株が見つかった。
マレーシアの魚介類から分離したctx^+コレラ菌20菌株を解析したところ、うち15菌株が新型(O139型)コレラ菌であった。これらの菌株と周辺国(インド・バングラデッシュ)および海外旅行者から分離されたctx^+コレラ菌株をPFGE法-dendrogram解析を行ない、マレーシアの新型菌株は2つのグループに分けられ、ベンガル地域から別々の時期に伝播したと結論した。新型を含む79菌株について、5種の遺伝子の塩基配列をmultilocus sequence typing法で比較し、PFGE法で推定した新型コレラ菌の伝播経路を支持する結果が得られた。
大腸菌O157はアジアの環境中に広く分布することを示唆する結果が得られた。しかし環境株の相当部分が志賀毒素タイプ2(Stx2)を微量しか産生せず、それはQ遺伝子周辺部のDNA塩基配列変化が関係していることを明らかにした。このことと日本以外のアジア地域で患者が少ないことと関係があるのではないかと考えられる。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of new O3:K6 strains and phylogenetically related strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in Taiwan and other countries. (2005)
  • 著者名/発表者名: Wong, H.C., et al.
  • 雑誌名: J.Appl.Microbiol. 98・3 ページ: 572-580
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The promoter region rather than its downstream inverted repeat sequence is responsible for low-level transcription of the thermostable direct hemolysin-related hemolysin (trh) gene of Vibrio parahaemolyticus. (2005)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 48・4 ページ: 319-927
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of new O3:K6 strains and phylogenetically related strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in Taiwan and other countries. (2005)
  • 著者名/発表者名: Wong, H.C., et al.
  • 雑誌名: J.Appl.Microbiol. 98(3) ページ: 572-580
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The promoter region rather than its downstream inverted repeat sequence is responsible for low-level transcription of the thermostable direct hemolysin-related hemolysin (trh) gene of Vibrio parahaemolyticus. (2005)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 48(4) ページ: 319-327
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The promoter region rather than its downstream inverted repeat sequence is responsible for low-level transcription of the thermostable direct hemolysin-elated hemolysin (trh) gene of Vibrio parahaemolyticus. (2005)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 48・4 ページ: 319-327
• [雑誌論文] Infection by a new clone of Vibrio parahaemolyticus : an infectious disease that emerged in Asia and spread to a world wide pandemic (2004)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: Ecological Destruction, Health, and Development : Advancing Asian Paradigms. (H.Furukawa, M.Nishibuchi, Y.Kono, and Y.Kaida (ed)) (Kyoto University Press/Trans Pacific Press, Kyoto) ページ: 251-263
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Phenotypic and genotypic characteristics of ctx^+ strains of Vibrio cholerae isolated from seafood in Malaysia and the significance of the strains in epidemiology. (2004)
  • 著者名/発表者名: Chen, C.-H., et al.
  • 雑誌名: Appl.Environ.Microbiol. 70・4 ページ: 1964-1972
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Prevalence of potentially pathogenic Vibrio species in the seafood marketed in Malaysia. (2004)
  • 著者名/発表者名: Elhadi, N., et al.
  • 雑誌名: J.Food Prot. 67・7 ページ: 1469-1475
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Emergence and serovar transition of Vibrio parahaemolyticus pandemic strains isolated during a diarrhea outbreak in Vietnam between 1997 and 1999. (2004)
  • 著者名/発表者名: Chowdhury, A.et al.
  • 雑誌名: Microbiol.Immunol. 48・4 ページ: 319-327
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of pathogenic Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical sources in Spain and comparison with Asian and North American pandemic isolates. (2004)
  • 著者名/発表者名: Martinez-Urtaza J, et al.
  • 雑誌名: J Clin Microbiol. 42・10 ページ: 4672-4678
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Pandemic strains of O3:K6 Vibrio parahaemolyticus in the aquatic environment of Bangladesh. (2004)
  • 著者名/発表者名: Islam, M.S., et al.
  • 雑誌名: Can.J.Microbiol. 50・10 ページ: 827-834
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Rapid detection of tdh and trh mRNAs of Vibrio parahaemolyticus by the transcription-reverse transcription concerted (TRC) method. (2004)
  • 著者名/発表者名: Masuda, N., et al.
  • 雑誌名: J.Biosci.Bioeng. 98・4 ページ: 236-243
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Rapid and specific detection of tdh, trh1, and trh2 mRNA of Vibrio parahaemolyticus using transcription-reverse transcription concerted (TRC) reaction with an automated system. (2004)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: J.Clin.Microbiol. 42・9 ページ: 236-243
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Infection by a new clone of Vibrio parahaemolyticus : an infectious disease that emerged in Asia and spread to a world wide pandemic. (2004)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: Ecological Destruction, Health, and Development : Advancing Asian Paradigms(H.Furukawa, M.Nishibuchi, Y.Kono, Y. aida (ed))(Kyoto University Press/Trans Pacific Press, Kyoto) ページ: 251-263
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Phenotypic and genotypic characteristics of ctx^+ strains of Vibrio cholerae isolated from seafood in Malaysia and the significance of the strains in epidemiology. (2004)
  • 著者名/発表者名: Chen, C.-H., et al.
  • 雑誌名: Appl.Environ.Microbiol. 70(4) ページ: 1964-1972
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Prevalence of potentially pathogenic Vibrio species in the seafood marketed in Malaysia. (2004)
  • 著者名/発表者名: Elhadi, N., et al.
  • 雑誌名: J.Food Prot. 67(7) ページ: 1469-1475
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Emergence and serovar transition of Vibrio parahaemolyticus pandemic strains isolated during a diarrheaoutbreak in Vietnam between 1997 and 1999. (2004)
  • 著者名/発表者名: Chowdhury, A. et al.
  • 雑誌名: Microbiol.Immunol. 48(4) ページ: 319-327
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of pathogenic Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical sources in Spain and comparison with Asian and North American pandemic isolates. (2004)
  • 著者名/発表者名: Martinez-Urtaza J, et al.
  • 雑誌名: J Clin Microbiol. 42(10) ページ: 4672-4678
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Pandemic strains of O3:K6 Vibrio parahaemolyticus in the aquatic environment of Bangladesh. (2004)
  • 著者名/発表者名: Islam, M.S., et al.
  • 雑誌名: Can.J.Microbiol. 50(10) ページ: 827-834
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Rapid detection of tdh and trh mRNAs of Vibrio parahaemolyticus by the transcription-reverse transcription concerted (TRC) method. (2004)
  • 著者名/発表者名: Masuda, N., et al.
  • 雑誌名: J.Biosci.Bioeng. 98(4) ページ: 236-243
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Rapid and specific detection of tdh, trh1,and trh2 mRNA of Vibrio parahaemolyticus using transcription-reverse transcription concerted (TRC) reaction with an automated system. (2004)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: J.Clin.Microbiol. 42(9) ページ: 236-243
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Emergence and serovar transition of Vibrio parahaemolyticus pandemic strains isolated during a diarrhea outbreak in Vietnam 1997 and 1999. (2004)
  • 著者名/発表者名: Chowdhury, A. et al.
  • 雑誌名: Microbiol.Immunol. 48・4 ページ: 319-327
• [雑誌論文] Characterization of pathogenic Vibrio parahaemolyticus isolates from clinical sources in Spain and comparison with Asian and North American pandemic isolates. (2004)
  • 著者名/発表者名: Mertinez-Urtaza J, et al.
  • 雑誌名: J Clin Microbiol. 42・10 ページ: 4672-4678
• [雑誌論文] Prevalence and serodiversity of the pandemic clone among the clinical strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in southern Thailand (2003)
  • 著者名/発表者名: Laohaprertthisan, V.et al.
  • 雑誌名: Epidemiol.Infect. 130 ページ: 1-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Gene sequence analysis of seafood-borne Vibrio pathogens and its application. (2003)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: Recent Advances in Marine Biotechnology Vol.10 Molecular Genetics of Marine Organisms. (Science Publishers, Inc., Enfield, New Hampshire, and Plymouth) 10 ページ: 33-85
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Vibrio parahaemolyticus (2003)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: International Handbook of Foodborne Pathogens. (J.Bier and M.D.Miliotis (ed.)) (Marcel Dekker, Inc., New York.) ページ: 237-252
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] 腸炎ビブリオ感染症:アジアで重要な海産物由来のビブリオ感染症 (2003)
  • 著者名/発表者名: 西渕光昭
  • 雑誌名: 日食微誌 20(4) ページ: 156-160
  • NAID: 10012189022
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The urease gene cluster of Vibrio parahaemolyticus does not influence the expression of the thermostable direct hemolysin (TDH) gene or the TDH-related hemolysin gene (2003)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: Microbiol.Immunol. 47(3) ページ: 233-239
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Adaptive and inflammatory immune responses in patients infected with strains of Vibrio parahaemolyticus (2003)
  • 著者名/発表者名: Qadri, F., et al.
  • 雑誌名: J.Infect.Dis. 187 ページ: 1085-1096
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Application of polymerase chain reaction for detection of Vibrio parahaemolyticus associated with tropical seafoods and coastal environment (2003)
  • 著者名/発表者名: Dileep, V., et al.
  • 雑誌名: Lett.Appl.Microbiol. 36 ページ: 423-427
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Vibrio parahaemolyticus O3:K6 inseafood and the coastal environment in Japan (2003)
  • 著者名/発表者名: Hara-Kudo Y, et al.
  • 雑誌名: Appl.Environ.Microbiol. 69(7) ページ: 3883-3891
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Incidence of Salmonella spp.In raw vegetables in Selangor, Malaysia. (2003)
  • 著者名/発表者名: Salleh, N.A., et al.
  • 雑誌名: Food Control 14 ページ: 475-479
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Isolation and molecular characterization of Listeria monocytogenes and Listeria innocua from poultry meat. (2003)
  • 著者名/発表者名: Lesley, M., et al.
  • 雑誌名: ASEAN Food Journal 12 ページ: 89-102
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Prevalence and serodiversity of the pandemic clone among the clinical strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in southern Thailand (2003)
  • 著者名/発表者名: Laohaprertthisan, V. et al.
  • 雑誌名: Epidemiol.Infect. 130 ページ: 1-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene sequence analysis of seafood-borne Vibrio pathogens and its application. (2003)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: Recent Advances in Marine Biotechnology Vol.10 Molecular Genetics of Marine Organisms(Science Publishers, Inc., Enfield, New Hampshire, and Plymouth) 10 ページ: 33-85
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Vibrio parahaemolyticus (2003)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: International Handbook of Foodborne Pathogens(J.Bier, M.D.Miliotis(ed.))(Marcel Dekker, Inc., New York) ページ: 237-252
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Vibrio parahaemolyticus infection : an important seafood-derived vibrio infection in Asia (article in Japanese) (2003)
  • 著者名/発表者名: Nishibuchi, M.
  • 雑誌名: Jpn.J.Food Microbiol. 20(4) ページ: 156-160
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The urease gene cluster of Vibrio parahaemolyticus does not influence the expression of the thermostable direct hemolysin(TDH) gene or the TDH-related hemolysin gene. (2003)
  • 著者名/発表者名: Nakaguchi, Y., et al.
  • 雑誌名: Microbiol.Immunol. 47(3) ページ: 233-239
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Application of polymerase chain reaction for detection of Vibrio parahaemolyticus associated with tropical seafoods and coastal environment. (2003)
  • 著者名/発表者名: Dileep, V., et al.
  • 雑誌名: Lett.Appl.Microbiol. 36 ページ: 423-427
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Vibrio parahaemolyticus O3:K6 inseafood and the coastal environment in Japan. (2003)
  • 著者名/発表者名: Hara-Kudo Y, et al.
  • 雑誌名: Appl.Environ.Microbiol. 69(7) ページ: 3883-3891
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The toxR gene of Vibrio anguillarum-not a virulence regulator but a good tool for diagnosis. (2003)
  • 著者名/発表者名: Okuda, J., et al.
  • 雑誌名: Fisheries Science 68 ページ: 1109-1112
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Incidence of Salmonella spp. In raw vegetables in Selangor, Malaysia. (2003)
  • 著者名/発表者名: Salleh, N.A., et al.
  • 雑誌名: Food Control. 14 ページ: 475-479
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Clinical, epidemiologic, and socioeconomic analysis of an outbreak of Vibrio parahaemolyticus in Khanh Hoa province, Vietnam. (2002)
  • 著者名/発表者名: Tuyet, D.T.et al.
  • 雑誌名: J.Infect.Dis. 186 ページ: 1615-1620
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Intercalation activating fluorescence DNA probe and its application to homogenous quantification of a target sequence by isothermal sequence amplification in a closed vessel. (2002)
  • 著者名/発表者名: Ishiguro, T., et al.
  • 雑誌名: Anal.Biochem. 314 ページ: 77-86
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The toxR gene of Vibrio anguillarum : not a virulence regulator but a good tool for diagnosis. (2002)
  • 著者名/発表者名: Okuda, J., et al.
  • 雑誌名: Fisheries Science 68 ページ: 1109-1112
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Nishibuchi, M.: "Vibrio parahaemolyticus"In J.Bier and M.D.Miliotis(ed.), International Handbook of Foodborne Pathogens. Marcel Dekker, Inc., New York.. 237-252 (2003)
• [文献書誌] Nishibuchi, M.: "Gene sequence analysis of seafood-borne Vibrio pathogens and its application."Recent Advances in Marine Biotechnology Vol.10 Molecular Genetics of Marine Organisms.Science Publishers, Inc., Enfield, New Hampshire, and Plymouth. 10. 33-85 (2003)
• [文献書誌] Nishibuchi, M.: "Infection by a new clone of Vibrio parahaemolyticus : an infectious disease that emerged in Asia and spread to a world wide pandemic"In H.Furukawa, M.Nishibuchi, Y.Kono, Y.Kaida(ed), Ecological Destruction, Health, and Development : Advancing Asian Paradigms. Kyoto University Press/Trans Pacific Press, Kyoto. 251-263 (2004)
• [文献書誌] 西渕光昭: "腸炎ビブリオ感染症:アジアで重要な海産物由来のビブリオ感染症"日食微誌. 20(4). 156-160 (2003)
• [文献書誌] Nakaguchi, Y., et al.: "The urease gene cluster of Vibrio parahaemolyticus does not influence the expression of the thermostable direct hemolysin (TDH) gene or the TDH-related hemolysin gene"Microbiol.Immunol.. 47(3). 233-239 (2003)
• [文献書誌] Qadri, F., et al.: "Adaptive and inflammatory immune responses in patients infected with strains of Vibrio parahaemolyticus"J.Infect.Dis.. 187. 1085-1096 (2003)
• [文献書誌] Dileep, V., et al.: "Application of polymerase chain reaction for detection of Vibrio parahaemolyticus associated with tropical seafoods and coastal environment"Lett.Appl.Microbiol.. 36. 423-427 (2003)
• [文献書誌] Hara-Kudo Y, et al.: "Vibrio parahaemolyticus O3:K6 inseafood and the coastal environment in Japan"Appl.Environ.Microbiol.. 69(7). 3883-3891 (2003)
• [文献書誌] Tuyet, D.T.et al.: "Clinical, epidemiologic, and socioeconomic analysis of an outbreak of Vibrio parahaemolyticus in Khanh Hoa province, Vietnam"J. Infect. Dis.. 186. 1615-1620 (2002)
• [文献書誌] Laohaprertthisan, V. et al.: "Prevalence and serodiversity of the pandemic clone among the clinical strains of Vibrio parahaemolyticus isolated in southern Thailand"Epidemiol. Infect.. 130. 1-12 (2003)